New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 2258928 | 90 (1.700) | 5 (0.100) | 5/242 | NT | 5.2% | coding (592/1005 nt) | asd | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 2258950 | 98 (1.950) | coding (614/1005 nt) | asd | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
AGTGATGGCCGCGTTGGCGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCGGCGATAGCTTCAGTGTGGC > NC_002947/2258789‑2259076 | aGTGATGGCCGCGTTGGCGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGtg < 7:152374/149‑1 (MQ=255) ccGCGTTGGCGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCcgac < 5:353932/149‑1 (MQ=255) ccGCGTTGGCGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCcgac > 6:353932/1‑149 (MQ=255) cgcgTTGGCGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCcgac > 5:28990/1‑148 (MQ=255) cgcgTTGGCGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCcgac < 6:28990/148‑1 (MQ=255) gCGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAggg > 5:363096‑M2/1‑146 (MQ=255) cGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAgggc > 4:175369‑M2/1‑145 (MQ=255) cgcAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCACCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCtgctcgtcggcagcaccgacctgggccagcagg < 4:73039‑M1/147‑34 (MQ=255) aaGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCtgctcgtcggcagcaccgacctgggccagcaggttgaa > 4:218101‑M1/1‑111 (MQ=255) aaGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCtgctcgtcggcagcaccgacctgggccagcaggttgaa < 3:218101‑M1/149‑39 (MQ=255) ggCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAg > 4:19874‑M2/1‑131 (MQ=255) ggCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGa < 2:88422/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTCAGCGAGCGGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGcgccgc < 8:78646/149‑1 (MQ=255) gCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAg > 2:19999/1‑102 (MQ=255) cgctCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGc > 4:262843/4‑120 (MQ=255) cGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGc < 3:262843/120‑1 (MQ=255) gTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCGGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGt < 2:27485/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGt > 6:147299/1‑149 (MQ=255) gCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGc < 3:68379/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAgc > 2:106554/1‑134 (MQ=255) cGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAgc < 1:106554/134‑1 (MQ=255) 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ccGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCtgctcgtcggcagcaccgacctgggccagca < 8:260470‑M1/114‑32 (MQ=255) ccGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTgcggg > 5:137985/1‑147 (MQ=255) ccGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGcgcg > 3:247177/1‑149 (MQ=255) ccGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGcgcg > 8:30899/1‑149 (MQ=255) ccGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCC < 2:219639‑M1/83‑1 (MQ=255) ccGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCC > 1:219639‑M1/1‑83 (MQ=255) ggCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTa > 6:216065/1‑149 (MQ=255) gCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTAc > 5:255858/1‑149 (MQ=255) gCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTAc > 2:272581/1‑149 (MQ=255) aaCCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTActgc > 4:46013/1‑149 (MQ=255) ccgccgAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTActgctg < 6:270258/149‑1 (MQ=255) 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cccgcccgCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCctgaactgaa < 5:147299/148‑1 (MQ=255) ccgcccgcTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGc > 1:223165/1‑112 (MQ=255) ccgcccgcTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGc < 2:223165/112‑1 (MQ=255) ccgcccgcTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCctgaactgaa < 5:109121/147‑1 (MQ=255) ccgcccgcTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCctgaactg > 6:109121/1‑145 (MQ=255) cccgcTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTgg > 6:45045/1‑128 (MQ=255) 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ccGCCAGGGGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCgg < 8:77508/149‑1 (MQ=255) tGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGGGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTc < 6:137985/149‑1 (MQ=255) gctttCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGt < 1:41488/116‑1 (MQ=255) gCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGt > 2:41488/1‑119 (MQ=255) gCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGtt < 2:28691/143‑1 (MQ=255) gCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCg < 5:216065/148‑1 (MQ=255) gCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCg < 8:310712/148‑1 (MQ=255) gCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTCCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGtt > 1:28691/1‑143 (MQ=255) aTTCAACCTCCTCTACAAGCTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGCAGCGCCGCCTGGTCAGCTAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCGGc > 8:107592/1‑148 (MQ=255) ttCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAgggccagcaggttgaatgccacctggcggtcgaagaagcgcggctccagcgggcgggcattgagcagttcggcggtttgccgggccagctcgctgaccgcttcacggcctt > 4:218101‑M2/1‑38 (MQ=255) ttCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAgggccagcaggttgaatgccacctggcggtcgaagaagcgcggctccagcgggcgggcattgagcagttcggcggtttgccgggccagctcgctgaccgcttcacggcctt < 3:218101‑M2/149‑112 (MQ=255) aaCCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGACAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGAGAGCTCTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCTGCGATac > 8:58447/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAgggccagcaggttgaatgccacctggcggtcgaagaagcgcggctccagcgggtgggcattgagcagttcggcggtttgccgggccagctcgctgaccgcttcacggccttgcg < 4:73039‑M2/147‑115 (MQ=255) tgctgGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAgggccagcaggttgaatgccacctggcggtcgaagaagcgcggctccagcgggcgggcattgagcagttcggcggtttgccgg > 7:260470‑M2/1‑31 (MQ=255) ctgGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCGGCGATAGCTTCa < 6:364091/148‑1 (MQ=255) ggCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCGGCGATAGCTTCAgtg > 4:219005/1‑149 (MQ=255) gCCCtgctcgtcggcagcaccgacctgggccagcaggttgaatgccacctggcggtcgaagaagcgcggctccagcgggcgggcattgagcagttcggcggtttgccgggccagctcgctgaccgcttcacggccttgcgcagacaccg > 4:175369‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCATTACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCGGCGATAGCTTCAgtg > 1:218327/1‑149 (MQ=255) ccctgctcgtcggcagcaccgacctgggccagcaggttgaatgccacctggcggtcgaagaagcgcggctccagcgggcgggcattgagcagttcggcggtttgccgggccagctcgctgaccgcttcacggccttgcgcagacaccgc > 5:363096‑M1/1‑3 (MQ=255) ctgctcgtcggcagcaccgacctgggccagcaggttgaatgccacctggcggtcgaagaagcgcggctccagcgggcgggcattgagcagttcggcggtttgccgggccagctcgctgaccgcttcacggcc > 4:19874‑M1/1‑1 (MQ=255) ctgctcgtcggcagcaccgacctgggccagcaggttgaatgccacctggcggtcgaagaagcgcggctccagcgggcgggcattgagcagttcggcggtttgccgggccagctcgctgaccgcttcacggcc < 3:19874‑M1/132‑132 (MQ=255) cAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCGGCGATAGCTTCAGTGTGGc < 7:30899/149‑1 (MQ=255) | AGTGATGGCCGCGTTGGCGGTGTCTGCGCAAGGCCGTGAAGCGGTCAGCGAGCTGGCCCGGCAAACCGCCGAACTGCTCAATGCCCGCCCGCTGGAGCCGCGCTTCTTCGACCGCCAGGTGGCATTCAACCTGCTGGCCCAGGTCGGTGCTGCCGACGAGCAGGGCCA‑TACCGCGCTGGAGCGCCGCCTGGTCAGCGAACTGCGCGTACTGCTGGGCCTGCCTGAACTGAAGATTTCCGTGAGCTGTGTTCAAGTCCCGGTGTTTTTCGGCGATAGCTTCAGTGTGGC > NC_002947/2258789‑2259076 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |