| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,273,062 | C→G | 7.2% | intergenic (+27/+264) | PP_2003 → / ← PP_2004 | hypothetical protein/AraC family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,273,062 | 0 | C | G | 7.2% | 283.9 / 9.5 | 94 | intergenic (+27/+264) | PP_2003/PP_2004 | hypothetical protein/AraC family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/48); new base G (3/4); total (41/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
CGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGGCGATACCTA > NC_002947/2272920‑2273209 | cgcCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGc < 3:317255/149‑1 (MQ=255) gtggtgGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCcgcg < 4:60391/149‑1 (MQ=255) aTGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGAAAgggt < 7:138237/149‑2 (MQ=255) aTGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGc > 2:348220/1‑149 (MQ=255) aTGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGc < 8:257124/149‑1 (MQ=255) tGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGcc > 8:252736/1‑149 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAggg > 5:153986/1‑146 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAggg < 6:153986/146‑1 (MQ=255) aCAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGAAAGGGTCgg < 4:97281/149‑1 (MQ=39) aCAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCg < 1:348220/148‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCCGCCCGCGCAAGGGCCGGtt > 6:108300/1‑148 (MQ=255) ccAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGaaa > 3:17827/1‑138 (MQ=255) ccAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGaaa < 4:17827/138‑1 (MQ=255) ccAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTc > 5:11700/1‑148 (MQ=255) ccAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTc < 6:11700/148‑1 (MQ=255) ccAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCATTAGCCCGCCGCCCGCGAAAGGGCCgggt > 4:38076/1‑145 (MQ=255) cAGGGTTCGCTGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCTGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAg < 3:38076/149‑1 (MQ=255) cAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAg < 2:286402/149‑1 (MQ=255) ttCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGAAAGGGTCGGt > 1:327418/1‑140 (MQ=38) ttCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGAAAGGGTCGGt < 2:327418/140‑1 (MQ=38) ttCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCgg > 2:223709/1‑139 (MQ=255) ttCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑Gt < 6:169731/149‑1 (MQ=255) tgcGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGTGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACCTGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCgg < 1:223709/138‑1 (MQ=255) cGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTa < 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ccTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATc > 8:185087/1‑149 (MQ=255) cTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGt > 4:76669/1‑132 (MQ=255) cTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGt < 3:76669/132‑1 (MQ=255) tgtgGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATccc > 1:217537/1‑149 (MQ=255) tgGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATccc < 4:290619/147‑1 (MQ=255) 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ccATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑CACCCATTCGCCCGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACAAACCCAGTTACACACG‑CCCCGCGAGAAcg > 2:197820/1‑147 (MQ=255) aTTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAGCC‑GACCCATTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTc > 7:79782/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTg < 5:182474/148‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAg < 4:327027/103‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAg > 3:327027/1‑103 (MQ=255) aGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCt > 6:357553/1‑146 (MQ=255) aGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCt < 5:357553/146‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGaa < 2:217537/149‑1 (MQ=255) cagGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGATCC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGtt < 5:7829/114‑1 (MQ=255) cagGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGATCC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGtt > 6:7829/1‑114 (MQ=255) ccAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGTAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTAc < 5:116374/149‑1 (MQ=255) ccAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCCGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTAc > 6:118941/1‑149 (MQ=255) 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tccctTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTc > 2:261334/1‑129 (MQ=255) tccctTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTc < 1:261334/129‑1 (MQ=255) cctTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCCACGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATccc < 1:99017/147‑1 (MQ=255) cctTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGGTCAGGCT‑GGAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTAATGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCAAcccgt > 4:265334/1‑146 (MQ=255) gATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATcc > 4:293038/1‑148 (MQ=255) tGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCAc < 4:22870/149‑1 (MQ=255) gTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCcgc < 5:112835/82‑1 (MQ=255) gTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCcgc > 6:112835/1‑82 (MQ=255) gCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCt < 1:327770/148‑1 (MQ=255) gCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCt < 5:348307/148‑1 (MQ=255) cTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCAt < 6:261153/136‑1 (MQ=255) cTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCAt > 5:261153/1‑136 (MQ=255) cTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAg > 7:315213/1‑149 (MQ=255) gAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGc > 5:184060/1‑149 (MQ=255) gACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAg < 6:184060/149‑1 (MQ=255) gcccTTTCGCGGGCTGCCGGCGAAAGGGTCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAgg > 3:2022/2‑149 (MQ=255) aCCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGTCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAgg > 8:86723/1‑149 (MQ=255) aCCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGc > 2:299301/1‑90 (MQ=255) aCCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGc < 1:299301/90‑1 (MQ=255) cccTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGGc < 3:317350/149‑1 (MQ=255) ccTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGGCg < 3:293038/149‑1 (MQ=255) tttCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGaa > 3:89054/1‑143 (MQ=255) tttCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGaa < 4:89054/143‑1 (MQ=255) tttCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGGCGa > 7:92603/1‑148 (MQ=255) ttCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGGCGATa > 8:137981/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGGCGATa < 8:315213/148‑1 (MQ=255) ccGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGGCGATACCTa < 5:108300/149‑1 (MQ=255) | CGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGTCGCCTGAACC‑GACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCT‑GTAAACATCCCCTGTTACAGACG‑CCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGGCGATACCTA > NC_002947/2272920‑2273209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |