| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,748,922 | T→A | 5.6% | intergenic (‑255/‑77) | PP_1548 ← / → PP_5744 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,748,922 | 0 | T | A | 5.6% | 225.4 / 2.5 | 71 | intergenic (‑255/‑77) | PP_1548/PP_5744 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/28); new base A (2/2); total (41/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
AGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTGAGCGGCTGGGCTTGAGGGTTT > NC_002947/1748775‑1749068 | aGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATg > 8:59528/1‑149 (MQ=255) tACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑ttt > 3:326120/1‑149 (MQ=255) gTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑tttttt < 4:132012/149‑1 (MQ=255) gTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑At > 7:274294/1‑148 (MQ=255) agatgagcccccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑At > 8:319277‑M2/49‑148 (MQ=255) tAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGc < 4:326120/149‑1 (MQ=255) gagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTaa‑‑a > 5:23782‑M2/45‑143 (MQ=255) gagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTaa‑‑a > 3:150121‑M2/45‑143 (MQ=255) gagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTaa‑‑a < 4:150121‑M2/99‑1 (MQ=255) gagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTaa‑‑a < 6:23782‑M2/99‑1 (MQ=255) tCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCa > 1:336805/1‑149 (MQ=255) GAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTtgt > 7:59528‑M1/1‑149 (MQ=255) tCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGc < 3:340757/118‑1 (MQ=255) tCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGc > 4:340757/1‑118 (MQ=255) tCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTaa > 1:177358/1‑149 (MQ=255) tCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTaa > 3:248708/1‑149 (MQ=255) cgagttaatccggcgattgagttctggtggCTCATCTGCTGGTTTTTAATGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAAt < 7:319277‑M2/119‑1 (MQ=255) cAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAAt > 1:146633/1‑149 (MQ=255) aaTCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGTGCTTGCATTTA‑AAAAACAAGCATGCTTTTATAA‑‑ATGCAAGTTCGCTtgcatttg < 4:58751/148‑7 (MQ=21) aaTCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGTGCTTGCATTTA‑AAAAACAAGCATGCTTTTATAA‑‑ATGCAAGTTCGCTtgcatttg > 3:58751/1‑142 (MQ=21) cGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑At < 4:327280/126‑1 (MQ=255) cGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑At > 3:327280/1‑126 (MQ=255) gCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTtc > 3:48088/1‑148 (MQ=255) ccGGATTAACTCGGTGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCaa > 6:60619/1‑128 (MQ=255) ccGGATTAACTCGGTGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCaa < 5:60619/128‑1 (MQ=255) cTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTAt < 1:173518/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGTGCTTGCATTTA‑AAAAACAAGCATGCTTTTATAA‑‑ATGCAAGTTCGCTtgcattt < 3:29097/132‑6 (MQ=18) tCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGTGCTTGCATTTA‑AAAAACAAGCATGCTTTTATAA‑‑ATGCAAGTTCGCTtgcattt > 4:29097/1‑127 (MQ=18) gcCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGt > 5:67130/1‑149 (MQ=255) cATCTGCTGGTTTTTAAAGATCTGTGGCTGCCTGAGCTGACATCTCGATTCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTa < 6:67130/148‑1 (MQ=255) tgGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCttt > 8:270012/1‑149 (MQ=255) tgGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCttt > 7:289554/1‑149 (MQ=255) tttttAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCCTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCg > 1:240366/1‑148 (MQ=255) ttttAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGa > 1:302822/1‑149 (MQ=255) aaGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCg > 7:156236/1‑149 (MQ=255) aaGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCg > 3:289101/1‑149 (MQ=255) gCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAgtgt < 4:121439/125‑1 (MQ=255) gCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAACGAACATGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAgtgt > 3:121439/1‑125 (MQ=255) gCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGaaa < 4:48088/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGaaa < 8:274294/149‑1 (MQ=255) tGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAaga < 7:270012/149‑1 (MQ=255) gCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAagag > 2:84886/1‑149 (MQ=255) ccGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAAGGGTGCAAGCACGATTGTGTAATTTTCTATTACTTTATGGATGTCAAGTGTGTAGGAGGTTTCGTATGTCGGCGCAGTaaa > 1:107292/1‑147 (MQ=255) cGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAagag > 8:7366/1‑147 (MQ=255) ggAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTATGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAg > 8:142504/1‑149 (MQ=255) tGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGAt < 4:223562/124‑1 (MQ=255) tGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGAt > 3:223562/1‑124 (MQ=255) ccAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTAt > 7:61513/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTAt > 7:56566/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATg < 8:61513/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATg < 8:56566/149‑1 (MQ=255) tCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTAGTGTATGGATGTCAAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATCTCGGAGAAGGAAAGAGCAGTACGTATGGaa > 8:305678/1‑148 (MQ=255) gATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAaga < 8:289554/148‑1 (MQ=255) atgcaaatgcaaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCCTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGc < 2:240366/149‑1 (MQ=255) caaatgcaaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTGAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTaa > 1:321460/1‑149 (MQ=255) aaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGcc < 2:302822/148‑1 (MQ=255) aaGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCt > 3:265978/1‑149 (MQ=255) aGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCtt > 3:309517/1‑149 (MQ=255) aGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCtt < 4:248708/149‑1 (MQ=255) gCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCtt > 3:42404/1‑148 (MQ=255) gCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTg > 7:325313/1‑149 (MQ=255) cGAACTTGCATTTATATAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGATAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTGa < 2:146633/149‑1 (MQ=255) cATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTGAGCGGCTg < 8:156236/148‑1 (MQ=255) ataAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGaaa < 1:313022/102‑1 (MQ=255) ataAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGaaa > 2:313022/1‑102 (MQ=255) ataAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTGAGCGGCTGGGCtt > 7:111451/1‑148 (MQ=255) taAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTGAGCGGCTGGGCTTGa < 1:84886/149‑1 (MQ=255) aaaaGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCATa > 3:43371/1‑112 (MQ=255) aaaaGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCATa < 4:43371/112‑1 (MQ=255) aaaGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTGAGCGGCTGGGCTTGAgg < 8:325313/149‑1 (MQ=255) cATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTGAGCGGCTGGGCTTGAGGGttt < 4:289101/149‑1 (MQ=255) | AGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGCTCATCTGCTGGTTTTTAAAGAGCGGTGGCTGCCGGAGCTGCCAGCTCGATGCAAATGCAAGCGAACTTGCATTTATAAAAGCATGCTTG‑TTTTTTAA‑‑ATGCAAGCACGCTTGTGTAATTTTCTCTTACTGTATGGATGTCCAGTGTGTAGGAGCTTTCGGATGTCGGCGCAGGAAAGAGCAGTTCGTATGGAAGAGCTAACGAGCCTTGAGCGGCTGGGCTTGAGGGTTT > NC_002947/1748775‑1749068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |