New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3787557 | 46 (0.870) | 6 (0.120) | 5/242 | NT | 10.7% | coding (1078/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3791290 = | 56 (1.110) | coding (734/1026 nt) | PP_3353 | sulfatase‑modifying protein |
GTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAA > NC_002947/3787418‑3787701 | gtgtTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGggt‑ggt > 5:106428/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAggc > 7:285228/1‑149 (MQ=255) gCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAggc < 7:154300/148‑1 (MQ=255) aTGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTtcccggccaacggctttggcc > 3:316607‑M1/1‑128 (MQ=255) gCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGc > 2:130724/1‑149 (MQ=255) cTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGc < 6:106428/148‑1 (MQ=255) tCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCa > 5:42094/1‑149 (MQ=255) tCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCa > 6:183702/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCAt < 2:36112/148‑1 (MQ=255) aTGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATa < 4:332107/149‑1 (MQ=255) ccGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTtcccggccaacggctttggcctgttcgat < 4:316607‑M1/148‑30 (MQ=255) cATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCAt > 5:120671/1‑149 (MQ=255) acGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTgg < 5:183702/149‑1 (MQ=255) gCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTtcccggccaacggctttggcctgttcgatgccg > 4:90489‑M1/1‑105 (MQ=255) gCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGc > 5:89692/1‑128 (MQ=255) gCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGc < 6:89692/128‑1 (MQ=255) ccGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGt > 4:107185/1‑148 (MQ=255) gTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTtcccggccaacggctttggcctgttcgatgccggcggcaatgtctgg < 2:90488‑M1/149‑48 (MQ=255) ccTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCg < 6:120671/147‑1 (MQ=255) tCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTtcccggccaacggctttggcctgttcgatgccggcggcaatgtctgg > 2:340502‑M1/1‑95 (MQ=255) tCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTtcccggccaacggctttggcctgttcgatgccggcggcaatgtctgg < 1:340502‑M1/142‑48 (MQ=255) tGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGt < 6:42094/149‑1 (MQ=255) tttCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGc < 3:107185/149‑1 (MQ=255) cacTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACtt > 2:318849/1‑149 (MQ=255) ttCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTc > 8:76613/1‑149 (MQ=255) cGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTc < 1:130724/147‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCg < 8:285228/149‑1 (MQ=255) gcCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCa > 4:320449/1‑149 (MQ=255) gcCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCAAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCa > 1:242633/1‑149 (MQ=255) gagaAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATgcg > 5:71707/1‑149 (MQ=255) aGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATg < 7:76613/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATgg > 1:331040/1‑149 (MQ=255) cGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGcc < 2:331040/149‑1 (MQ=255) cGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGc > 3:102398/1‑148 (MQ=255) gAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAg > 8:28522/1‑78 (MQ=255) gAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAg < 7:28522/78‑1 (MQ=255) gAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGc > 5:98580/1‑147 (MQ=255) gTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGgcg < 4:102398/149‑1 (MQ=255) tCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGgcgc < 1:318849/149‑1 (MQ=255) ggCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGTGGGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGcgcg > 1:31699/1‑149 (MQ=255) cccACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGAt < 4:265633/128‑1 (MQ=255) cccACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGAt > 3:265633/1‑128 (MQ=255) cccACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTg > 2:256558/1‑149 (MQ=255) ccaccaCGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCg < 6:125637/119‑1 (MQ=255) ccaccaCGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCg > 5:125637/1‑119 (MQ=255) caccacGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGc > 7:50563/1‑148 (MQ=255) caccacGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGc > 4:160/1‑148 (MQ=255) ccacGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAg < 2:31699/149‑1 (MQ=255) cGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAgggg < 3:160/149‑1 (MQ=255) tgatgTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCAAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGgggtgg < 2:242633/149‑1 (MQ=255) tgTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGgggtgggt < 6:98580/148‑1 (MQ=255) gTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGggtgggtg > 2:19558/1‑148 (MQ=255) ttGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGggtga < 8:50563/148‑1 (MQ=255) gCTtcccggccaacggctttggccgggtcgatgccggcggcaatgtctgggagctgactcgcacgggctatcggccaggccatgacgcacagcgcgacgccaagctcgacccctcaggcccggccctgagtgacagcttcgacccggc < 8:154991‑M1/148‑146 (MQ=255) | GTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGCCGGGCTCGATGCGCAGCGTGCGCCAGGGCGAGAAGCCGAAGGTCGGCCCCACCACGATGATGTTGCTCAGGGT‑GGTGAGGCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAA > NC_002947/3787418‑3787701 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |