Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,126 | A→C | 6.2% | I419S (ATT→AGT) | trmF ← | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,126 | 0 | A | C | 6.2% | 203.8 / 2.2 | 64 | I419S (ATT→AGT) | trmF | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base C (2/2); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
GAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGTTGATCTGC > NC_002947/2981‑3272 | gAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCa < 7:299700/149‑1 (MQ=255) gAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGCCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCA‑GGTACTCGGCACCCGAGGTAAACATGCGTTACAGCTCCTGACTACCCAAGGAAAt > 6:69710/1‑147 (MQ=255) cGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGgtc < 1:19900/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGATTACCTTGGGTACTCAggagccgta < 2:25932/149‑8 (MQ=255) ccAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTcca > 7:164491/1‑149 (MQ=255) cATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGAGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGcc > 7:93055/1‑148 (MQ=255) aTCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGa > 3:322437/1‑149 (MQ=255) aTCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGa > 4:258684/1‑149 (MQ=255) gATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATg > 8:87184/1‑148 (MQ=255) tCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTGGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGAt < 5:174532/145‑1 (MQ=255) tCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTGGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGAt > 6:174532/1‑145 (MQ=255) ggCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGcc < 8:337473/149‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCACCTGATTACCTTGGGTACTCAgga < 8:36436/122‑2 (MQ=255) gCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCACCTGATTACCTTGGGTACTCAgga > 7:36436/1‑121 (MQ=255) cccAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCtc > 2:35783/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCtcg > 3:335115/1‑149 (MQ=255) ttCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCCCCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgc > 8:127176/1‑149 (MQ=255) ttCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgc > 4:219515/1‑149 (MQ=255) aCGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCCGGGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCATCGTcgcgg > 1:273286/1‑149 (MQ=255) aCGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggc > 6:341782/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCAGTCGCAGGGCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCAc < 8:93055/148‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTg > 4:91364/1‑149 (MQ=255) aGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTc < 2:273286/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGc < 1:35783/149‑1 (MQ=255) gTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCt > 5:281097/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTgcg < 7:82517/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTgcg < 6:281097/149‑1 (MQ=255) gTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATTAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGa < 8:17344/148‑1 (MQ=255) tCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGaa < 8:164491/148‑1 (MQ=255) ttCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTg > 8:255596/1‑149 (MQ=255) cgcgCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGt < 3:258684/146‑1 (MQ=255) cgcAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTgcggc < 4:322437/149‑1 (MQ=255) aGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGtt < 3:219515/149‑1 (MQ=255) tCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTc > 1:130355/1‑149 (MQ=255) tCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTc > 5:264012/1‑149 (MQ=255) gCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCg > 3:214524/1‑149 (MQ=255) gCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCg > 4:136924/1‑149 (MQ=255) cc‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCAc > 8:318414/1‑116 (MQ=255) cc‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCAc < 7:318414/116‑1 (MQ=255) gTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGt < 5:302803/137‑1 (MQ=255) gTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCc‑a < 7:87184/149‑1 (MQ=255) gTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTACTCAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGGCGATGTATGCCTCGTCGAGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCATCCGCCCGAAGTCCGGCGTTAgatccgaa > 6:302803/1‑140 (MQ=255) cTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCc‑agc < 7:255596/148‑1 (MQ=255) tCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTcgcggcgcgg < 4:279957/95‑1 (MQ=255) ggCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCc‑agcag < 6:264012/147‑1 (MQ=255) aCGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCt > 2:19594/1‑149 (MQ=255) gcgAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTgg < 4:214524/149‑1 (MQ=255) aTGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGcttc < 5:69710/149‑1 (MQ=255) aTGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGcttc > 2:269258/1‑149 (MQ=255) gTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGt < 3:267775/110‑1 (MQ=255) gTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGt > 4:267775/1‑110 (MQ=255) ggCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTAccc > 8:297014/1‑149 (MQ=255) gaccTGATTACCTTGGGTACTCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATATATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCgg > 6:1701/3‑149 (MQ=255) cTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCgg < 3:136924/149‑1 (MQ=255) tCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCggt > 7:275607/1‑149 (MQ=255) ccTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCggtg > 3:162141/1‑149 (MQ=255) cTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCggtg < 4:162141/148‑1 (MQ=255) gAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGcc < 3:93983/79‑1 (MQ=255) gAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGcc > 4:93983/1‑79 (MQ=255) cccAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGtt < 5:106868/149‑1 (MQ=255) cccAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGt < 2:130355/148‑1 (MQ=255) ccAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGgc > 3:204086/1‑118 (MQ=255) ccAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGgc < 4:204086/118‑1 (MQ=255) cAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGTTGa > 7:88345/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCCTCGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGTTGATCTGc < 1:269258/148‑1 (MQ=255) | GAATGCGGCCCAGCGCTGGTCATCGATCAGGCCCAGTTCACGGCCCTTTTCGGTCAGGCGCAGGTCGGCGTTGTCTTCGCGCAGTATCAGCC‑GGTACTCGGCACGCGAGGTAAACATGCGGTACGGCTCCTGAGTACCCAAGGTAATCAGGTCGTCCACCAGTACGCCGATGTATGCCTCGTCGCGGCGCGGGCACCAGCTGTCACGGCCCTGCGCCCGAAGTGCGGCGTTAGTCCCGGCC‑AGCAGGCCCTGGGCGCCGGCTTCTTCGTACCCGGTGGTGCCGTTGATCTGC > NC_002947/2981‑3272 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |