| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,470,045 | C→G | 8.1% | C33S (TGT→TCT) ‡ | algK ← | alginate biosynthesis protein AlgK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,470,045 | 0 | C | G | 8.1% | 221.2 / 7.6 | 71 | C33S (TGT→TCT) ‡ | algK | alginate biosynthesis protein AlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/34); new base G (3/3); total (34/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGTC > NC_002947/1469903‑1470188 | ggTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCgg < 1:340788/149‑1 (MQ=255) tccACCTTGATGTCCGCCAGTCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTCCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCTGTGCCGGcct < 8:254880/147‑2 (MQ=255) gCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCTGTGCCGGcctg < 6:336779/149‑3 (MQ=255) ccACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAgg > 1:133156/1‑149 (MQ=255) cACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAggg > 8:282650/1‑149 (MQ=255) cACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGACAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGcc < 3:128509/141‑1 (MQ=255) cACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGACAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGcc > 4:128509/1‑141 (MQ=255) cTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGa > 2:277176/1‑149 (MQ=255) gATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCACTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGAt < 6:328549/147‑1 (MQ=255) cGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAgg < 7:114916/136‑1 (MQ=255) cGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAgg > 8:114916/1‑136 (MQ=255) ccAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATggcggcggc > 4:197466/1‑148 (MQ=255) gCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCgg > 6:368078/1‑125 (MQ=255) gCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCgg < 5:368078/125‑1 (MQ=255) gCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTg > 4:44664/1‑149 (MQ=255) cGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGca < 3:197466/149‑1 (MQ=255) gACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGcac < 2:133156/149‑1 (MQ=255) tGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGc < 7:172927/143‑1 (MQ=255) tGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGc > 8:172927/1‑143 (MQ=255) gcgcTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAAc > 2:306868/1‑149 (MQ=255) cTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCTGTGCCGGcctgcc < 3:130877/120‑5 (MQ=255) cTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCTGTGCCGGcctgcc > 4:130877/1‑116 (MQ=255) ttCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGcac < 1:309545/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGcac > 2:309545/1‑140 (MQ=255) cGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCa < 1:283784/147‑1 (MQ=255) gCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAgg < 1:164853/148‑1 (MQ=255) gCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCAcgc < 3:44664/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCAcg < 4:82832/148‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGAcc < 1:306868/148‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTa < 7:282650/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAg < 3:53441/149‑1 (MQ=255) ccTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGTCAGGCCGGCTCAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCa < 1:110780/149‑1 (MQ=255) gTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATggcggcggc < 8:189084/102‑1 (MQ=255) gTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATggcggcggc > 7:189084/1‑102 (MQ=255) aGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGAt > 3:78304/1‑148 (MQ=255) cgcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGTCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTgt < 1:277176/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGCTCATTgtc > 2:31310/1‑149 (MQ=255) gcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTgtc > 8:299430/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGt > 4:336393/1‑120 (MQ=255) aTGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGt < 3:336393/120‑1 (MQ=255) aCCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacgg > 3:153910/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacggg > 5:59388/1‑149 (MQ=255) ttCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGgccacgggccacgg > 7:85086/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGt > 3:47994/1‑71 (MQ=255) tCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGt < 4:47994/71‑1 (MQ=255) aGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCtt < 4:78304/149‑1 (MQ=255) gggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCa > 2:341411/1‑114 (MQ=255) gggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCa < 1:341411/114‑1 (MQ=255) ggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGt < 4:164120/98‑1 (MQ=255) ggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGt > 3:164120/1‑98 (MQ=255) ggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGTTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTg < 6:82781/149‑1 (MQ=255) ggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacgggccacg < 6:359635/143‑1 (MQ=255) ggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacgggccacg > 5:359635/1‑143 (MQ=255) ggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacgggccacg > 1:234190/1‑143 (MQ=255) ggCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacgggccacg < 2:234190/143‑1 (MQ=255) gCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGt < 7:299430/149‑1 (MQ=255) ccTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTc > 1:40286/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGa < 4:153910/147‑1 (MQ=255) ggCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCttt > 8:81898/1‑139 (MQ=255) ggCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCttt < 7:81898/139‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGt < 2:62281/140‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGt > 1:62281/1‑140 (MQ=255) gCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGc < 3:306855/148‑1 (MQ=255) gcTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAg > 6:69211/1‑149 (MQ=255) tcaccctggCCGGCTGTGCCGGCCTGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATg > 3:48325/8‑149 (MQ=255) tggCCGGCTGTGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCcgc > 2:111928/2‑149 (MQ=255) cGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCAGGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGt < 6:133455/148‑1 (MQ=255) cGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGt > 5:133455/1‑148 (MQ=255) cGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGTc < 8:85086/149‑1 (MQ=255) cGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGTc > 6:246843/1‑149 (MQ=255) cGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGACCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATTGTCCGCgg > 2:102886/1‑147 (MQ=255) | GGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGTC > NC_002947/1469903‑1470188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |