| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,641,804 | C→A | 6.9% | R23S (CGC→AGC) | PP_2312 → | lytic transglycosylase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,641,804 | 0 | C | A | 6.9% | 216.3 / 3.4 | 70 | R23S (CGC→AGC) | PP_2312 | lytic transglycosylase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/35); new base A (2/3); total (32/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 | |||||||||||
TTGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGA > NC_002947/2641657‑2641946 | ttGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGgcgcg > 3:100639/1‑149 (MQ=255)ttGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGgcgc < 4:309345/148‑1 (MQ=255) ccGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTc > 4:88090/1‑149 (MQ=255) ttttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGc > 3:84651/1‑149 (MQ=255) tttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGcc > 3:118707/1‑149 (MQ=255) ttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGc < 4:34038/147‑1 (MQ=255) tACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGCCTGGGc < 6:362413/146‑1 (MQ=255) tACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGCCTGGGc > 5:362413/1‑146 (MQ=255) ccGTCGTTTATGACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACAGCCCCCTACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCgggg < 1:119594/149‑1 (MQ=255) ccGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCgcag > 3:22047/1‑149 (MQ=255) cgtcgtTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCgcagc < 3:88090/149‑1 (MQ=255) gtTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCaaa > 7:279758/1‑148 (MQ=255) tttATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAAc < 4:100639/149‑1 (MQ=255) aaTCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACa > 8:1385/2‑148 (MQ=255) tCACTTGGCGGTGCAAGCCATGGATGCCGATCA‑‑‑‑‑‑CCGACCAAGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGAGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATAc < 4:302283/149‑1 (MQ=255) tCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATAc < 7:337338/149‑1 (MQ=255) aCTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCg > 3:166988/1‑149 (MQ=255) aCTTGGCGGTGCAACCCAGGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATAc < 3:238314/147‑1 (MQ=255) aCTTGGCGGTGCAACCAATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCGCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTACAGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGCCCGCAGCAAAACATAc > 4:238314/1‑147 (MQ=255) cTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCGCCTGGGc < 1:142446/131‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAAc < 7:275950/142‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAAc > 8:275950/1‑142 (MQ=255) ggTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGc > 7:257708/1‑125 (MQ=255) ggTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGc < 8:257708/125‑1 (MQ=255) tGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAg < 8:279758/149‑1 (MQ=255) ggATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGAcc > 8:239105/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTg < 6:238087/149‑1 (MQ=255) ccGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCTGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGgcg > 3:177029/1‑149 (MQ=255) ccGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGgc < 5:64434/148‑1 (MQ=255) tCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTg > 3:4906/1‑142 (MQ=255) tCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTg < 4:4906/142‑1 (MQ=255) a‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGAtt > 5:13031/1‑149 (MQ=255) a‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGAt < 2:79281/148‑1 (MQ=255) gACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCg > 4:281350/1‑148 (MQ=255) cACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCAc > 6:305139/1‑148 (MQ=255) ggACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAg > 1:319809/1‑148 (MQ=255) acGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAg < 6:13031/149‑1 (MQ=255) gTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCaaaa > 7:170278/1‑97 (MQ=255) gTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCaaaa < 8:170278/97‑1 (MQ=255) gTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTc < 6:312855/135‑1 (MQ=255) gTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTc > 5:312855/1‑135 (MQ=255) ttttCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTAc > 4:340250/1‑149 (MQ=255) tCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTg < 2:289068/148‑1 (MQ=255) tCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGc > 6:72058/1‑149 (MQ=255) aTGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGt < 4:166988/149‑1 (MQ=255) aTGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCATGACCTGGCGCAGATTCGCGCCAGCAAAGTACTGCGAGt > 6:336002/1‑149 (MQ=255) gCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTgg < 4:8510/149‑1 (MQ=255) gCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTgg < 4:84651/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCaa < 7:1385/149‑1 (MQ=255) cTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAAc < 4:118707/148‑1 (MQ=255) cTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAAc > 4:340326/1‑148 (MQ=255) tGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCTGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCa < 4:177029/149‑1 (MQ=255) gCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCaga < 8:155715/149‑1 (MQ=255) gCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCaga < 3:281350/149‑1 (MQ=255) tCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGc > 6:157398/1‑149 (MQ=255) tCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGc > 4:99462/1‑149 (MQ=255) cATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGcc > 5:261353/1‑149 (MQ=255) aTTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCg < 5:305139/149‑1 (MQ=255) ttttCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGa > 1:165293/1‑104 (MQ=255) ttttCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGa < 2:165293/104‑1 (MQ=255) tttCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCa < 2:227729/148‑1 (MQ=255) ttCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCaa < 4:22047/148‑1 (MQ=255) aCGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCt < 7:239105/147‑1 (MQ=255) aCGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCt < 3:340326/147‑1 (MQ=255) aCGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTgg < 5:72058/149‑1 (MQ=255) gCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTggt > 5:112795/1‑148 (MQ=255) ccTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGt > 5:274878/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTg < 3:340250/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATTCCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGc < 6:274878/148‑1 (MQ=255) ggTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGt > 6:336748/1‑149 (MQ=255) gCCCCGGCGAGCGCGCCTGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCAt > 7:91478/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCTCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGa < 5:157398/149‑1 (MQ=255) | TTGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCA‑‑‑‑‑‑CCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGA > NC_002947/2641657‑2641946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |