New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 153156 | 58 (1.100) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 7.2% | coding (451/1407 nt) | PP_0144 | insulinase family metalloprotease |
? | NC_002947 | = 153189 | 48 (0.950) | coding (418/1407 nt) | PP_0144 | insulinase family metalloprotease |
TCGTCGAGGTTGGAGCGCTCCGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCACTGCTGGTATAGGCGTTCCACTCTCCGCCGAGCGC > NC_002947/153041‑153333 | tcgtcgAGGTTGGAGCGCTCCGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGt > 3:303302/1‑149 (MQ=255) ggTTGGAGCGCTCCGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAgg > 1:203757/1‑149 (MQ=255) ggTTGGAGCGCTCCGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAgg < 7:240925/149‑1 (MQ=255) ggTTGGAGCGCTCCGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAgg < 4:303302/149‑1 (MQ=255) ttGGAGCGCTCCGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGc < 7:240139/149‑1 (MQ=255) aGCGCTCCGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTg < 8:280751/149‑1 (MQ=255) cGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATATCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGa < 8:323796/149‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGAtggtg < 2:203757/149‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTa > 5:341594/1‑149 (MQ=255) aGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATc > 7:176475/1‑149 (MQ=255) aGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGAt < 6:341594/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTg > 5:126444/1‑149 (MQ=255) gTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGTCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGc < 5:356859/149‑1 (MQ=255) ggCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGcc > 8:102527/1‑148 (MQ=255) gcAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCaa > 2:306565/2‑148 (MQ=255) gTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAgg < 7:102527/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAg > 8:126249/1‑149 (MQ=255) gCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGc < 8:228688/131‑1 (MQ=255) gCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGc > 7:228688/1‑131 (MQ=255) ccGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTCGCGTCGAGAGTGGTATCGCGGAAGACTGCGCACAGCAGCTCGCGGACCTGGCGCTg > 6:232657/1‑149 (MQ=255) cGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTgg > 3:318688/1‑149 (MQ=255) gATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAg < 8:223162/135‑1 (MQ=255) gATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGt > 5:119941/1‑149 (MQ=255) gATGTACTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAg > 7:223162/1‑135 (MQ=255) aTGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGtt < 6:126444/149‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCg > 3:67742/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGt < 3:27193/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTg > 2:154809/1‑149 (MQ=255) tGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTgcgc < 2:269578/138‑1 (MQ=255) tGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTgcgc > 1:269578/1‑138 (MQ=255) cGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCgg < 6:170000/149‑1 (MQ=255) ggTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCggg < 4:67742/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCgggg < 7:126249/149‑1 (MQ=255) tCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGc < 1:154809/149‑1 (MQ=255) gcTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTg > 2:301457/1‑119 (MQ=255) gcTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGAc > 3:157308/1‑148 (MQ=255) gCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAg > 2:96966/1‑149 (MQ=255) cAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAg < 1:96966/148‑1 (MQ=255) cAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAg < 1:306565/148‑1 (MQ=255) aGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGt < 6:176178/149‑1 (MQ=255) aTGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCTCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGTCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAgg < 3:65786/100‑1 (MQ=255) aTGGCAATAGTGGACGCCGTCCTAGCGCTCTATGATGCTCTTGGCGGTGGAAAGGGCCTTGTCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCAAACATCAgg > 4:65786/1‑100 (MQ=255) tGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTggccactatggccatctgcagcgctggctcgaccgccaggacatcggccaccccgccagcgaccagttggccaccgagctggggctgaaatgcccggagcgc < 7:2880‑M2/149‑103 (MQ=255) ggCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGt < 1:89516/122‑1 (MQ=255) ggCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGt > 2:89516/1‑122 (MQ=255) cATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTggccactatggccatctgcagcgctggctcgaccgccaggacatcggccaccccgccagcgaccagttggccaccgagctgg > 3:92365‑M2/1‑43 (MQ=255) cATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTggccactatggccatctgcagcgctggctcgaccgccaggacatcggccaccccgccagcgaccagttggccaccgagctgg < 4:92365‑M2/125‑83 (MQ=255) aTAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCgg < 4:318688/149‑1 (MQ=255) gccgccGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTggccactatggccatctgcagcgctggctcgaccgccaggacatcggccaccccgccagcgaccagttggccaccgagctggggctgaaatgcccggagcgctccaacctcga > 8:2880‑M2/1‑36 (MQ=255) cgccgTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCActgctg < 4:182942/149‑1 (MQ=255) cgccgTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCActgctg < 8:176475/149‑1 (MQ=255) ccgTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCACTGCTgg > 3:298712/1‑148 (MQ=255) tCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCActgctg < 3:222247/144‑1 (MQ=255) tCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCActgctg > 4:222247/1‑144 (MQ=255) cgcTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCACTGCTGGTATAGGCGtt < 6:119941/149‑1 (MQ=255) ctATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCACTGCTGGTATAGGCGTTCCAc > 6:342758/1‑149 (MQ=255) tgatgCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCACTGCTGGTATAGGCGTTCCAct < 8:300040/147‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCACTGCTGGTATAGGCGTTCCACTCTCCGCCGAgcgc < 4:298712/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCActgc < 8:30360/116‑1 (MQ=255) | TCGTCGAGGTTGGAGCGCTCCGGGCATTTCAGCCCCAGCTCGGTGGCCAACTGGTCGCTGGCGGGGTGGCCGATGTCCTGGCGGTCGAGCCAGCGCTGCAGATGGCCATAGTGGCCGCCGTCCTCGCGCTCTATGATGCGCTTGGCGGTGGCCAGGGCCTTGGCGTCGATGGTGGTATCGCGGATGACTGCCAACAGCAGGTCGAGGACCTTGCGCTGGTTGCGTGCCGGGGCCTCGATGACAAAGGTTGTGTCGGCACTGCTGGTATAGGCGTTCCACTCTCCGCCGAGCGC > NC_002947/153041‑153333 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |