| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,120 | A→T | 6.0% | L421* (TTG→TAG) ‡ | trmF ← | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,120 | 0 | A | T | 6.0% | 202.6 / 3.0 | 66 | L421* (TTG→TAG) ‡ | trmF | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/30); new base T (2/2); total (34/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.38e-01 | |||||||||||
GCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGTTGA > NC_002947/2976‑3267 | gcgcAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAgg < 1:175035/148‑1 (MQ=255) gcAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCATTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGAGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTa > 8:82517/1‑148 (MQ=255) gAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCa < 7:299700/149‑1 (MQ=255) gAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGCCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCA‑GGTACTCGGCACCCGAGGTAAACATGCGTTACAGCTCCTGACTACCCAAGGAAAt > 6:69710/1‑147 (MQ=255) cGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGgtc < 1:19900/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGATTACCTTGGGTACTCAggagccgta < 2:25932/149‑8 (MQ=255) ccAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTcca > 7:164491/1‑149 (MQ=255) cATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGAGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGcc > 7:93055/1‑148 (MQ=255) aTCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCaa < 2:273285/120‑1 (MQ=255) aTCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGa > 4:258684/1‑149 (MQ=255) aTCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGa > 3:322437/1‑149 (MQ=255) aTCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGGCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCaa > 1:273285/1‑120 (MQ=255) gATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATg > 8:87184/1‑148 (MQ=255) tCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTGGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGAt > 6:174532/1‑145 (MQ=255) tCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTGGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGAt < 5:174532/145‑1 (MQ=255) ggCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGcc < 8:337473/149‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCACCTGATTACCTTGGGTACTCAgga > 7:36436/1‑121 (MQ=255) gCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCACCTGATTACCTTGGGTACTCAgga < 8:36436/122‑2 (MQ=255) cccAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCtc > 2:35783/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCtcg > 3:335115/1‑149 (MQ=255) ttCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCCCCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgc > 8:127176/1‑149 (MQ=255) ttCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgc > 4:219515/1‑149 (MQ=255) aCGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCATCGTcgcgg > 1:273286/1‑149 (MQ=255) aCGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggc > 6:341782/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCAGTCGCAGGGCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCAc < 8:93055/148‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTg > 4:91364/1‑149 (MQ=255) aGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTc < 2:273286/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGc < 1:35783/149‑1 (MQ=255) gTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCt > 5:281097/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTgcg < 7:82517/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTgcg < 6:281097/149‑1 (MQ=255) gTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATTAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGa < 8:17344/148‑1 (MQ=255) tCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGaa < 8:164491/148‑1 (MQ=255) ttCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTg > 8:255596/1‑149 (MQ=255) cgcgCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGt < 3:258684/146‑1 (MQ=255) cgcAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTgcggc < 4:322437/149‑1 (MQ=255) aGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGtt < 3:219515/149‑1 (MQ=255) tCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTc > 1:130355/1‑149 (MQ=255) tCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTc > 5:264012/1‑149 (MQ=255) gCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCg > 4:136924/1‑149 (MQ=255) gCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCg > 3:214524/1‑149 (MQ=255) cc‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCAc > 8:318414/1‑116 (MQ=255) cc‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCAc < 7:318414/116‑1 (MQ=255) gTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGt < 5:302803/137‑1 (MQ=255) gTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCca < 7:87184/149‑1 (MQ=255) gTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTACTCAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGGCGATGTATGCCTCGTCGAGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCATCCGCCCGAAGTCCGGCGTTAgatccgaa > 6:302803/1‑140 (MQ=255) cTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCcagc < 7:255596/148‑1 (MQ=255) tCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggcgcgg < 4:279957/95‑1 (MQ=255) ggCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCcagcag < 6:264012/147‑1 (MQ=255) aCGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCt > 2:19594/1‑149 (MQ=255) gcgAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTgg < 4:214524/149‑1 (MQ=255) aTGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGcttc < 5:69710/149‑1 (MQ=255) aTGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGcttc > 2:269258/1‑149 (MQ=255) gTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGt < 3:267775/110‑1 (MQ=255) gTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGt > 4:267775/1‑110 (MQ=255) ggCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTAccc > 8:297014/1‑149 (MQ=255) gaccTGATTACCTTGGGTACTCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATATATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCgg > 6:1701/3‑149 (MQ=255) cTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCgg < 3:136924/149‑1 (MQ=255) tCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCggt > 7:275607/1‑149 (MQ=255) ccTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCggtg > 3:162141/1‑149 (MQ=255) cTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCggtg < 4:162141/148‑1 (MQ=255) gAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGcc > 4:93983/1‑79 (MQ=255) gAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGcc < 3:93983/79‑1 (MQ=255) cccAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGtt < 5:106868/149‑1 (MQ=255) cccAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGt < 2:130355/148‑1 (MQ=255) ccAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGgc > 3:204086/1‑118 (MQ=255) ccAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGgc < 4:204086/118‑1 (MQ=255) cAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGTTGa > 7:88345/1‑149 (MQ=255) | GCGCAGAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCAGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGTTGA > NC_002947/2976‑3267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |