New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4172927 | 50 (0.950) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 7.6% | coding (561/825 nt) | PP_3671 | aldo/keto reductase family oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 4172940 | 49 (0.970) | coding (574/825 nt) | PP_3671 | aldo/keto reductase family oxidoreductase |
CCCATTGGGGTTACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCAGC > NC_002947/4172780‑4173072 | cccATTGGGGTTACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTG < 5:356314‑M1/148‑1 (MQ=255) cccATTGGGGTTACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTG < 3:17025‑M1/148‑1 (MQ=255) ggggTTACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCAcgc < 6:328479/148‑1 (MQ=255) ttACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGc > 7:132121/1‑147 (MQ=255) aCTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAgg > 5:279546/1‑149 (MQ=255) aCTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAgg > 6:126002/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGcagcgg < 8:70345‑M2/149‑7 (MQ=255) cAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAgcggc < 6:279546/149‑1 (MQ=255) tggAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCg < 8:116030/149‑1 (MQ=255) ggAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCgg > 3:234406/1‑149 (MQ=255) aaaCCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGt > 4:272934/1‑148 (MQ=255) aaaCCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGt > 4:277696/1‑148 (MQ=255) ggCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAg < 5:126002/147‑1 (MQ=255) gTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGccc < 7:313258/149‑1 (MQ=255) tCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCaa < 7:70345/149‑1 (MQ=255) tCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCaa < 3:277696/149‑1 (MQ=255) cGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCaa < 3:272934/148‑1 (MQ=255) aaTTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATg < 4:234406/149‑1 (MQ=255) aTTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATgg > 7:191970/1‑149 (MQ=255) gTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGtgct < 1:129258/149‑1 (MQ=255) gTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGtgct > 2:129258/1‑149 (MQ=255) aaTACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGcc > 2:53753/1‑148 (MQ=255) aCCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCccagc > 4:114001/1‑149 (MQ=255) ccATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCgg < 7:2075/107‑1 (MQ=255) ccATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCgg > 8:2075/1‑107 (MQ=255) ccATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCccagcc < 3:114001/149‑1 (MQ=255) cATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGCCTGGCCGCGTGCcagcggggtgtaggcggtga > 3:186491‑M2/1‑91 (MQ=255) cATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGCCTGGCCGCGTGCcagcggggtgtaggcggtga < 4:186491‑M2/111‑21 (MQ=255) ttCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTg > 3:136996/1‑149 (MQ=255) tCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCt > 8:70055/1‑148 (MQ=255) cagccagcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGcctggccgcgtgccagcggggtgta < 1:137705‑M1/92‑26 (MQ=255) cagccagcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGcctggccgcgtgccagcggggtgta > 2:137705‑M1/1‑67 (MQ=255) ccagcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAAt < 7:70055/149‑1 (MQ=255) cagcAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATg > 7:29593/1‑149 (MQ=255) aaCCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGgctg < 4:136996/149‑1 (MQ=255) ccGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGgcgc > 4:259166/1‑136 (MQ=255) ccGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGgcgc < 3:259166/136‑1 (MQ=255) cGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGctgctg < 1:53753/149‑1 (MQ=255) cTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGa > 3:269244/1‑149 (MQ=255) tACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGAc > 1:229578/1‑149 (MQ=255) cTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGAc > 3:148988/1‑147 (MQ=255) tCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAg > 7:7824/1‑149 (MQ=255) cccGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTg > 8:237398/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTgg < 8:29593/149‑1 (MQ=255) cgGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTggcgg < 4:269244/149‑1 (MQ=255) ggCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTggcggc > 3:342509/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATcccc > 6:8017/1‑148 (MQ=255) tGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCCGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCa > 4:288657/1‑147 (MQ=255) tCACCGCCTACACCCCGCTGgcacgcggccaggcagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatggccgcgggcgaagtcgagtagcggttgctggctgagcagaacatg > 3:186491‑M1/1‑20 (MQ=255) tCACCGCCTACACCCCGCTGgcacgcggccaggcagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatggccgcgggcgaagtcgagtagcggttgctggctgagcagaacatg < 4:186491‑M1/111‑92 (MQ=255) tCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTggcgg < 2:197412/132‑1 (MQ=255) tCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCcag > 3:27174/1‑148 (MQ=255) tCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCACGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTggcgg > 1:197412/1‑132 (MQ=255) aCCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATc < 7:171410/135‑1 (MQ=255) aCCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATc > 8:171410/1‑135 (MQ=255) ccTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCcgc < 5:8017/149‑1 (MQ=255) tACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGcagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatggccgcgggcgaagtcgagtagcggttgctggctg < 1:137705‑M2/92‑68 (MQ=255) tACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGcagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatggccgcgggcgaagtcgagtagcggttgctggctg > 2:137705‑M2/1‑25 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCaaa < 6:300541/130‑1 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCaaa > 5:300541/1‑130 (MQ=255) cccGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAAc > 7:211178/1‑148 (MQ=255) ccGCTGcctggccgcgtgccagcggggtgtaggcggtgagcaacaggtcatggccgcgggcgaagtcgagtagcggttgctggctgagcagaacatggtattccacctgaattgccgacaacggcgcgcccagggtttccaccacctgg < 8:70345‑M1/149‑144 (MQ=255) gCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCAGc < 2:229578/149‑1 (MQ=255) | CCCATTGGGGTTACTGCGCCAGGTGGTGGAAACCCTGGGCGCGCCGTTGTCGGCAATTCAGGTGGAATACCATGTTCTGCTCAGCCAGCAACCGCTACTCGACTTCGCCCGCGGCCATGACCTGTTGCTCACCGCCTACACCCCGCTGGCACGCGGCCAGGCAGCGGCGCAGCCGGTGATCCAGGCGATCGCCCGCAAGCATGGCGTGCTGCCCAGCCAGGTGGCGCTGAAATGGCTGCTGGACCAGGACGGCGTGGCGGCGATCCCCAAAGCCAGCAGCCGCGAAAACCAGC > NC_002947/4172780‑4173072 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |