| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,556,081 | G→T | 9.1% | P166P (CCG→CCT) | PP_3140 → | group 2 family glycosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,556,081 | 0 | G | T | 9.1% | 194.5 / 9.2 | 66 | P166P (CCG→CCT) | PP_3140 | group 2 family glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/30); new base T (2/4); total (32/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
CGTGCGCCACCTGGCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGAT > NC_002947/3555934‑3556227 | cGTGCGCCACCTGGCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCgg < 6:83706/149‑1 (MQ=255)cGTGCGCCACCTGGCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCgg > 5:83706/1‑149 (MQ=255) cgcCACCTGGCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCTGCCgg < 1:319539/149‑1 (MQ=255) gcCACCTGGCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGt > 2:62258/1‑149 (MQ=255) cTGGCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTgg > 3:64030/1‑149 (MQ=255) cTGGCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTgg > 3:59182/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCTGCCGGTGcacgcat < 7:70640/149‑7 (MQ=255) cAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAg > 8:134889/1‑149 (MQ=255) aGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAgg < 4:83484/149‑1 (MQ=255) gccCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAgg > 2:324504/1‑149 (MQ=255) ccGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGtt < 8:93001/149‑1 (MQ=255) gatgtggtCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGTCGAGGGGTCTATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGAACTTGCCCTCCAGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGt < 1:220273/123‑1 (MQ=255) gAGGTGGTCATCGTGGTGGATGTCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGc > 7:53102/1‑149 (MQ=255) gtCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGtt > 7:139219/1‑149 (MQ=255) tCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGttt > 5:302390/1‑149 (MQ=255) tCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGcc < 6:188334/149‑1 (MQ=255) ggtggATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGc < 4:229610/149‑1 (MQ=255) gtggATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGc < 7:311634/148‑1 (MQ=255) tggATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCgg < 8:53102/149‑1 (MQ=255) ccGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCaa < 6:302390/148‑1 (MQ=255) ccGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCaa < 4:59182/148‑1 (MQ=255) ccGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCaa < 4:64030/148‑1 (MQ=255) gACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGaa > 8:321088/1‑149 (MQ=255) gACGGCCAGGGGGGCGAGTGGGCGAGCGACTGCCGGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGGACTGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGaa < 5:4863/149‑1 (MQ=255) aCTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAAc < 3:217810/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAg > 2:24219/1‑124 (MQ=255) ccAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAg < 1:24219/124‑1 (MQ=255) ccAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTg < 8:139219/148‑1 (MQ=255) gCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCa > 6:205576/1‑149 (MQ=255) gCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCa > 3:119909/1‑149 (MQ=255) ggCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTg > 6:189309/1‑133 (MQ=255) ggCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTg < 5:189309/133‑1 (MQ=255) gCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGc < 2:151583/97‑1 (MQ=255) gCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGc > 1:151583/1‑97 (MQ=255) cGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTgg < 7:134889/149‑1 (MQ=255) gATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGt < 7:293750/107‑1 (MQ=255) gATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGt > 8:293750/1‑107 (MQ=255) gACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGgcgc < 6:350640/148‑1 (MQ=255) aCTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGgcgcgc > 6:251495/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCtgc > 3:187053/1‑149 (MQ=255) ccgcTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCtgccat < 1:62258/149‑1 (MQ=255) tGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCtgccatgcc > 2:290767/1‑148 (MQ=255) gCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCaa < 4:119909/149‑1 (MQ=255) aCGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTgg > 4:8593/1‑132 (MQ=255) aCGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTgg < 3:8593/132‑1 (MQ=255) gCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGAt < 4:187053/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGgc > 6:108378/1‑149 (MQ=255) cgcccgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGATTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCggg > 3:29476/1‑149 (MQ=255) ccgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCAt > 4:73295/1‑149 (MQ=255) cgGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATg < 3:73295/149‑1 (MQ=255) ggTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGGTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCATGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATgg > 2:181781/1‑149 (MQ=255) gTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGc > 4:69026/1‑149 (MQ=255) aGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTc > 7:255048/1‑149 (MQ=255) gCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCt < 1:324504/149‑1 (MQ=255) tGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTgg > 5:364793/1‑149 (MQ=255) tGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTgg < 4:56569/99‑1 (MQ=255) tGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTgg > 3:56569/1‑99 (MQ=255) gATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATg < 6:302468/130‑1 (MQ=255) gATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATg > 5:302468/1‑130 (MQ=255) gATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATc > 5:6975/1‑149 (MQ=255) aTGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGAt < 3:69026/147‑1 (MQ=255) cccagCACCTGCCGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCt > 4:291083/5‑147 (MQ=255) cccagCACCTGCCGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGa > 4:296096/5‑149 (MQ=255) cccagCACCTGCCGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGa < 3:296096/145‑1 (MQ=255) cccagCACCTGCCGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGa < 3:291083/145‑1 (MQ=255) cACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCa > 4:250548/1‑136 (MQ=255) cACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCa < 3:250548/136‑1 (MQ=255) ccGGCAGGTGGTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGAt < 8:255048/149‑1 (MQ=255) | CGTGCGCCACCTGGCTCAGCGGCCGCCCGAGGTGGTCATCGTGGTGGATGCCGACTGCCAGGTGGGCGAGGGGGCGATCGACTGCCTGGCGCGCCGCTGCCACGCACTTGCCCGCCCGGTACAGTCGCTGTATCTGATGCGTGCACCGGCAGGTGCTGGGTTGAGGGTGCAGGTTGCCGAGTTTGCCTGGCGGGTCAAGAACCTGGTGCGGCCACGTGGCTGGGCGCGCCTGGGCCTGCCATGCCAACTGATGGGCGCGGGCATGGCGTTCGGCTGGCACGATCTGAGTCTGAT > NC_002947/3555934‑3556227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |