| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,885,727 | T→A | 5.4% | D51V (GAC→GTC) | PP_2541 ← | transcriptional factor‑like protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,885,727 | 0 | T | A | 5.4% | 219.5 / 2.6 | 74 | D51V (GAC→GTC) | PP_2541 | transcriptional factor‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/31); new base A (2/2); total (41/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.98e-01 | |||||||||||
GGTGGGGTAAGTGCGTCGGGTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATGGTGTGGCGGGTCGGGTGGCTGG > NC_002947/2885598‑2885874 | ggTGGGGTAAGTGCGTCGGGTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCTGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGttt < 7:129957/149‑1 (MQ=255) ggTAAGTGCGTCGGGTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCtgg < 3:204270/149‑1 (MQ=255) gTAAGTGCGTCGGGTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCtg > 7:215791/1‑147 (MQ=255) gTAAGTGCGTCGGGTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCtg < 8:215791/147‑1 (MQ=255) gTAAGTGCGTCGGGTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGACCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTCGCtggt > 8:160768/1‑149 (MQ=255) cGTCGGGTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATgg > 8:291773/1‑149 (MQ=255) cGTCGGGTTGCAGCTACTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATgg < 8:213999/149‑1 (MQ=255) gggTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTCGCTGGTGGTATGGCCCa < 7:160768/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCtg > 8:322137/1‑134 (MQ=255) gTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCtg < 7:322137/134‑1 (MQ=255) ttGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGc > 4:35460/1‑131 (MQ=255) ttGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGc < 3:35460/131‑1 (MQ=255) ttGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACgg > 1:273291/1‑149 (MQ=255) cAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTg > 5:226233/1‑149 (MQ=255) aGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACACGCCATCAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCTACGGTG‑CGTTTGATGGTGTTATGGCCCACGGTTg > 7:123532/1‑148 (MQ=255) cTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAggg < 4:44084/144‑1 (MQ=255) cTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAggg > 3:44084/1‑144 (MQ=255) gCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCtggt > 2:210840/1‑117 (MQ=255) gCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCtggt < 1:210840/117‑1 (MQ=255) cccAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCt > 6:87351/1‑145 (MQ=255) cccAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCt < 5:87351/145‑1 (MQ=255) cAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACt > 7:290427/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTg > 7:51151/1‑147 (MQ=255) ccGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGa < 7:315249/145‑1 (MQ=255) ccGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGa > 8:315249/1‑145 (MQ=255) cGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCa < 7:201989/149‑1 (MQ=255) gCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGATGGAGCTCATTccc > 1:300942/1‑149 (MQ=255) ccAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCg > 2:88963/1‑149 (MQ=255) cAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTgg > 1:25271/1‑132 (MQ=255) cAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTgg < 2:25271/132‑1 (MQ=255) cAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCgg > 3:128669/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTgg > 1:307115/1‑149 (MQ=255) cAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCggg > 6:34227/1‑144 (MQ=255) cAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCggg < 5:34227/144‑1 (MQ=255) cAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTggcg > 6:33159/1‑149 (MQ=255) gcgtAAGGCATGCCTTTACTGTGGCCCGGAGGCGGGAGCAGGGGGGCGAGCTCGAGCAGGTCGGGGGCGGGGGGG‑CGGTTGGTGGTGGTGTGGCCGACGGTTG‑GCGGGGCTGCCTGGAACGGGGTGGCGCTGCTTGGCGGGGGGCGGcc > 6:325107/4‑149 (MQ=255) ccATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGcc > 7:59740/1‑149 (MQ=255) cATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGtt < 4:71569/101‑1 (MQ=255) cATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGtt > 3:71569/1‑101 (MQ=255) aTAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCTGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGAGCTCGACGGTG‑AGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACTGATG‑TAAGGGCAGCATGAAACTCGGTGGAGCTCATTCCAGGGTGGCGGCCgg > 5:273848/1‑149 (MQ=255) tAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGTAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCggg < 4:128669/149‑1 (MQ=255) aaGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCggg > 1:344548/1‑148 (MQ=255) ggCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGACGCGCTCGACGGTg > 5:294336/1‑69 (MQ=255) ggCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGACGCGCTCGACGGTg < 6:299400/69‑1 (MQ=255) ggCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGACGCGCTCGACGGTg < 6:294336/69‑1 (MQ=255) ggCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGACGCGCTCGACGGTg > 5:299400/1‑69 (MQ=255) cATTCCTTTACTGTTGCACGGCAGCGGGAACATTGCGGCGACCTCCACCATGTCGCGGTCGACGGTT‑CGTTTTCTGGTGGTATGGCCCACGGTTGTTCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGgcagc < 1:88963/149‑1 (MQ=255) aTGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGa > 1:122422/1‑119 (MQ=255) aTGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGa < 2:122422/119‑1 (MQ=255) tGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAAc < 8:290427/149‑1 (MQ=255) gCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCgg < 5:3851/129‑1 (MQ=255) gCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCgg > 6:3851/1‑129 (MQ=255) tttACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGACCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCACATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACtt > 6:27976/1‑147 (MQ=255) tGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTGACGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAAATGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGAAg > 1:98285/1‑149 (MQ=255) gTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGtt > 3:310368/1‑149 (MQ=255) gCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCa > 2:263317/1‑110 (MQ=255) gCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGATGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCa < 1:263317/110‑1 (MQ=255) cACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGATCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCa > 1:313364/1‑149 (MQ=255) gAAGCGGTAACAGTGCGGCGAGCGCGTCCAGGTCGTGCTCGACGGTG‑CGGTTGCTGGTGGTAGGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTTGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTg < 8:123532/148‑1 (MQ=255) gAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAg < 7:133655/101‑1 (MQ=255) gAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAg > 8:133655/1‑101 (MQ=255) gAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTgg > 3:300428/1‑149 (MQ=255) aaGCGGGAACAGGGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGTTG‑CGTTGGCTGGTTGGATGGCCCCCGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGTGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTg < 6:273848/147‑1 (MQ=255) cGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTggcggg < 8:51151/149‑1 (MQ=255) aGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATGgt < 6:226233/149‑1 (MQ=255) ggcgAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATGGTGTGGc < 7:291773/149‑1 (MQ=255) gcgAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTggc < 3:91171/133‑1 (MQ=255) gcgAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTggc > 4:91171/1‑133 (MQ=255) gAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATGGTGTGGcggg < 2:273291/149‑1 (MQ=255) cTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATGGTGTGGcgggtcg < 2:344548/149‑1 (MQ=255) tCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATGGTGTGGcgggtcgg > 5:123067/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATg > 3:337840/1‑131 (MQ=255) ccAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATg < 4:337840/131‑1 (MQ=255) gTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATGGTGTGGCGGGTCGGGTGGCTgg > 1:343610/1‑149 (MQ=255) | GGTGGGGTAAGTGCGTCGGGTTGCAGCTGCTGCGCTTCGCCCAGGCTCAAGCCCGGTTGCCAGTACCAGCCATAAGGCATGCCTTTACTGTTGCACTGAAGCGGGAACAGTGCGGCGAGCTCGACCAGGTCGCGCTCGACGGTG‑CGTTTGCTGGTGGTATGGCCCACGGTTG‑TCAGGGCAGCCTGCAACTGGGTGGAGCTCATTCCCGGGTGGCGGCCGGGCAGCAACTTGAGCAGTTGCCACTGGCGGGCGATGGTGTGGCGGGTCGGGTGGCTGG > NC_002947/2885598‑2885874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |