Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,671,162 | A→C | 7.2% | V576G (GTA→GGA) | PP_1467 ← | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,671,162 | 0 | A | C | 7.2% | 213.3 / 6.9 | 69 | V576G (GTA→GGA) | PP_1467 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/33); new base C (3/2); total (34/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 |
GTGTTCAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTGCAGA > NC_002947/1671017‑1671308 | gtgtTCAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACAt > 2:42769/1‑149 (MQ=255) gtgtTCAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACAt < 3:66658/149‑1 (MQ=255) aGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGAccc > 7:61401/1‑149 (MQ=255) tcgCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTg > 5:337833/1‑149 (MQ=255) cgatggcgacgaGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGccc > 6:83194/7‑146 (MQ=255) cgatggcgacgaGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGccc < 5:83194/140‑1 (MQ=255) gCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGc > 6:56651/1‑149 (MQ=255) aTCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAAGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCAt > 8:256288/1‑149 (MQ=255) acgaGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATcgcg < 6:162741/149‑1 (MQ=255) gaGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCggg > 2:193096/1‑149 (MQ=255) gaGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGAGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCggg > 8:149241/1‑149 (MQ=255) aGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGc < 5:56651/149‑1 (MQ=255) gACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTTGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCGGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCg > 6:369531/1‑148 (MQ=255) cAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGCTCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGaa > 7:40355/1‑148 (MQ=255) cAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAAc < 5:127198/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGGTCCATGTagccagcc > 1:1689/1‑129 (MQ=255) aaGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGGTCCATGTagccagcc < 2:1689/129‑1 (MQ=255) aaGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACa > 4:57556/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAgt < 1:42769/149‑1 (MQ=255) cGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCgg > 2:201971/1‑135 (MQ=255) cGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCgg < 1:201971/135‑1 (MQ=255) tgcCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGc > 4:52462/1‑148 (MQ=255) tgcCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGc > 4:52460/1‑148 (MQ=255) ccAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGCTCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGcc < 8:40355/147‑1 (MQ=255) ccAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGcc < 3:309013/147‑1 (MQ=255) ggCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATg > 4:56002/1‑147 (MQ=255) gcCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTg > 1:279192/1‑149 (MQ=255) tGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCt > 5:214653/1‑149 (MQ=255) aGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTgg < 4:164283/149‑1 (MQ=255) gTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGt < 3:52460/149‑1 (MQ=255) gTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGt < 3:52462/149‑1 (MQ=255) gTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGt < 6:337833/149‑1 (MQ=255) gTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGt < 2:279192/149‑1 (MQ=255) tATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTa < 3:57556/149‑1 (MQ=255) tATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAAGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTa < 7:256288/149‑1 (MQ=255) ggTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGcc < 3:56002/149‑1 (MQ=255) cTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGAGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCtt < 7:149241/149‑1 (MQ=255) cAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGt > 5:647/1‑147 (MQ=255) aaGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCa < 6:214653/148‑1 (MQ=255) ggCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGAccc > 5:85223/1‑62 (MQ=255) ggCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGAccc < 6:85223/62‑1 (MQ=255) ggCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGt < 8:61401/149‑1 (MQ=255) caGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTAACAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCtt > 3:201442/1‑134 (MQ=255) caGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTAACAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCtt < 4:201442/134‑1 (MQ=255) gTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCtata < 3:276690/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCtata > 6:86648/1‑148 (MQ=255) ccAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATcc < 3:150269/115‑1 (MQ=255) ccAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATcc > 4:150269/1‑115 (MQ=255) aGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGACCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCTTGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTg < 4:82159/140‑1 (MQ=255) aGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGACCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTg > 3:82159/1‑140 (MQ=255) gCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCt < 1:193096/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCg < 3:178070/149‑1 (MQ=255) gctgcggctgcAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGgcg > 6:183081/1‑149 (MQ=255) tgcggctgcAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGcc > 1:102130/1‑149 (MQ=255) cggctgcAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCt < 5:183081/148‑1 (MQ=255) aaCGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATg > 4:62889/1‑146 (MQ=255) aCGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGa > 3:174399/1‑149 (MQ=255) gggTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCt > 6:258347/1‑138 (MQ=255) gggTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCt < 5:258347/138‑1 (MQ=255) gggTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACg < 5:86648/149‑1 (MQ=255) gTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGTGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCg > 7:79516/1‑106 (MQ=255) gTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGTGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCg < 8:79516/106‑1 (MQ=255) gccAGGGCTGGGTCCATGTAGCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTgg > 1:34802/3‑149 (MQ=255) aGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGc > 8:822/1‑147 (MQ=255) ggctgggtCCATGTAGCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACg > 7:305562/1‑139 (MQ=255) ggctgggtCCATGTAGCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACg < 8:305562/139‑1 (MQ=255) gctggctACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGtt < 1:204880/149‑1 (MQ=255) gctggctACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGtt < 6:647/149‑1 (MQ=255) tACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTGCAGa > 7:18729/1‑148 (MQ=255) | GTGTTCAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGGTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTGCAGA > NC_002947/1671017‑1671308 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |