| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,388,336 | 0 | C | G | 5.1% | 442.4 / 7.6 | 134 | intergenic (+73/+71) | pyrD/rmf | dihydroorotate dehydrogenase/ribosome modulation factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/58); new base G (4/3); total (73/61) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TACTCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTCA‑AGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGTTATCACCGC > NC_002947/2388189‑2388480 | taCTGGGGCTTCTTCTACAATGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATTCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTc < 7:288367/148‑1 (MQ=255) aCTCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCCGTGACCATCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAACGCATAAAAAAGCGACCCTTCa‑a > 8:288367/1‑149 (MQ=255) tCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTCA‑Agg > 2:65610/1‑149 (MQ=255) 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tCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTCA‑AGGGGCCCCTggg > 3:96833/1‑149 (MQ=255) cTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTCA‑AGGGGCCCCTGGGc > 6:82876/1‑149 (MQ=255) tACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTCA‑AGGGGCCCCTGGGcc > 8:310903/1‑149 (MQ=255) aCAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTGA‑AGGGGccctttttta < 2:146723/148‑8 (MQ=255) aCAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTCA‑AGGGGCCCCTGGGCCt > 6:302619/1‑149 (MQ=255) 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8:283470/1‑148 (MQ=255) | TACTCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGCCCCTTCA‑AGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGTTATCACCGC > NC_002947/2388189‑2388480 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |