New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3636697 = | 54 (1.020) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 5.8% | coding (625/1191 nt) | PP_3203 | MFS transporter |
? | NC_002947 | 3636738 = | 46 (0.930) | coding (666/1191 nt) | PP_3203 | MFS transporter |
TGGGGGAAAGCGACTGGCGGACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGCCAACCAGCTCGGC > NC_002947/3636551‑3636837 | ccggcaagcgcgccagtaagcgaaaagccagtgcaccggccaacacgccgagctggttggcgcccatggccaggccgacctgacggggcgcatctatgtgcagtaactgcagcacgtaaccggcctgtaccgggacgatgaacaggCt < 1:140304‑M1/2‑1 (MQ=255) cggcaagcgcgcctgtaagcgaaaagccagtgcaccggccaacacgccgagctggttggcgcccatggccaggccgacctgacggggcgcatctatgtgcagtaactgcagcacgtaaccggcctgtaccgggacgatgaacaggCTGa > 5:277082‑M1/146‑149 (MQ=255) ggAAAGCGACTGGCGGACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGc > 4:290558/1‑149 (MQ=255) gCGGACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGTGGCGCTGTGCCTGACCTTGATTGCCCTGCTGTTGTTGGAGCCTCGTGACTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATTGGCGGACCTGACGCCGTTATACCTGc < 2:279868/149‑1 (MQ=255) gCGGACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTg < 2:72595/148‑1 (MQ=255) gCGGACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGc > 5:162418/1‑149 (MQ=255) gCGGACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGGAGCGCTGTGCCTGCCCTGGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGc < 2:283635/149‑1 (MQ=255) gACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATAcc > 5:149120/1‑143 (MQ=255) gACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATAcc < 6:149120/143‑1 (MQ=255) ccTCTATGCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTgctggctg > 4:199194/1‑149 (MQ=255) gCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCTCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGctggctggaccatc > 8:148343/1‑143 (MQ=255) ccaacacgccgagctggttggcgcccatggccaggccgacctgacggggcgcatctatgtgcagtaactgcagcacgtaaccggcctgtaccgggacgatgaacaggCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGc > 7:267823‑M1/108‑149 (MQ=255) cGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGc < 2:127673/149‑1 (MQ=255) ggtgggtgCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGcc > 8:334837/1‑149 (MQ=255) gtgggtgCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTgctg < 1:214192/135‑1 (MQ=255) gtgggtgCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCACTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTgctg > 2:214192/1‑135 (MQ=255) tgcctgccCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTccc < 7:334837/149‑1 (MQ=255) cctgccCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCt > 5:14346/1‑108 (MQ=255) cctgccCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCt < 6:14346/108‑1 (MQ=255) cctgccCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGACGTCAGc > 4:301732/1‑133 (MQ=255) aTGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCg < 6:162418/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACg > 5:67699/1‑149 (MQ=255) tgttgtGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCAGCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGtgctg > 5:215405/1‑149 (MQ=255) acctgacggggcgcatctatgtgcagtaactgcagcacgtaaccggcctgtaccgggacgatgaacaggCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGcc < 4:133747‑M1/43‑1 (MQ=255) acctgacggggcgcatctatgtgcagtaactgcagcacgtaaccggcctgtaccgggacgatgaacaggCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGcc > 3:133747‑M1/70‑112 (MQ=255) tgGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGt > 7:291575/1‑148 (MQ=255) ggtgCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCTTCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTa < 2:255150/145‑1 (MQ=255) ggAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGtgctgc > 8:334009/1‑143 (MQ=255) ggAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGtgctgc < 7:334009/143‑1 (MQ=255) aGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCg > 4:207930/1‑119 (MQ=255) gCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGc < 3:290558/149‑1 (MQ=255) gcgTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCg > 6:230618/1‑125 (MQ=255) gcgTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCg < 5:230618/125‑1 (MQ=255) cgTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACAt < 8:291575/149‑1 (MQ=255) ctgccAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTa > 1:161115/1‑136 (MQ=255) ctgccAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTa < 2:161115/136‑1 (MQ=255) ctgccAGGCCACCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATg > 8:112715/1‑149 (MQ=255) tgccAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATgc < 3:199194/149‑1 (MQ=255) cgccAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGCCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGt > 1:161401/1‑148 (MQ=255) gccAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGt > 5:70174/1‑147 (MQ=255) aaGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGc > 3:102654/1‑149 (MQ=255) ccTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCACCCCGTCAGGTCGGCCTg > 5:290225/1‑149 (MQ=255) tCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGc > 3:221719/1‑149 (MQ=255) cGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCa < 4:102654/149‑1 (MQ=255) gTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCAt > 3:193707/1‑149 (MQ=255) ttCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGgcg > 1:316871/1‑149 (MQ=255) gcgTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGAGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGcc > 3:239166/1‑148 (MQ=255) ccATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTgg < 6:191703/130‑1 (MQ=255) ccATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTgg > 5:191703/1‑130 (MQ=255) cATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTg > 3:40192/1‑128 (MQ=255) cATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTg < 4:40192/128‑1 (MQ=255) cATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGCCAACCAGCTc > 2:140304/1‑149 (MQ=255) cATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCACCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGCCAACCAGCTc < 6:290225/149‑1 (MQ=255) tGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGCCAACCAGCTCgg > 5:263871/1‑149 (MQ=255) ggcggcCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGCCAAc > 7:208574/1‑139 (MQ=255) ggcggcCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGCCAAc < 8:208574/139‑1 (MQ=255) ggcggcCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGCCAACCAGCTCGGc < 6:263871/148‑1 (MQ=255) gcggcCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGa < 3:121840/101‑1 (MQ=255) gcggcCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGa > 4:121840/1‑101 (MQ=255) | TGGGGGAAAGCGACTGGCGGACACCGTTCACCCTCTATGCGGTGGGTGCGCTGTGCCTGCCCTTGATGGCCCTGCTGTTGTGGGAGCCGCGTGCCTGCCAGGCCGCCAGCGAAGCCTCCGTCGATTCGCGTTTTCCATGGGCGGCCCTGACGCCGTTATACCTGCTCACCGTGCTGGCTGGCGTCAGCCTGTTCATCGTCCCGGTACAGGCCGGTTACGTGCTGCAGTTACTGCACATAGATGCGCCCCGTCAGGTCGGCCTGGCCATGGGCGCCAACCAGCTCGGC > NC_002947/3636551‑3636837 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |