Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,711,618 | G→A | 11.4% | T1162T (ACC→ACT) ‡ | metH ← | cobalamin‑dependent methionine synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,711,618 | 0 | G | A | 11.4% | 184.6 / 10.5 | 70 | T1162T (ACC→ACT) ‡ | metH | cobalamin‑dependent methionine synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/30); new base A (3/5); total (35/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.66e-01 |
CTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCATAGCCCCAGTGCTCTT > NC_002947/2711474‑2711766 | cTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGc > 8:297527/1‑149 (MQ=255) cGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCa > 5:238897/1‑149 (MQ=255) gATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCa < 5:146441/148‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATc < 2:109420/144‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCACCGCCATCggtga < 5:312223/149‑5 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCACCGCCATCggtg > 6:312223/1‑145 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCACCGCCATCg < 4:85308/145‑1 (MQ=255) tCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAg < 6:238897/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAgg < 7:332561/149‑1 (MQ=255) cTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGc < 6:181603/149‑1 (MQ=255) cTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGc > 2:211593/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACaga < 8:76711/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACaga < 7:297527/149‑1 (MQ=255) ttGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGt > 3:240108/1‑149 (MQ=255) tACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCACCGCCATCgg < 4:96950/128‑2 (MQ=255) tACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCACCGCCATCgg > 3:96950/1‑127 (MQ=255) ggCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtttt > 2:332078/1‑149 (MQ=255) aCTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGTGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCa > 6:240217/1‑143 (MQ=255) aCTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCa < 5:240217/143‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTTACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCggag > 1:101495/1‑147 (MQ=255) ccTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCgggg < 4:270324/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCACCGCCATCgg < 6:109235/111‑2 (MQ=255) gAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAAc < 3:63835/149‑1 (MQ=255) gAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAAc < 1:211593/149‑1 (MQ=255) aaGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGACGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGGCGGGGCAGGCCGGATAAcc < 6:114893/149‑1 (MQ=255) tACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAgt < 4:334696/122‑1 (MQ=255) tACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAgt > 3:334696/1‑122 (MQ=255) cAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGgcg > 3:289184/1‑148 (MQ=255) aGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAgg < 4:68392/95‑1 (MQ=255) aGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATACCCCGgcg > 2:231082/1‑147 (MQ=255) cGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAggg > 5:247672/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCg > 3:113308/1‑136 (MQ=255) aCCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCg < 4:113308/136‑1 (MQ=255) ccgccgccgGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCg < 4:36499/149‑1 (MQ=255) tCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCtt > 5:158514/1‑148 (MQ=255) gAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGAt > 6:352298/1‑147 (MQ=255) aGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAgc < 4:289184/149‑1 (MQ=255) aGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAgc < 4:240108/149‑1 (MQ=255) tGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTTACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGAGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAgcgc < 2:101495/149‑1 (MQ=255) tCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTc > 1:193830/1‑149 (MQ=255) gTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGtt < 6:247672/149‑1 (MQ=255) gTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTc < 3:32439/126‑1 (MQ=255) gTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTc > 4:32439/1‑126 (MQ=255) gTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTc > 7:56544/1‑147 (MQ=255) cacCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGt > 5:215942/1‑149 (MQ=255) acCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAg > 6:164649/1‑100 (MQ=255) acCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAg < 5:164649/100‑1 (MQ=255) acCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTcc < 8:166555/123‑1 (MQ=255) acCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTcc > 7:166555/1‑123 (MQ=255) cccGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCCGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCt > 5:76398/1‑149 (MQ=255) cccGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCt > 4:89159/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCtc < 4:346981/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCtcgt > 5:49805/1‑149 (MQ=255) ggCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCtcgtcg < 6:76398/147‑1 (MQ=255) gCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGtt > 8:42665/1‑47 (MQ=255) gCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGtt < 7:42665/47‑1 (MQ=255) gCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCgg < 2:193830/149‑1 (MQ=255) gCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCgg < 6:49805/149‑1 (MQ=255) cGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCa > 6:329128/1‑149 (MQ=255) ttCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGTGCAGGCCGTATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGGTGTCCAGGTTCtcttc > 6:244922/1‑138 (MQ=255) ttCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGGCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCtcgtc < 5:244922/138‑1 (MQ=255) ctgctcGATGGCACCGCCATCGGGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTcc > 2:169398/6‑106 (MQ=255) ctgctcGATGGCACCGCCATCGGGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTcc < 1:169398/101‑1 (MQ=255) tCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCATAGcc > 1:312258/1‑149 (MQ=255) aCCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGtt < 5:17047/120‑1 (MQ=255) aCCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGtt > 6:17047/1‑120 (MQ=255) aCCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCATAGccc > 7:243133/1‑148 (MQ=255) aCCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCATAGccc > 8:170320/1‑148 (MQ=255) cGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCATAGCCCCAg > 8:71643/1‑149 (MQ=255) gCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCATAGCCCCAGTGct > 1:148309/1‑148 (MQ=255) ggTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCATAGCCCCAGTGCTCtt < 5:329128/149‑1 (MQ=255) | CTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGCCGCTGTACTGTTCCTTGATCAGCGCCTCGTTGTCCAGGTGCTCGTCGCGGGCATAGCCCCAGTGCTCTT > NC_002947/2711474‑2711766 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |