| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 805,137 | G→T | 5.3% | S731S (TCC→TCA) ‡ | PP_0693 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 805,137 | 0 | G | T | 5.3% | 245.3 / 2.8 | 76 | S731S (TCC→TCA) ‡ | PP_0693 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/35); new base T (2/2); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.81e-01 | |||||||||||
GTTGTCCTGATCGGCACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGTCAGGGCTTCGTCGG > NC_002947/804993‑805282 | gttgtCCTGATCGGCACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGa < 6:346801/147‑1 (MQ=255) cTGATCGGCACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTgg < 5:170497/148‑1 (MQ=255) tGATCGGCACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTTCCAACCTgga > 4:14772/1‑147 (MQ=255) aTCGGCACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTTCCAACCTggaaa < 3:14772/148‑4 (MQ=255) cACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGTCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTGCAGGTTGGAAACCTGGCGCttgttg < 4:135537/149‑1 (MQ=255) cACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCttgttg < 4:267101/149‑1 (MQ=255) cACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCttgttg < 4:169128/149‑1 (MQ=255) aCTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGa > 3:181749/1‑149 (MQ=255) tctGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGAtc > 7:170556/1‑149 (MQ=255) aGGTCGATGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCTGCGACAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGtt < 3:228897/149‑1 (MQ=255) aGGTCGAAGAGCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTCCTGTCCGGCACTTTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTGCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGt < 8:258085/148‑1 (MQ=255) gTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTg > 8:261066/1‑148 (MQ=255) gTCGAAGACCGACAGGCTTTCGCCTTATTCGTACTGGCCGGCACTCTGGATAATCTGGTCAATGTGCTTGAGCGCTTCATTGTTCGGCCCCAGTACCACTCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCAGGCGCTTGTTGATCTCACGGTTg > 1:278970/1‑148 (MQ=255) gAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGTAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTg < 1:106004/145‑1 (MQ=255) gAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTg > 2:106004/1‑145 (MQ=255) gAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGaa > 2:155930/1‑147 (MQ=255) aGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAgg < 7:261066/149‑1 (MQ=255) aCCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGc > 7:274406/1‑149 (MQ=255) ccGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGcc < 4:181749/149‑1 (MQ=255) cGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGc > 2:303660/1‑147 (MQ=255) tttCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGc > 5:260889/1‑149 (MQ=255) cGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCttgttg > 2:56603/1‑116 (MQ=255) cGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCttgttg < 1:56603/116‑1 (MQ=255) gCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTc > 1:171161/1‑147 (MQ=255) cGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTc < 6:260889/148‑1 (MQ=255) gTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAgg < 8:277429/142‑1 (MQ=255) gTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAgg > 7:277429/1‑142 (MQ=255) gTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCg < 8:170556/148‑1 (MQ=255) tACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCg > 6:158545/1‑147 (MQ=255) tGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGTAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTc < 7:140768/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTc > 7:126835/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTc > 2:129201/1‑149 (MQ=255) tgGATAATCTGGTCGATGTGCTTTAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTAGCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGTTACGTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCTGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGtt < 2:278970/149‑1 (MQ=255) gATAATCTTGTAGATGTTCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCAAGTACCACGAGGAAGCTTTCCAGGTTGGAATCCTGGCGCTTGTTGATCTAGCTGTTGAACAGGGCCAGGTg < 6:49486/114‑1 (MQ=255) gATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTgc > 5:31512/1‑149 (MQ=255) gATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGATGATCTCGCGGTTGAACAGAGCCAGcag > 5:49486/1‑112 (MQ=255) aTAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCt < 4:84140/82‑1 (MQ=255) aTAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCt > 3:84140/1‑82 (MQ=255) tCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTcg > 6:63833/1‑89 (MQ=255) tCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTcg < 5:63833/89‑1 (MQ=255) gATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGGTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCgg < 2:123926/148‑1 (MQ=255) aTGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGc < 8:274406/149‑1 (MQ=255) tgtgCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGc > 3:214930/1‑148 (MQ=255) cTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGt > 3:343239/1‑149 (MQ=255) gAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCg < 8:126835/148‑1 (MQ=255) gcTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGAc < 1:303660/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCg > 6:178829/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAGACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGAAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAgcgc > 7:222419/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAg < 8:34399/72‑1 (MQ=255) gTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAg > 7:34399/1‑72 (MQ=255) cAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCt > 8:147026/1‑149 (MQ=255) tACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCggg < 4:252755/116‑1 (MQ=255) tACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCggg > 3:252755/1‑116 (MQ=255) tACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTgg < 1:129201/149‑1 (MQ=255) cACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGcc > 6:228269/1‑148 (MQ=255) cACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGcc > 4:33276/1‑148 (MQ=255) aCGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGcc > 3:165860/1‑147 (MQ=255) cgcgGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAg < 5:158545/149‑1 (MQ=255) cgcgGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAg < 2:171161/149‑1 (MQ=255) cgGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGt < 7:147026/149‑1 (MQ=255) ggAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGt > 4:223622/1‑148 (MQ=255) gCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGGACAGGGCCAGCTGGTGCTGGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTg > 2:311898/1‑136 (MQ=255) gCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGGACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTg < 1:311898/136‑1 (MQ=255) gCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGTCAggg < 5:228269/149‑1 (MQ=255) tttCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGTCAGGGCt > 2:22293/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGTCAGGGCtt > 4:176364/1‑149 (MQ=255) gccAGGTTTCCAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGt < 2:224589/125‑1 (MQ=255) gccAGGTTTCCAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGt > 1:224589/2‑126 (MQ=255) cAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCGTTGGCCAAGGTCAGGGCTtcgt < 3:33276/149‑1 (MQ=255) aGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAg < 6:46867/135‑1 (MQ=255) aGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAg > 5:46867/1‑135 (MQ=255) ggTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGc < 3:41279/97‑1 (MQ=255) ggTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGc > 4:41279/1‑97 (MQ=255) ggTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGTCAGGGCTtcgtcg < 4:214930/149‑1 (MQ=255) gTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGTCAGGGCTTCGTCgg > 4:198300/1‑149 (MQ=255) gTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGTCAGGGCTTCGTCgg > 5:124948/1‑149 (MQ=255) | GTTGTCCTGATCGGCACTCTGGGTCAGGTCGAAGACCGACAGGGTTTCGCCTTCTTCGTACTGGCCGGCACTGTGGATAATCTGGTCGATGTGCTTGAGCGCTTCCTTGTTCGGCGCCAGTACCACGCGGAAGCTTTCCAGGTTGGAAACCTGGCGCTTGTTGATCTCGCGGTTGAACAGGGCCAGCTGGTGCTCGAGGCTGTCGTAGTCGCTGCGGATGTTGCGCAGGGTTCGGGCGATGTCGGTGACCGCAGCGCGGCGTGCCTTGGCCAAGGTCAGGGCTTCGTCGG > NC_002947/804993‑805282 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |