New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4755135 | 60 (1.140) | 4 (0.080) | 3/236 | NT | 6.5% | coding (376/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
? | NC_002947 | = 4755160 | 60 (1.220) | coding (401/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
CGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACC > NC_002947/4754996‑4755281 | cgacgaACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAgcg > 3:258116/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGc < 3:182739/149‑1 (MQ=255) gcctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCgg > 6:304230/1‑149 (MQ=255) gcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCTCCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGgccgcc < 5:304230/149‑1 (MQ=255) gcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGgccgcc > 7:235264/1‑149 (MQ=255) cgccgcGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgg > 2:58906‑M2/1‑146 (MQ=255) gccgcGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggc > 7:68396‑M2/1‑145 (MQ=255) gccgcGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggc > 7:14318‑M2/1‑145 (MQ=255) cgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctgg < 8:169715‑M1/149‑34 (MQ=255) cgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctgg > 6:174931‑M2/1‑141 (MQ=255) aGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcg < 3:154769‑M1/149‑36 (MQ=255) cTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcg < 2:227027‑M1/145‑36 (MQ=255) cTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcg > 1:227027‑M1/1‑110 (MQ=255) ttCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCg > 2:112100/1‑149 (MQ=255) ggTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCAcc < 1:162458/149‑1 (MQ=255) tCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGc > 7:84778/1‑148 (MQ=255) cAGGGCTACCCCCTGCTCCCCTCCGTGTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGAGGCCAGCCATCTACGCCGGTCCCCCCGCCGCCGAACGCCCGGCCCGCGCCCGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCCGCCGCCCCGCCACCCGTcg > 8:243904/1‑148 (MQ=255) cAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTcc > 5:102280/1‑149 (MQ=255) aGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCg > 8:235452/1‑149 (MQ=255) gggCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGc > 5:297878/1‑149 (MQ=255) ggCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCa > 3:165033/1‑149 (MQ=255) ccaccTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCaa < 8:235264/148‑1 (MQ=255) caccTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGc < 4:3068/123‑1 (MQ=255) caccTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGc > 3:3068/1‑123 (MQ=255) caccTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAAt > 3:257085/1‑148 (MQ=255) aTCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCg < 8:84778/148‑1 (MQ=255) ccccTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTg < 4:258116/149‑1 (MQ=255) ccTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGc > 2:183080/1‑149 (MQ=255) cTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggc < 1:107032‑M2/103‑5 (MQ=255) cTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggc > 2:107032‑M2/1‑99 (MQ=255) cGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCcagc < 6:297878/149‑1 (MQ=255) ggCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCcagca < 4:257085/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCcagcag > 1:148314/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCcagcag < 6:102280/149‑1 (MQ=255) tCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCagcagc > 2:211601/1‑148 (MQ=255) ccAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACggg > 1:206635/1‑149 (MQ=255) ggAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGtct < 2:206635/149‑1 (MQ=255) gAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGtctc < 5:64265/149‑1 (MQ=255) cGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGccc < 3:175683/149‑1 (MQ=255) ccagccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCtt > 4:40688/1‑149 (MQ=255) agccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTg > 8:103566/1‑113 (MQ=255) agccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTg < 7:103566/113‑1 (MQ=255) caTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgatg > 5:94615/1‑148 (MQ=255) tACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCAt < 2:139732/93‑1 (MQ=255) tACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCAt > 1:139732/1‑93 (MQ=255) cGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTg < 1:183080/149‑1 (MQ=255) cGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTg < 7:235452/149‑1 (MQ=255) ccGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGc < 1:211601/149‑1 (MQ=255) ccGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGc > 7:39372/1‑149 (MQ=255) ggTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCca < 2:148314/149‑1 (MQ=255) ccccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcatc < 4:165033/149‑1 (MQ=255) ccccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcat < 7:248627/148‑1 (MQ=255) ccccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcat < 7:243904/148‑1 (MQ=255) cccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGtct < 6:299991/113‑1 (MQ=255) cccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGtct > 5:299991/1‑113 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCcag > 4:245882/1‑96 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCcag < 3:245882/96‑1 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCcag > 4:309638/1‑96 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCcag < 3:309638/96‑1 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGc > 7:318443/1‑122 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGc < 8:318443/122‑1 (MQ=255) ccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGcc < 8:39372/149‑1 (MQ=255) gAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCcga > 7:92403/1‑149 (MQ=255) aaCGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGt < 1:318779/128‑1 (MQ=255) aaCGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGt > 2:318779/1‑128 (MQ=255) cGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaaggcct < 3:154769‑M2/149‑115 (MQ=255) cGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaag < 2:227027‑M2/145‑111 (MQ=255) cGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaag > 1:227027‑M2/1‑35 (MQ=255) gCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGaa < 3:40688/149‑1 (MQ=255) ccaggcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaaggcctcg > 6:174931‑M1/1‑8 (MQ=255) ccAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaaggcctcg < 8:169715‑M2/149‑117 (MQ=255) ccAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGaac > 8:231468/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGaac > 4:18990/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcat < 6:234179/131‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcat > 5:234179/1‑131 (MQ=255) gcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaaggcctcgcggc > 7:68396‑M1/1‑4 (MQ=255) gcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaaggcctcgcggc > 7:14318‑M1/1‑4 (MQ=255) gcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggag > 2:107032‑M1/1‑4 (MQ=255) gcccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggag < 1:107032‑M1/103‑100 (MQ=255) ccaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaaggcctcgcggcg > 2:58906‑M1/1‑2 (MQ=255) | CGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAACCAACC > NC_002947/4754996‑4755281 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |