Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,859,149 | G→A | 6.2% | C127Y (TGT→TAT) ‡ | PP_2511 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,859,149 | 0 | G | A | 6.2% | 245.6 / 3.9 | 80 | C127Y (TGT→TAT) ‡ | PP_2511 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/41); new base A (3/2); total (37/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.99e-01 |
GGAGTTGGCGTGCTGCCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGATGCAGTACTTGTGCAACGG > NC_002947/2859002‑2859292 | ggAGTTGGCGTGCTGCCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTg > 4:75716/1‑148 (MQ=255) gAGTTGGCGTGCTGCCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGt < 6:310084/148‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTga < 7:168951/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTgag < 5:175620/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTgag < 7:204172/149‑1 (MQ=255) tgcCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGt > 7:114639/1‑149 (MQ=255) gcCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTc > 6:241874/1‑149 (MQ=255) gATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCa > 5:326621/1‑148 (MQ=255) gggCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGt > 7:209641/1‑148 (MQ=255) gCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTca > 4:217027/1‑148 (MQ=255) tgGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTc < 8:74676/148‑1 (MQ=255) tCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAg < 5:241874/149‑1 (MQ=255) cgcCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTTTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAgac > 2:55477/1‑146 (MQ=255) gcCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGa < 2:48812/149‑1 (MQ=255) cACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGc < 8:326851/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTa < 6:317342/148‑1 (MQ=255) gCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTa > 5:317342/1‑148 (MQ=255) ttGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCAACGTTGTAACGGTGACGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCAAGAACTACCa > 6:235166/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTGTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCAt < 8:211980/148‑1 (MQ=255) cTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTg < 3:75716/149‑1 (MQ=255) cTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTg < 3:217027/149‑1 (MQ=255) cGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGt < 2:188502/148‑1 (MQ=255) tCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGGTACCTCATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGc < 5:334382/122‑1 (MQ=255) tCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCa < 6:129846/128‑1 (MQ=255) tCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCa > 5:129846/1‑128 (MQ=255) tCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGCCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGACACATTCCTTAGc > 6:334382/1‑122 (MQ=255) cccTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCTGGTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCg > 1:4549/1‑147 (MQ=255) cccTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCg < 2:4549/146‑1 (MQ=255) cccTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTa < 6:326621/149‑1 (MQ=255) ttttCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGt < 8:114639/149‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTAcc < 7:266665/123‑1 (MQ=255) tCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTAcc > 8:266665/1‑123 (MQ=255) ttACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTg < 5:75432/139‑1 (MQ=255) ttACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTg > 6:75432/1‑139 (MQ=255) tACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCg < 8:209641/146‑1 (MQ=255) cAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAgcg > 4:174416/1‑149 (MQ=255) aGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAgcgc > 5:220093/1‑149 (MQ=255) ggCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAgcgc > 5:80243/1‑148 (MQ=255) gCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCa < 2:212050/143‑1 (MQ=255) gCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCa > 1:212050/1‑143 (MQ=255) gCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGcgcg > 4:29640/1‑148 (MQ=255) t‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTg < 3:188638/131‑1 (MQ=255) t‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTg > 4:188638/1‑131 (MQ=255) cggTTCTGTCGTTTTAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGGCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGaa < 8:54375/147‑1 (MQ=255) ttCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAggg < 3:174416/149‑1 (MQ=255) ttCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAggg > 2:32146/1‑149 (MQ=255) cGATTGAGGACACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCt < 1:55477/148‑1 (MQ=255) ttGAGTCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGTGCACCGTTGTAACGGTGAGTAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTg < 2:229616/117‑1 (MQ=255) ttGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCCTGATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTg > 1:229616/1‑118 (MQ=255) gAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTg > 3:311012/1‑115 (MQ=255) gAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTg < 4:311012/115‑1 (MQ=255) aGGCCACACTTGGCCTGGCAACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGTGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGGATTGGTGATAAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGacac < 1:32146/149‑1 (MQ=255) ggCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGt < 8:26034/115‑1 (MQ=255) ggCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGt > 7:26034/1‑115 (MQ=255) acacTTGGCCTGGCTACGACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCg < 5:235166/149‑1 (MQ=255) acacTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCg < 3:29640/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCg < 6:220093/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTTA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCgg < 6:148370/149‑1 (MQ=255) cTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTAc > 8:261323/1‑78 (MQ=255) cTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTAc < 7:261323/78‑1 (MQ=255) cTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCgg > 4:162759/1‑148 (MQ=255) aCCAAATCCC‑GATGCCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCAAAATGTCAAATTCGTTAGCCGAGCACTAACATGAAAACCTGGTCGGTATTCGTGA‑AAACCCGAAGCGCGCAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAga > 5:250894/1‑148 (MQ=255) cacaTCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGa‑aaa < 3:195401/99‑1 (MQ=255) cacaTCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGa‑aaa > 4:195401/1‑99 (MQ=255) aTCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGAt < 5:137890/147‑1 (MQ=255) aTCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGAt > 6:137890/1‑147 (MQ=255) tCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCg > 7:14628/1‑135 (MQ=255) tCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCg < 8:14628/135‑1 (MQ=255) aTGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAACGCGTTGAGGTACt > 8:293986/1‑149 (MQ=255) actcctcACCGTTACAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGATGCAGTACTtg > 8:292918/7‑149 (MQ=255) tcctcACCGTTACAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGATGCAGTACTtgtg > 6:355870/5‑149 (MQ=255) cGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCt < 3:103325/107‑1 (MQ=255) cGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCt > 4:103325/1‑107 (MQ=255) gggCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGATGCAGTACTtgtg > 4:149158/1‑148 (MQ=255) gggCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGATGCAGTACTTGTGc < 6:80243/149‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGATGCAGTACTTGTGc > 5:147916/1‑148 (MQ=255) tcACCGTTACAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGc < 6:81717/121‑1 (MQ=255) tcACCGTTACAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGc > 5:81717/2‑122 (MQ=255) gCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGt < 3:88215/120‑1 (MQ=255) gCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGt > 4:88215/1‑120 (MQ=255) ccGTTACAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGATGCAGTACTTGTGCAACgg < 7:292918/149‑1 (MQ=255) | GGAGTTGGCGTGCTGCCGATGTGGGCCTGTGGGTCGCGCCACTGGCTTGGCGTCCGCTACGTCCCCTGTTTTCGGTTCTTTACAGGCT‑GTTCTGTCGATTGAGGCCACACTTGGCCTGGCTACCACATCCC‑GATGGCGGGCACCGTTGTAACGGTGAGGAGTCCAAATGTCACATTCGTTAGCCGAGCACTACCATGAAATCCTGGTCGGTATTGGTGA‑AAACCCGCAGCGCGAAGGGCTTCTGGACACCCCCCGGCGTGCGGCAAAAGCGATGCAGTACTTGTGCAACGG > NC_002947/2859002‑2859292 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |