| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,508,920 | G→A | 6.0% | G65G (GGC→GGT) | PP_2203 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,508,920 | 0 | G | A | 6.0% | 353.6 / 6.9 | 115 | G65G (GGC→GGT) | PP_2203 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (57/51); new base A (4/3); total (61/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCA > NC_002947/2508773‑2509065 | gggCGAGCCCATGGGCATGCTCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGc > 7:205122/1‑149 (MQ=255) gAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAg > 3:139798/1‑149 (MQ=255) ccttGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGt < 2:233452/146‑1 (MQ=255) ccATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGt > 3:66302/1‑149 (MQ=255) ggattGCCCGGCACCGCCCGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACTAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCtt < 8:123958/145‑1 (MQ=255) cATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGa < 1:260452/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGGCACCGCCAGGCCTTTGTGGGGGTTGGGTTTGGCCTGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCAGGTGGCCTTCGACTAACTTGCCGCCTATCACCCCGGTGTGGCAGGACGCACGGCGTGGCGCAACGCGGAGGGGTTGCTTGAc < 6:290831/148‑1 (MQ=255) cccGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGgc > 5:34866/1‑149 (MQ=255) cccGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGgc > 2:44729/1‑149 (MQ=255) gCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCggg < 8:106155/130‑3 (MQ=38) gCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCggg > 7:106155/1‑128 (MQ=38) cACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCa < 1:44729/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCAt > 1:71909/1‑149 (MQ=255) aCCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGGGGCACGACGCAAGGCGGGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCAt < 1:22758/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGAAGGCGGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCTCGGCGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCgggtt > 1:64573/1‑124 (MQ=21) gCCAGCCCCTTGAGGTCGTTGCGTTGGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCTCGGCGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCggggt < 2:64573/127‑2 (MQ=21) aGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCCCCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTgg > 2:250873/1‑149 (MQ=255) aGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTgg < 6:170395/149‑1 (MQ=255) ggCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGc < 2:111282/149‑1 (MQ=255) tccTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTc > 2:139326/2‑149 (MQ=255) ccTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTc > 7:265024/1‑148 (MQ=255) ccTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTc > 5:358614/1‑148 (MQ=255) ccTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCg < 7:63081/149‑1 (MQ=255) gAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTc < 4:128907/144‑1 (MQ=255) gAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTc > 3:128907/1‑144 (MQ=255) gAGGTCGTTGCGTTTAGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGttt < 3:68895/139‑1 (MQ=255) gAGGTCGTTGCGTTTAGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGttt > 4:68895/1‑139 (MQ=255) aGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTg < 5:39466/149‑1 (MQ=255) gTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCg < 1:62484/148‑1 (MQ=255) gTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCg < 2:71909/148‑1 (MQ=255) gTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACg < 4:66302/149‑1 (MQ=255) gTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCAAGTTTGGCTCGACGTGGTCGtgtccg > 8:162505/1‑144 (MQ=255) cctacagcagGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACg < 5:366217/142‑1 (MQ=255) cagcagGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCCCGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCCAGGCGTGGCGCCCCGCCGCGGCGTTGCTTGCCGGCGCTCAGGTGTGGCGCGACGGGGTCGGTGACGGTCAAAc > 3:179108/1‑149 (MQ=255) cagcagGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAAc > 3:46567/1‑149 (MQ=255) cagGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCGGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCAt < 8:205122/149‑1 (MQ=255) c‑gcCCCTGCGCGGCCGGCCCGGGGCCGGCGACTCCCTGGCCGCCCCTCCCCCCGGGGGGGCCCGCCGCACGGCGGGGCGCCCCGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGGCGTTGACGGTAAAACCATTGTc < 4:179108/149‑1 (MQ=255) cACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCAc > 1:148113/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACg > 4:114992/1‑147 (MQ=255) gCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCTGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTg < 2:81449/125‑1 (MQ=255) cTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCt < 3:193052/89‑1 (MQ=255) cTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGt < 2:148113/149‑1 (MQ=255) ggccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTaa > 7:281300/1‑128 (MQ=255) ggccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGc < 4:321605/149‑1 (MQ=255) ccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGa > 3:58391/1‑120 (MQ=255) ccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGa < 4:58391/120‑1 (MQ=255) aCGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATc > 2:77419/1‑147 (MQ=255) cGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAg < 4:139798/149‑1 (MQ=255) cGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAg < 1:77419/149‑1 (MQ=255) gTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAgg > 4:141238/1‑149 (MQ=255) cTTCGACTAACTTGGCGCCTTTCACCCGGGGGTGTCACGTCGCTAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTg < 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cgacgaACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTgca < 1:340182/148‑1 (MQ=255) gacgaACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGATGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTgcag > 1:43345/1‑148 (MQ=255) gacgaACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGAt < 8:187421/135‑1 (MQ=255) gacgaACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGAt > 7:187421/1‑135 (MQ=255) gccgATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTgg > 3:123904/1‑149 (MQ=255) cgATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTgggg > 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cGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 8:276155/1‑146 (MQ=255) cGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 5:367919/1‑146 (MQ=255) cGGCGTGGCGCCACGCCTTGCGTCGTGCCACACCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCgg > 6:306708/1‑146 (MQ=38) tgtgGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACg > 4:220398/1‑149 (MQ=255) gCACGACGCAAGGCTTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGc < 7:242818/101‑1 (MQ=255) gCACGACGAAATGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGACGTAGACGGTAAAACCATTGTCACTCAGGTGGc > 8:242818/1‑101 (MQ=255) cACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGAt > 3:333077/1‑149 (MQ=255) tcggCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTcgg > 6:324652/3‑149 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTgg > 3:324089/1‑122 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTcgg > 1:46744/1‑149 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTcgg > 8:234210/1‑149 (MQ=255) aGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAgg > 5:9186/1‑100 (MQ=255) cGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTg > 7:23976/1‑102 (MQ=255) cGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTg < 8:23976/102‑1 (MQ=255) cGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGGGGTCGGTGACGGTAAAACCATTGGCACGCAGGTGGCCGATCCAGGCCTGGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCggcggc < 6:358614/149‑1 (MQ=255) gtgcCACACCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTgg < 1:267361/147‑1 (MQ=255) gcgcCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCa > 1:305273/1‑78 (MQ=255) gcgcCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCa < 2:305273/78‑1 (MQ=255) cgcCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTggg < 7:20235/149‑1 (MQ=255) gcCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGc > 4:43385/1‑149 (MQ=255) ccACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGcc < 1:250873/149‑1 (MQ=255) ccACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATACAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGc > 4:86787/1‑148 (MQ=255) aCGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTg > 8:104028/1‑108 (MQ=255) aCGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTg > 4:237383/1‑108 (MQ=255) aCGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTg < 7:104028/108‑1 (MQ=255) aCGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTg < 3:237383/108‑1 (MQ=255) | GGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGC‑GCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCA > NC_002947/2508773‑2509065 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |