New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 628689 = | 55 (1.040) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 7.4% | coding (106/819 nt) | eutC | ethanolamine ammonia‑lyase subunit beta |
? | NC_002947 | 628740 = | 48 (0.950) | coding (55/819 nt) | eutC | ethanolamine ammonia‑lyase subunit beta |
CGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTTGTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATAC > NC_002947/628593‑628888 | cgcgGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTc < 8:42740/149‑1 (MQ=255) gcgGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCa < 8:1761/149‑1 (MQ=255) ccgccaggccttggcacagcttgcatagggatgaccatggaccaccgcacgcctacccccgacaacccttggctggccctgcgcaacctgaCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAgg > 1:59544‑M1/92‑147 (MQ=255) aGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCa < 4:286225/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAg > 5:353115/1‑149 (MQ=255) aGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAg < 6:54386/149‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGGGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGTGCATGGGCGAACTGCAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCTGCAGGCTGGTGCCGGTGCGTCCCAGGGGGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTgcgc < 4:99446/147‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCaa < 5:9326/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAg > 1:280456/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAg < 2:208959/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAgg > 8:204975/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAgg < 2:261857/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAggg < 6:220701/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAggg < 6:353115/149‑1 (MQ=255) cGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTg > 7:233391/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGACGGTGCGGCCCACGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTCCGCAGGGCAAGCCAAGGGTTg > 3:209002/1‑149 (MQ=255) gTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCgggg < 2:280456/148‑1 (MQ=255) cGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCgg > 6:127935/1‑144 (MQ=255) cGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCgg < 5:127935/144‑1 (MQ=255) gAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGCTCCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGACAGCCAAGGGTGGTGGGGGGTAg > 7:152833/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCg > 4:69777/1‑149 (MQ=255) aGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCg < 2:29847/149‑1 (MQ=255) gCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCAt > 4:229504/1‑149 (MQ=255) cATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATg < 3:229504/149‑1 (MQ=255) aTCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATgg < 3:69777/149‑1 (MQ=255) gCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCtgt > 7:309560/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATg > 6:78593/1‑124 (MQ=255) cTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATg < 5:78593/124‑1 (MQ=255) cTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCaa < 7:204975/149‑1 (MQ=255) tGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAg > 6:38526/1‑149 (MQ=255) tGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAg > 6:271235/1‑149 (MQ=255) gAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAg < 5:38526/147‑1 (MQ=255) gAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGc > 7:238733/1‑149 (MQ=255) gAAGTCAAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGGTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGc > 3:317228/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAgg < 2:190919/145‑1 (MQ=255) gTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGcagc > 1:190919/1‑146 (MQ=255) gTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTg > 8:328274/1‑149 (MQ=255) tCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTgg > 1:235161/1‑149 (MQ=255) cAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGc < 5:271235/148‑1 (MQ=255) cctgaccccggcgcgcatcgccctgggccgcaccggcaccagcctgccgaccggggTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCgg > 1:59544‑M2/57‑147 (MQ=255) cTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGaa < 8:309560/149‑1 (MQ=255) tGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAg < 8:233391/149‑1 (MQ=255) cgcCCCGGTCGGCAGGGTGGTGCGGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCGAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAg < 4:209002/147‑1 (MQ=255) cggcgcgcatcgccctgggccgcaccggcaccagcctgccgaccggggTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGc > 5:317442‑M2/49‑89 (MQ=255) cggcgcgcatcgccctgggccgcaccggcaccagcctgccgaccggggTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGc < 6:317442‑M2/41‑1 (MQ=255) CGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCcggcg > 8:238733‑M1/1‑149 (MQ=255) ggCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAgg < 4:317228/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAg > 2:241874/1‑147 (MQ=255) gCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAg < 1:241874/147‑1 (MQ=255) gCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATg > 8:185012/1‑94 (MQ=255) gCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATg < 7:185012/94‑1 (MQ=255) gccgcaccggcaccagcctgccgaccggggTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTTGTCACCGAAgc < 2:59544‑M2/119‑1 (MQ=255) gCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGtt > 2:115108/1‑131 (MQ=255) gCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGtt < 1:115108/131‑1 (MQ=255) gggCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGAAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCAGGCGGCAGGTTGGCa > 8:310392/1‑130 (MQ=255) gATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTTGTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGc > 8:231318/1‑149 (MQ=255) cgcCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATg < 8:194306/64‑1 (MQ=255) cgcCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATg > 7:194306/1‑64 (MQ=255) tCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTCTCGGGGGTAGGCCTGCCGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTTGTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATAc > 1:197712/1‑149 (MQ=255) | CGCGGTCACTCAGCTGGCTGGCCAGGCCGGCGTGGTCGAAAGCCAGGTGCACGGCATCTCGTGCCTGGGCATGGGCGAACTGGAAGTCCAGCTGCGCCCCGGTCGGCAGGCTGGTGCCGGTGCGGCCCAGGGCGATGCGCGCCGGGGTCAGGTTGCGCAGGGCCAGCCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTTGTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATAC > NC_002947/628593‑628888 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |