| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,706,509 | A→C | 6.2% | T1222T (ACA→ACC) | PP_2369 → | leucine‑rich repeat‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,706,509 | 0 | A | C | 6.2% | 241.8 / 4.7 | 77 | T1222T (ACA→ACC) | PP_2369 | leucine‑rich repeat‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/37); new base C (2/3); total (37/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
TGTGGCATATCCTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAACGATCCCGTTGAGGTTTACCTGACCTA > NC_002947/2706361‑2706649 | tgtgGCATATCCTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACa < 2:124994/149‑1 (MQ=255) tgGCATATCCTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGc > 6:98558/1‑149 (MQ=255) gCATATCCTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCg > 6:145240/1‑149 (MQ=255) cATATCCTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCgg < 3:330022/149‑1 (MQ=255) tCCTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTAcc > 7:29515/1‑149 (MQ=255) cTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACCGGCTGTACCgg < 4:326640/149‑1 (MQ=255) cTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCgg < 4:173939/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCggg > 4:155554/1‑149 (MQ=255) tCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCggg > 4:150263/1‑149 (MQ=255) gAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGt < 2:322155/148‑1 (MQ=255) ggCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTCACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTAc < 8:47575/149‑1 (MQ=255) gCGAGCAGCTCGCTGATGTTCGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCTGCCGCGCAGTTGCAGTGACTATTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGTCCGGTACCGGCTGTACCgg < 6:328252/139‑1 (MQ=255) gCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACCGGCTGTACCgg > 5:328252/1‑139 (MQ=255) cGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCgg > 3:55978/1‑138 (MQ=255) cGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCgg < 4:55978/138‑1 (MQ=255) cGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGaa < 3:150263/147‑1 (MQ=255) cGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGaa < 3:155554/147‑1 (MQ=255) gcaCGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCggg < 4:249300/149‑1 (MQ=255) gcgAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTggg < 5:145240/149‑1 (MQ=255) cgAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTgggg < 5:98558/149‑1 (MQ=255) gAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGGGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCggg < 7:41308/115‑1 (MQ=255) gAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGGGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCggg > 8:41308/1‑115 (MQ=255) gAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGc < 7:196246/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCGAGCACGTTGCCCGGCCGCGCTGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACCGGCTGTACCggcct < 7:226350/114‑4 (MQ=255) gTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGcgttcgt > 3:134321/1‑149 (MQ=255) gTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGcgttcgt > 2:259800/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGcgttcgt < 1:243195/148‑1 (MQ=255) gAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCa < 6:90938/130‑1 (MQ=255) gAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCa > 3:310980/1‑130 (MQ=255) gAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCa > 5:90938/1‑130 (MQ=255) gAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCa < 4:310980/130‑1 (MQ=255) aGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCgttg > 6:365180/1‑146 (MQ=255) aGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCgttg < 5:365180/146‑1 (MQ=255) aGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGcc > 8:123756/1‑149 (MQ=255) ttGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTg > 1:37159/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTgg < 6:64520/148‑1 (MQ=255) cccGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGa > 4:235884/1‑148 (MQ=255) ccGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGAc > 7:89221/1‑148 (MQ=255) gCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAg > 6:208175/1‑149 (MQ=255) gtaGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAAc < 1:70663/147‑1 (MQ=255) gcAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGa < 1:73046/97‑1 (MQ=255) gcAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGa > 2:73046/1‑97 (MQ=255) ttGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTggg < 4:31754/114‑1 (MQ=255) ttGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTggg > 3:31754/1‑114 (MQ=255) cAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑Tg > 1:320871/1‑149 (MQ=255) gTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGcc > 5:143767/1‑149 (MQ=255) tGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCcg < 2:37159/149‑1 (MQ=255) aCGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCcgcg > 5:121408/1‑149 (MQ=255) gAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCcgcgcg > 3:135698/1‑149 (MQ=255) gAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCcgcgcg < 1:259800/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGc < 3:235884/149‑1 (MQ=255) ctgctgACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAATATGCCGCGCGGCaat > 5:4972/1‑147 (MQ=255) ctgACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGc < 3:337832/149‑1 (MQ=255) ctgACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGc < 4:135698/149‑1 (MQ=255) aCGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAATATGCCGCGCGGCA‑ATTGCgtt < 6:4972/149‑3 (MQ=255) aCGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGa < 6:121408/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCcgcg < 4:5730/133‑1 (MQ=255) gCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCcgcg > 3:5730/1‑133 (MQ=255) gCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGc > 3:247833/1‑144 (MQ=255) gCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGc < 4:247833/144‑1 (MQ=255) gCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTtc > 8:318024/1‑149 (MQ=255) aGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCAGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGc < 7:128995/98‑1 (MQ=255) aGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCAGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGc > 8:128995/1‑98 (MQ=255) cTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGaa < 7:123756/149‑1 (MQ=255) cTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGaa < 7:318024/149‑1 (MQ=255) gAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTtc > 8:68009/1‑141 (MQ=255) gAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTtc < 7:68009/141‑1 (MQ=255) gAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAACGa > 1:172437/1‑149 (MQ=255) gAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAACGa > 1:309612/1‑149 (MQ=255) gAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGGCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTtc < 7:72918/141‑1 (MQ=255) gAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACAGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTtc > 8:72918/1‑141 (MQ=255) ttGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCACGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAACGATccc > 7:203252/1‑149 (MQ=255) cgcgcTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAACGATCCCCtt > 6:302219/1‑148 (MQ=255) cgcTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAACGATCCCGTTGAg < 5:208175/149‑1 (MQ=255) aaGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAACGATCCCGTTGAGGTTTACCTGAc < 4:134321/149‑1 (MQ=255) gCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAAc > 3:249566/1‑123 (MQ=255) gCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAAc < 4:249566/123‑1 (MQ=255) cccGGTACCGGCTGTTCCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGACCGATCCCGTTGAGGTTTACCTGACCTa > 8:140023/2‑149 (MQ=255) | TGTGGCATATCCTCGAGGCCTGCGAGCAGCACGCTGAAGTACGCGCGAGCCTGTTCGAGCAAGTTGCCCGGCCGCGCAGTTGCAGTGACGAGTTGCTGCTGACGCTCAGCGAGCTGGAGGTTGGCGCGCTGGTCGCCAAGGCCGGTACAGCCGGTACCGGGTTACAGAAGGAGCGGGCGCTGGTCAGGCTGGGGCGTTCGTTGTTCCGCCTGGACAAAGTCAACGCAAT‑TGCCGCGCGGCATATTGCGGATTACTTCTCGAACGATCCCGTTGAGGTTTACCTGACCTA > NC_002947/2706361‑2706649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |