| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,154,403 | G→A | 7.7% | S123S (AGC→AGT) | PP_1909 ← | septum formation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,154,403 | 0 | G | A | 7.7% | 228.3 / 5.9 | 78 | S123S (AGC→AGT) | PP_1909 | septum formation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/35); new base A (3/3); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.11e-01 | |||||||||||
GCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTGGTCCGAGCCTATGATCAAGTGTC > NC_002947/2154259‑2154551 | gCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACTGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGt > 2:83625/1‑149 (MQ=255) ccccAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTcag > 6:275917/1‑147 (MQ=255) ccAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTcag > 6:87563/1‑145 (MQ=255) ccAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTcag < 5:87563/145‑1 (MQ=255) ccAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGt > 3:315190/1‑149 (MQ=255) ccccTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGc > 5:186755/1‑147 (MQ=255) ccccTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCa < 5:275917/149‑1 (MQ=255) ccGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCg > 4:321555/1‑149 (MQ=255) cGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACTGTAAAAGGCATGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCg < 1:83625/148‑1 (MQ=255) cGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGAGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCg < 8:318069/148‑1 (MQ=255) gAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCAGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGTCACGCAATCAACATGGCATTGACCGGTGGCGATGTTCATCAGTGACAGCACGGTaata > 3:272302/1‑146 (MQ=255) aaaCTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGaaa < 4:315190/149‑1 (MQ=255) aCTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGc < 6:186755/149‑1 (MQ=255) cccTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCa > 3:260482/1‑149 (MQ=255) cccTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCACTGCTGAACAGCGCCaccg > 1:155273/1‑131 (MQ=255) cccTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCACTGCTGAACAGCGCCaccg < 5:108883/134‑4 (MQ=255) cccTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCACTGCTGAACAGCGCCaccg > 6:108883/1‑131 (MQ=255) cccTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCACTGCTGAACAGCGCCaccg < 2:155273/134‑4 (MQ=255) ccTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGc > 5:7436/1‑145 (MQ=255) ccTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGc < 6:7436/145‑1 (MQ=255) cTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCAcc > 1:216294/1‑149 (MQ=255) gcAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCACTGCTGAACAGCGCCaccgg < 8:12338/129‑5 (MQ=255) gcAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCACTGCTGAACAGCGCCaccgg > 7:12338/1‑125 (MQ=255) aTCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGcc > 1:182001/1‑149 (MQ=255) gCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTg < 3:321555/149‑1 (MQ=255) tgctgcCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCag > 5:181212/1‑147 (MQ=255) ctgcCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCAc < 8:186453/124‑1 (MQ=255) ctgcCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCAc > 7:186453/1‑124 (MQ=255) ccACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGtt < 3:232791/147‑1 (MQ=255) aCGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTg < 1:194872/87‑1 (MQ=255) aCGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTg > 2:194872/1‑87 (MQ=255) gTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCg > 8:114657/1‑148 (MQ=255) aaCGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGc > 3:171552/1‑147 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAgcg > 4:9960/1‑149 (MQ=255) cTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCagt > 5:347969/1‑133 (MQ=255) cTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCagt < 6:347969/133‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAgcgc > 7:203637/1‑149 (MQ=255) gACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAgcgcgc < 2:216294/148‑1 (MQ=255) aCCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGaa < 7:249844/100‑1 (MQ=255) aCCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGaa > 8:249844/1‑100 (MQ=255) aCCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGc < 6:159078/135‑1 (MQ=255) aCCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGc > 5:159078/1‑135 (MQ=255) aCCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTc > 3:107549/1‑149 (MQ=255) ctgctccctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCg > 3:63551/1‑148 (MQ=255) ctccctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGaa < 6:181212/147‑1 (MQ=255) ctccctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACg > 6:140640/1‑149 (MQ=255) ctccctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTAGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGTCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAAc < 1:22968/148‑1 (MQ=255) ccctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTa > 6:33257/1‑149 (MQ=255) cctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGt < 2:182001/147‑1 (MQ=255) cctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTAt > 1:187823/1‑149 (MQ=255) cctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTAt < 4:107549/149‑1 (MQ=255) tgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGc > 3:270138/1‑149 (MQ=255) ctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGc < 8:203637/147‑1 (MQ=255) ctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGc < 5:33257/147‑1 (MQ=255) ttCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGc < 7:29806/149‑1 (MQ=255) cACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGcc < 4:260482/148‑1 (MQ=255) aCGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCt < 1:301410/84‑1 (MQ=255) aCGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCt > 2:301410/1‑84 (MQ=255) aCGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGcc > 6:352033/1‑147 (MQ=255) aCGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCa < 3:9960/149‑1 (MQ=255) aCGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCa > 4:9668/1‑149 (MQ=255) aGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCa > 6:177419/1‑103 (MQ=255) aGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCa < 5:177419/103‑1 (MQ=255) tCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTg < 2:187823/148‑1 (MQ=255) acaaggTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGACCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGACCGGTAAGAAAGCTCAACTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGATGCTCGCAAGAGCGCTCGAACGAATGCGGCTTGCCCAGCACCTGc > 4:48703/5‑149 (MQ=255) aCGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTc < 4:270138/149‑1 (MQ=255) ggTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAAc > 3:294745/1‑121 (MQ=255) ggTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAAc < 4:294745/121‑1 (MQ=255) cACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCg > 4:194199/1‑149 (MQ=255) gCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCaa < 4:171552/149‑1 (MQ=255) cACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTc < 1:130812/75‑1 (MQ=255) cACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTc > 2:130812/1‑75 (MQ=255) cACCGGGCAATGCCAGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCtt < 4:280364/114‑1 (MQ=255) cACCGGGCAATGCCAGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCtt > 3:280364/1‑114 (MQ=255) aCCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTGGTc < 4:63551/149‑1 (MQ=255) cTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTc < 6:302532/84‑1 (MQ=255) cTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTc > 5:302532/1‑84 (MQ=255) gTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTGGTCCGAGCCTATGATCaa < 3:9668/149‑1 (MQ=255) gcTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTGGTCCGAGCCGATGATCAAGTGTc > 6:295467/1‑149 (MQ=255) | GCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGGCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTGGTCCGAGCCTATGATCAAGTGTC > NC_002947/2154259‑2154551 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |