| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,508,914 | C→T | 5.8% | A67A (GCG→GCA) | PP_2203 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,508,914 | 0 | C | T | 5.8% | 312.5 / 4.5 | 103 | A67A (GCG→GCA) | PP_2203 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/45); new base T (4/2); total (56/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.59e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGG > NC_002947/2508767‑2509062 | gggCGAGCCCATGGGCATGCTCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGc > 7:205122/1‑149 (MQ=255) gggCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGAGCCACGc > 6:35341/1‑149 (MQ=255) gggCCACCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGGCGTTGCGGTTGGCCAGCATGC‑GCACCTGCGCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGCGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGgcacaccg < 1:32286/149‑7 (MQ=255) gAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAg > 3:139798/1‑149 (MQ=255) ccttGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGt < 2:233452/146‑1 (MQ=255) ccATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGt > 3:66302/1‑149 (MQ=255) ccAGGGGCAGGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCAGGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGt < 5:99144/149‑1 (MQ=255) ggattGCCCGGCACCGCCCGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACTAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCtt < 8:123958/145‑1 (MQ=255) cATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGa < 1:260452/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGGCACCGCCAGGCCTTTGTGGGGGTTGGGTTTGGCCTGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCAGGTGGCCTTCGACTAACTTGCCGCCTATCACCCCG‑GTGTGGCAGGACGCACGGCGTGGCGCAACGCGGAGGGGTTGCTTGAc < 6:290831/148‑1 (MQ=255) cccGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGgc > 5:34866/1‑149 (MQ=255) cccGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGgc > 2:44729/1‑149 (MQ=255) gCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCggg < 8:106155/130‑3 (MQ=38) gCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCggg > 7:106155/1‑128 (MQ=38) cACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCa < 1:44729/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCAt > 3:321605/1‑149 (MQ=255) aCCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCAt > 1:71909/1‑149 (MQ=255) aCCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGGGGCACGACGCAAGGCGGGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCAt < 1:22758/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGAAGGCGGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCTCG‑GCGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCgggtt > 1:64573/1‑124 (MQ=21) 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gAGGTCGTTGCGTTTAGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGttt < 3:68895/139‑1 (MQ=255) aGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTg < 5:39466/149‑1 (MQ=255) gTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCg < 1:62484/148‑1 (MQ=255) gTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACg < 4:66302/149‑1 (MQ=255) gTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCAAGTTTGGCTCGACGTGGTCGtgtccg > 8:162505/1‑144 (MQ=255) 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cTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGt < 2:148113/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGt < 3:114992/149‑1 (MQ=255) ggccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTaa < 8:281300/128‑1 (MQ=255) ggccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTaa > 7:281300/1‑128 (MQ=255) ggccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGc < 4:321605/149‑1 (MQ=255) ccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGa < 4:58391/120‑1 (MQ=255) 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cTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCGCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTg < 6:295971/149‑1 (MQ=255) cgacgaACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTgca < 1:340182/148‑1 (MQ=255) gacgaACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGATGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTgcag > 1:43345/1‑148 (MQ=255) gacgaACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGAt < 8:187421/135‑1 (MQ=255) gacgaACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGAt > 7:187421/1‑135 (MQ=255) 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< 4:46567/149‑1 (MQ=255) aCCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTcgcg > 4:171906/1‑149 (MQ=255) ccccG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCTCGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 4:87844/1‑149 (MQ=255) ctcG‑GCGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 2:267361/3‑148 (MQ=38) cccG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTg > 5:278/1‑75 (MQ=255) cccG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTg < 6:278/75‑1 (MQ=255) cccG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTgca < 6:321991/126‑1 (MQ=255) cccG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTgca > 5:321991/1‑126 (MQ=255) cccG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 2:108621/1‑148 (MQ=255) cccG‑GTGTGGCACGACGCAAGGAGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 7:53034/1‑148 (MQ=255) cG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 8:276155/1‑146 (MQ=255) cG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 5:367919/1‑146 (MQ=255) cG‑GCGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 6:306708/1‑146 (MQ=38) tgtgGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACg > 4:220398/1‑149 (MQ=255) gCACGACGCAAGGCTTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGc < 7:242818/101‑1 (MQ=255) gCACGACGAAATGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGACGTAGACGGTAAAACCATTGTCACTCAGGTGGc > 8:242818/1‑101 (MQ=255) cACGACGCAAGGCGTGGCGCCTCGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGAt < 3:87844/149‑1 (MQ=255) cACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGAt > 3:333077/1‑149 (MQ=255) tcggCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTcgg > 6:324652/3‑149 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTgg > 3:324089/1‑122 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTcgg > 1:46744/1‑149 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTcgg > 8:234210/1‑149 (MQ=255) aGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAgg > 5:9186/1‑100 (MQ=255) cGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTg > 7:23976/1‑102 (MQ=255) cGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTg < 8:23976/102‑1 (MQ=255) gTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGcc > 4:58497/1‑149 (MQ=255) gcgcCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCa < 2:305273/78‑1 (MQ=255) gcgcCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCa > 1:305273/1‑78 (MQ=255) cgcCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTggg < 7:20235/149‑1 (MQ=255) | CATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCG‑GTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGG > NC_002947/2508767‑2509062 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |