| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,260,347 | G→C | 7.6% | T158S (ACC→AGC) ‡ | PP_2857 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,260,347 | 0 | G | C | 7.6% | 191.0 / 3.6 | 63 | T158S (ACC→AGC) ‡ | PP_2857 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/28); new base C (2/3); total (31/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTACGCTATTAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCAATGCTGATGCTCAGTGCGTTGGCTTGCTGGGTGTTGG > NC_002947/3260202‑3260494 | cGTACGCTATTAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTgg < 7:115830/146‑1 (MQ=255)cGTACGCTATTAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAg > 5:234431/1‑149 (MQ=255) gCTATTAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGAcc < 6:128018/149‑1 (MQ=255) tATTAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCAGGTCACTACCAGTGAccag > 2:341061/1‑147 (MQ=255) tATTAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTAGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCATCGGCTACCGGTGAAGGCCAGGTCACTACCAGTGAc > 7:139465/1‑146 (MQ=255) ttAGGTTTAGTGTCGTTGTTAAATGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCAGGTCACTACCAGTGAcca < 8:139465/146‑2 (MQ=255) ttAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTg < 8:172541/147‑1 (MQ=255) ttAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCAGGTCACTACCAGTGAccag < 2:279227/147‑3 (MQ=255) aGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCAGGTCACTACCAGTGACCAGGcc < 1:341061/148‑2 (MQ=255) tCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCctgctg < 7:134996/149‑1 (MQ=255) ttCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGaa < 3:209580/149‑1 (MQ=255) ttCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGaa < 6:297177/149‑1 (MQ=255) tgattAACTGCCGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGaa < 6:234431/146‑1 (MQ=255) tGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGtt > 1:266817/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGtt > 2:179846/1‑147 (MQ=255) cAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGtt > 2:174358/1‑147 (MQ=255) cAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGtt < 1:179846/147‑1 (MQ=255) cAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGtt < 1:174358/147‑1 (MQ=255) gggTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTc < 1:356921/149‑1 (MQ=255) cgACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGttgttg < 8:327371/149‑1 (MQ=255) tCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCACGTCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGcc > 1:238924/1‑107 (MQ=255) tCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGcc < 2:238924/106‑1 (MQ=255) tCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACg > 2:25337/1‑149 (MQ=255) tCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACg > 8:275096/1‑149 (MQ=255) tCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACg > 8:217284/1‑149 (MQ=255) aaGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGtt > 1:166224/1‑149 (MQ=255) ttGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGtt > 5:130443/1‑143 (MQ=255) ttGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGAGCCACGtt < 6:130443/143‑1 (MQ=255) ggCCATTCGGTTTCCCACCCCCGCAC‑TCTCCTTCAACTGGAACACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCAGGTCACTGGTAGTGACCTTGCGAAAGCATGCTGGATTGGCAGTTGCTCCTGAGTTGGTGATCAGCGACACGTTCTGTTGCa > 7:9399/1‑149 (MQ=255) aTTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAg > 3:142127/1‑149 (MQ=255) aTTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAg > 7:118427/1‑149 (MQ=255) aTTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTAAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAg > 2:316861/1‑149 (MQ=255) ggTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTTGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCTTTGAAGGCCTGGTCACTGTTAGTGACCTGGAGATAGCCTTCTTGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGAc < 3:299929/148‑1 (MQ=255) tttCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGTCTACCGGTGAAGGCCTTGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCt < 6:182170/149‑1 (MQ=255) cccACCCCGGCAG‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCAGTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTgtc > 6:173983/1‑149 (MQ=255) ccACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGAcc < 5:94911/71‑1 (MQ=255) ccACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGAcc > 6:94911/1‑71 (MQ=255) cACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTgtcgt > 1:314396/1‑149 (MQ=255) cACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGAGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTGGTTGATCAGCGCCACCTTCAGTTGCATGAGGACGCTgtcgt > 7:79680/1‑149 (MQ=255) ccccGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTgtcgtc > 4:28976/1‑148 (MQ=255) cGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATg < 1:316861/149‑1 (MQ=255) cGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATg < 8:302879/149‑1 (MQ=255) tGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTgtcgt > 1:197642/1‑136 (MQ=255) tGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTgtcgt < 2:197642/136‑1 (MQ=255) tGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCgg > 1:93676/1‑149 (MQ=255) ggTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGt > 2:80381/1‑149 (MQ=255) gTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCg < 4:142127/146‑1 (MQ=255) tCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGt < 4:304187/113‑1 (MQ=255) tCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGt > 3:304187/1‑113 (MQ=255) cAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTtgt < 2:266817/148‑1 (MQ=255) cAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTtgt < 7:275096/148‑1 (MQ=255) gATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCaa < 2:166224/149‑1 (MQ=255) cccTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGtt > 4:349469/1‑134 (MQ=255) cccTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGtt < 3:349469/134‑1 (MQ=255) ccTCGTCTACCGGTGAAGGCCTGGTCTCTGGTAGTGACCGGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTGGTTGATCAGCGGCAGGTTCTGTTGCATGAGGAGGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCAGCAATGCTGAt < 8:9399/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGATGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCAATGCTGAt > 1:108054/1‑149 (MQ=255) tCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCAATGCTg < 2:24304/145‑1 (MQ=255) tCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCAATGCTg > 1:24304/1‑145 (MQ=255) tACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAg < 7:61710/68‑1 (MQ=255) tACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAg > 8:61710/1‑68 (MQ=255) gTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCAATGCTGATGCTCAGTGCGtt < 7:217284/149‑1 (MQ=255) cTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTGAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCTATGCTGATGCTGAGTGCGTTggctggct > 4:220224/1‑149 (MQ=255) cTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTtgt > 6:9675/1‑115 (MQ=255) cTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTtgt < 5:9675/115‑1 (MQ=255) gTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCAATGCTGATGCTCAGTGCGTTGGCTTGCTGGGTGTTg < 8:118427/147‑1 (MQ=255) gTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCAATGCTGATGCTCAGTGCGTTGGCTTGCTGGGTGTTg < 2:93676/147‑1 (MQ=255) gTAGTGACCTCGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCACCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCAGTTGCATGAGGACGCTGTCGACGATGCTTTGCCGTTGTGCACCAATGCTGATGCGCACTCCCTTGGCTTGCTGGGAGTTgg > 2:274306/1‑148 (MQ=255) | CGTACGCTATTAGGTTAAGTGTCGTTCTTAACTGCAGGGTCAATCCGCGACCCGGATGCTCAAGGTGTTGGCCATTCGGTTTCCCACCCCGGCAC‑TCTGGTTCAACTGGATCACCCCTCGGCTACCGGTGAAGGCCTGGTCACTGGTAGTGACCTGGCGATAGCCTGCTGGAATGTCAGTTGCTCCTGAGTTGTTGATCAGCGCCACGTTCTGTTGCATGAGGACGCTGTCGTCGATGCTTTGCGGTTGTGCACCAATGCTGATGCTCAGTGCGTTGGCTTGCTGGGTGTTGG > NC_002947/3260202‑3260494 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |