Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,948,139 | G→A | A112V (GCC→GTC) | rho ← | transcription termination factor Rho |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,948,139 | 0 | G | A | 97.4% | 246.0 / ‑2.9 | 79 | A112V (GCC→GTC) | rho | transcription termination factor Rho |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base A (32/44); total (32/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.10e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACGCAG > NC_002947/5948004‑5948281 | aaGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGT‑AACGCTc < 2:192574/149‑1 (MQ=255) aaGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTc > 7:52621/1‑149 (MQ=255) aaGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTc < 6:422986/149‑1 (MQ=255) aGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAg < 4:33475/140‑1 (MQ=255) aGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACATTCAGCAGGACGCAGT‑AACGCTcc > 2:376464/1‑149 (MQ=255) aGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTAGCGGTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAg > 3:33475/1‑140 (MQ=255) gTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTccc < 8:21135/149‑1 (MQ=255) cTCGGTGGAGCCGTTACGGTCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTGCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGAGCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCcct < 7:240448/148‑1 (MQ=255) cTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCcctt < 3:159130/149‑1 (MQ=255) tCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCccttc > 5:125300/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCAATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCccttc > 2:205188/1‑149 (MQ=255) ggTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCccttc < 6:125300/147‑1 (MQ=255) gTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCta > 2:322200/1‑139 (MQ=255) gTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCccttcctt < 1:13002/149‑1 (MQ=255) tGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCcttccttc < 1:50658/149‑1 (MQ=255) gAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCgg > 8:355275/1‑149 (MQ=255) gCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTg < 5:332361/149‑1 (MQ=255) cGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTggg > 4:228872/1‑149 (MQ=255) gTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGc < 7:266272/149‑1 (MQ=255) gTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGc < 8:52621/149‑1 (MQ=255) gTTACAGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGAGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGCTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGc > 2:110993/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGATCAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACATGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCgg < 8:90866/148‑1 (MQ=255) gCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCtt > 2:345993/1‑149 (MQ=255) ccATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCccttc > 5:32939/1‑127 (MQ=255) ccATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCccttc < 6:32939/127‑1 (MQ=255) ccATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGAAGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCgg < 1:422272/140‑1 (MQ=255) ccATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCACGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTACGGGCGGTCGAAGTTGAAGGTATCCACCTTCAGCAGGACGAACT‑AACCCTCCCCATACGTCGGTGGGCGGaagatccg > 2:422272/1‑141 (MQ=255) cATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGcc < 5:47554/147‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGAt < 1:166044/147‑1 (MQ=255) aGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGgt < 1:276934/149‑1 (MQ=255) ttGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGcc > 5:143047/1‑149 (MQ=255) gTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATTGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCg < 5:270067/148‑1 (MQ=255) gTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACACTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGcc < 5:150938/147‑1 (MQ=255) ttCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCcgac < 1:208814/134‑1 (MQ=255) agggAAAATCGGCGTTACGTTTTTGAAAACGAATTTGTTTTTCGCGTTTTACCGGCGGTCGAATTTTATTGTATCGACCTTTAGCATGACCAATTCAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGt < 1:320916/147‑1 (MQ=255) gcggcgTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTgg < 3:405068/109‑1 (MQ=255) gcggcgTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTgg > 4:405068/1‑109 (MQ=255) ggcgTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGa > 7:126223/1‑148 (MQ=255) aGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAAcggc < 6:387202/148‑1 (MQ=255) aGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAAcggc < 6:143047/148‑1 (MQ=255) gAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATctggc < 4:84844/149‑1 (MQ=255) gAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATctgg < 3:228872/148‑1 (MQ=255) aaCAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCTGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCGCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATctggct < 7:381556/149‑1 (MQ=255) aaCAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATctggct > 1:67245/1‑149 (MQ=255) aaCAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATctggct < 4:8916/149‑1 (MQ=255) ggATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGc < 7:187919/149‑1 (MQ=255) tCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGc > 5:63420/1‑146 (MQ=255) ttcGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGa > 3:72994/1‑148 (MQ=255) cgcgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCTGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCAGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGa < 3:75830/146‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGatat > 2:183179/1‑149 (MQ=255) gcgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTc < 3:109587/98‑1 (MQ=255) gcgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTc > 4:109587/1‑98 (MQ=255) cgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCg > 5:235799/1‑149 (MQ=255) cgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCg > 2:216317/1‑149 (MQ=255) ggCGGTCTTAGTTGATGGTATCGACCTGCAGCAGGACGATGT‑AACGCTCACCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGAGGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGACACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGggccg < 1:110993/149‑1 (MQ=255) ggCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGggccg < 8:126223/149‑1 (MQ=255) ggTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTTTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGggccggc > 5:329175/1‑148 (MQ=255) ggTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGat > 6:324757/1‑133 (MQ=255) ggTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGat < 5:324757/133‑1 (MQ=255) tCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAg > 5:349861/1‑149 (MQ=255) gAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAgg > 6:301487/1‑148 (MQ=255) aaGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAgg > 5:237453/1‑147 (MQ=255) aGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAg < 4:72994/149‑1 (MQ=255) tGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGAc > 7:179716/1‑149 (MQ=255) taTGGTATGGAGCTTCAGCATGTCGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGTCTGATCTTGCGGACGATGGTGTCGCCTGTACGCAGTTTGAAAGGTCGGATCTGGCTGGGCGTGACATTGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGAc < 8:273130/147‑1 (MQ=255) gATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGAc < 6:349861/148‑1 (MQ=255) gATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGAc < 1:183179/148‑1 (MQ=255) aTGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGc < 6:235799/149‑1 (MQ=255) tGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGAACTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGACTGGGCCGGCCAGGTAGGAc > 7:273130/1‑146 (MQ=255) gTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAGCGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCAt < 1:205188/148‑1 (MQ=255) gTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATc < 1:216317/149‑1 (MQ=255) aTCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCgaga < 5:246429/110‑1 (MQ=255) aTCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCgaga > 6:246429/1‑110 (MQ=255) aTCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTGCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTAGGCAGGTTGAACCGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACAGAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAg > 6:89504/1‑149 (MQ=255) tCGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGc > 7:99015/1‑149 (MQ=255) cGACCTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGc < 6:63420/148‑1 (MQ=255) cTTCAGCAGGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAAc < 8:99015/149‑1 (MQ=255) agcagGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACGCa < 2:67245/148‑1 (MQ=255) agcagGACGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACGCAg < 8:214281/149‑1 (MQ=255) | AAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGT‑AACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACGCAG > NC_002947/5948004‑5948281 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |