| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,999,566 | Δ1 bp | 6.3% | coding (101/1428 nt) | PP_5256 → | cyclic nucleotide‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,999,566 | 0 | G | . | 6.3% | 200.7 / 6.8 | 63 | coding (101/1428 nt) | PP_5256 | cyclic nucleotide‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/28); new base . (2/2); total (33/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
CCTGCTCTATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGG > NC_002947/5999419‑5999708 | ccTGCTCTATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTgg > 8:212509/1‑149 (MQ=255) tctATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTGGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCACCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCa > 5:249211/1‑148 (MQ=255) tATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCAt > 8:267640/1‑147 (MQ=255) ttACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCa < 1:311630/147‑1 (MQ=255) ctacCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAgcgcg > 4:249993/1‑149 (MQ=255) acaTCCCTCCCCTCCCCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTg < 6:249211/149‑1 (MQ=255) gCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTg < 2:228848/149‑1 (MQ=255) ccgctgccctcACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGGTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTg < 6:176442/143‑1 (MQ=255) ccctcACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTc < 3:249993/149‑1 (MQ=255) cTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGAt < 7:212509/149‑1 (MQ=255) tGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATg > 1:221378/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATg > 8:181655/1‑149 (MQ=255) gTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTc > 8:265948/1‑130 (MQ=255) gTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTc < 7:265948/130‑1 (MQ=255) tcCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTgg > 1:170294/1‑100 (MQ=255) tcCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTgg < 2:170294/100‑1 (MQ=255) ccccGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCg > 7:10133/1‑149 (MQ=255) cGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCt > 7:228671/1‑148 (MQ=255) ttgCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAac > 6:278617/1‑148 (MQ=255) ggTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCAccgcc > 4:326738/1‑149 (MQ=255) gcgcCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTg < 8:228671/148‑1 (MQ=255) ccTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGc < 2:198414/129‑1 (MQ=255) ccTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGc > 1:198414/1‑129 (MQ=255) cgatcTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCT‑GCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCcgac < 5:155088/143‑1 (MQ=255) cgatcTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCT‑GCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCcgac < 7:203751/143‑1 (MQ=255) aTCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCa > 8:135023/1‑96 (MQ=255) aTCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCa < 7:135023/96‑1 (MQ=255) aTCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGACGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCcgacga > 4:79412/1‑149 (MQ=255) cTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCT‑GCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCcgac > 8:203751/1‑140 (MQ=255) cTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCT‑GCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCcgac > 6:155088/1‑140 (MQ=255) gACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTcgcg > 1:196195/1‑149 (MQ=255) ccTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCACGCTGCAACCCCAGCCGTGGCCCGACGATGTCTCgcgc > 5:204649/1‑148 (MQ=255) cTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCGGACGATGTCTCGCGCaa > 6:193707/1‑149 (MQ=255) tCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAAc > 4:94657/1‑149 (MQ=255) gTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAAcc < 3:326738/148‑1 (MQ=255) gTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCt > 3:280386/1‑149 (MQ=255) tGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCaa < 6:106163/113‑1 (MQ=255) tGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCaa > 5:106163/1‑113 (MQ=255) cTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCGGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGa < 7:267640/148‑1 (MQ=255) aaCTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGa < 7:182332/78‑1 (MQ=255) aaCTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGa > 8:182332/1‑78 (MQ=255) aaCTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGcc > 5:149015/1‑118 (MQ=255) aaCTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGcc < 6:149015/118‑1 (MQ=255) aaCTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAAc < 7:194770/137‑1 (MQ=255) aaCTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAAc > 8:194770/1‑137 (MQ=255) aCTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACgg < 8:10133/149‑1 (MQ=255) aTCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTAt < 7:181655/148‑1 (MQ=255) tCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGtc > 5:354751/1‑122 (MQ=255) tCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGtc < 6:354751/122‑1 (MQ=255) cccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTgg < 8:21769/148‑1 (MQ=255) ccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGAt < 5:84839/116‑1 (MQ=255) ccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGAt > 6:84839/1‑116 (MQ=255) ccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTgg < 8:33371/147‑1 (MQ=255) ccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTgg > 7:33371/1‑147 (MQ=255) ccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGc > 8:120852/1‑148 (MQ=255) ccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGc > 8:238364/1‑148 (MQ=255) ccATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGc > 2:160409/1‑148 (MQ=255) caaTTCAGCGCCATGCATGTCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGcc < 6:204649/147‑1 (MQ=255) aTTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAAc > 7:253070/1‑126 (MQ=255) aTTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAAc < 8:253070/126‑1 (MQ=255) aTTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCAt < 2:221378/149‑1 (MQ=255) aTTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCAt < 7:238364/149‑1 (MQ=255) cgcCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCTGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtg > 6:105826/1‑149 (MQ=255) aTGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCtggtgg < 2:196195/149‑1 (MQ=255) | CCTGCTCTATTACTACCCACAGCCCTCCCCTCACCCCCGAGATCACCATGCTGGCGTTCATCCAGTCGTCCCCGTTGTTGCTCGGTTGCGCCTTGATCCTGCTCGACCTCGTGCTTTGGCAACTGATCCCCATTCAGCGCCATGCCTGGCGCATCAGCGCGCGCCTGGTGATCTTCCTGCTGTTCAGCTCAGTGCTGATGGCCGCTGGCATGAGCCCGCTGCAACCACCGCCGTGGCCCGACGATGTCTCGCGCAACCTGATGGCCACGGTATTGGCCATCGGCTGGTGG > NC_002947/5999419‑5999708 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |