| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,000,258 | Δ1 bp | 5.5% | intergenic (‑140/‑82) | PP_0861 ← / → PP_0862 | outer membrane ferric siderophore receptor/PKHD‑type hydroxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,000,258 | 0 | C | . | 5.5% | 237.0 / 6.7 | 73 | intergenic (‑140/‑82) | PP_0861/PP_0862 | outer membrane ferric siderophore receptor/PKHD‑type hydroxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/31); new base . (2/2); total (40/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
CTGGCGCATTGCAAAGAACCTTCCCCAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGACGCTGATGAACTGGCCCGTATCCGCGA > NC_002947/1000110‑1000395 | cTGGCGCATTGCAAAGAACCTTCCCCAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTc < 7:4574/149‑1 (MQ=255) gcATTGCAAAGAACCTTCCCCAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAg > 1:185228/1‑149 (MQ=255) aGAACCTTCCCCAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATg < 2:185228/149‑1 (MQ=255) aGAACCTTCCCCAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAAATTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATg > 1:231112/1‑149 (MQ=255) ctccTTCCCTAAGGTATTGATGCTGTGTATGTTTATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACATTTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATgg < 3:231031/146‑1 (MQ=255) cTTCCCCAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCt > 4:170088/1‑149 (MQ=255) cTTCCCCAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCt > 5:224595/1‑149 (MQ=255) cTTCCCAAAGGTATTTAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAAAAATTAACAGTCGAAACCAATCCTAAAAAATATACAATCTTTAAAAATTATATTTACGGTTTCATGACGCTCAA‑ACGTCTTAAGCGGCTAATcggag > 4:231031/1‑146 (MQ=255) ccccAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCtt < 1:110738/147‑1 (MQ=255) cccAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTATAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTtgtg > 1:182518/1‑149 (MQ=255) cccAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTtgtg < 5:8388/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTtgtg > 3:193170/1‑148 (MQ=255) ccAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTtgtg > 6:232512/1‑148 (MQ=255) cAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAgcgg < 2:12897/132‑1 (MQ=255) cAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAgcgg > 1:12897/1‑132 (MQ=255) aGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTTCCATTCGTGAAGAAATTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGc < 2:231112/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAgg > 8:117971/1‑148 (MQ=255) gATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTATAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCaa < 2:182518/148‑1 (MQ=255) aaTGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCAt < 7:117971/148‑1 (MQ=255) aTGTAATCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAATAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCAtt < 5:232512/148‑1 (MQ=255) aTGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCAtt < 4:193170/148‑1 (MQ=255) aTGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTg > 6:25318/1‑149 (MQ=255) tGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGATGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTTCGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCtt > 1:245070/1‑118 (MQ=255) tGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTTCGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCtt < 2:245070/118‑1 (MQ=255) aaGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAgg < 5:349801/130‑1 (MQ=255) aaGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAgg > 6:349801/1‑130 (MQ=255) aGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑CCGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGccg > 4:202794/1‑148 (MQ=255) gCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACATCTTAAGCGGCGAATGGGGCtt < 2:199984/113‑1 (MQ=255) gCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACATCTTAAGCGGCGAATGGGGCtt > 1:199984/1‑113 (MQ=255) ttttGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTAGAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTaaaa < 1:110879/122‑1 (MQ=255) ttttGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTAGAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTaaaa > 2:110879/1‑122 (MQ=255) aCTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTAc < 4:112479/143‑1 (MQ=255) aCTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTAc > 3:112479/1‑143 (MQ=255) cTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTcc > 3:327450/1‑148 (MQ=255) tAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTTAAGACGT‑TTCAgcggca > 1:182892/1‑91 (MQ=38) tAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTTAAGACGT‑TTCAgcggca < 2:182892/92‑2 (MQ=38) tAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGTAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCt > 1:249690/1‑148 (MQ=255) tAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCt > 2:314788/1‑148 (MQ=255) aaTTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTTAAGACGT‑TTCAgcggc > 8:167178/1‑87 (MQ=38) aaTTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTTAAGACGT‑TTCAgcggc < 7:167178/87‑1 (MQ=38) aTTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTgtgt < 6:270133/101‑1 (MQ=255) aTTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTgtgt > 5:270133/1‑101 (MQ=255) tCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGt < 3:253724/141‑1 (MQ=255) gTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAATGGTGCTGTTGCCa > 2:241184/1‑149 (MQ=255) tACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTa < 7:215534/90‑1 (MQ=255) tACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTa > 8:215534/1‑90 (MQ=255) aTTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCAtgctgc < 5:25318/149‑1 (MQ=255) aTTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCAtgc < 7:183437/146‑1 (MQ=255) aTTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCAtgc > 8:183437/1‑146 (MQ=255) ttCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATgctgct > 1:211911/1‑149 (MQ=255) ttCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCATTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATgctgct > 1:217513/1‑149 (MQ=255) cGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCtt < 6:224595/148‑1 (MQ=255) gTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTca > 1:84204/1‑149 (MQ=255) aagaaTTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACAt > 7:40560/1‑149 (MQ=255) tACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGc > 2:227805/1‑149 (MQ=255) aCAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGc < 2:211911/148‑1 (MQ=255) tttACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCttt > 5:278704/1‑97 (MQ=255) tttACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCttt < 6:278704/97‑1 (MQ=255) tttACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGc > 5:310972/1‑120 (MQ=255) tttACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGc < 6:310972/120‑1 (MQ=255) tttACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTc > 7:272228/1‑148 (MQ=255) ttACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGa > 3:6005/1‑149 (MQ=255) cAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCa < 5:96206/135‑1 (MQ=255) cAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCa > 6:96206/1‑135 (MQ=255) aTTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGACGCtg < 2:249690/149‑1 (MQ=255) ttACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGACGCtgat > 5:141631/1‑143 (MQ=255) ttACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGACGCtgat < 6:141631/143‑1 (MQ=255) cGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTg > 6:335622/1‑96 (MQ=255) cGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTg < 5:335622/96‑1 (MQ=255) ggTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGACGCTGATGAACTGGccc < 8:40560/149‑1 (MQ=255) tttCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGACGCTGATGAACTGGCCCg > 6:148592/1‑148 (MQ=255) gCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACAttt < 1:136321/77‑1 (MQ=255) gCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACAttt > 2:136321/1‑77 (MQ=255) cGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGACGCTGATGAACTGGCCCGTATCCGCGa < 1:314788/149‑1 (MQ=255) | CTGGCGCATTGCAAAGAACCTTCCCCAAGGTATTGAGGCGGTGGATCTTAATGTAAGCAATTTTGACTAACAATTGAGAGTCGTTACCATTCGTGAAGAATTTACAATCTTTACAATTTGTCTTTACGGTTTCATGCCGCTGAA‑ACGTCTTAAGCGGCGAATGGGGCTTGTGTAGCGTAAAAGGGAATCAATATCATTGCGCCTTTACATTTCCTAACGGTGCTGTTGCCATGCTGCTTCACATTCCAGGCCTGTTCGACGCTGATGAACTGGCCCGTATCCGCGA > NC_002947/1000110‑1000395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |