New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 929449 | 54 (1.020) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 5.5% | coding (16173/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 929502 | 52 (1.040) | coding (16120/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
TGGCGAGGTCAAGGTAATGCTGAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCGCGGCGTTCAGGTTGACGGTGAACACGCCACCGCCA > NC_002947/929356‑929644 | tgGCGAGGTCAAGGTAATGCTGAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTg > 5:187250‑M2/1‑147 (MQ=255) tAATGCTGAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGc > 3:77000/1‑149 (MQ=255) tGCTGAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGc < 2:244118/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTg > 8:158333/1‑147 (MQ=255) tGAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAgg > 7:150820/1‑149 (MQ=255) tGAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAgg > 5:182024/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGt > 2:317883/1‑149 (MQ=255) ccGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTgcggc < 8:150820/149‑1 (MQ=255) ccGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTgc > 6:166405/1‑146 (MQ=255) ccGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTgc < 5:166405/146‑1 (MQ=255) ggCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGgtg < 4:77000/148‑1 (MQ=255) ttGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGc > 2:76494/1‑149 (MQ=255) aCCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGgtgt > 6:299708/1‑142 (MQ=255) aCCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGgtgt < 5:299708/142‑1 (MQ=255) aCCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGgt < 2:174381/140‑1 (MQ=255) aCCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGgt > 1:174381/1‑140 (MQ=255) cacaCCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGtgc > 3:206099/1‑149 (MQ=255) cacaCCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGtgc > 8:128739/1‑149 (MQ=255) acacCGGTAACCACCTCGCCGTTCGGCCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCCGAAAGCACGGTAACGGAGACGGAGATGGCGACGTTGGTGGGCTCTCAACGTGGCTGCAGGTCATCCTCGCTGTAGCTtttg > 8:289814/1‑147 (MQ=255) ccACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGAcaca < 7:158333/149‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGgt < 7:300377/118‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGgt > 8:300377/1‑118 (MQ=255) cGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCa < 1:317883/149‑1 (MQ=255) gggCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACACTGCAGGCAatgt < 6:182024/148‑1 (MQ=255) ggCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCa < 2:280644/143‑1 (MQ=255) ggCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCa > 1:280644/1‑143 (MQ=255) gCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAgt > 7:302538/1‑144 (MQ=255) gCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAgt < 8:302538/144‑1 (MQ=255) aCGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTgggcgctaccattaccgtccaaggcccgaacggccaggtgggtaccggtgtggtacaagccaacggcaccttcagc > 3:278054‑M2/1‑71 (MQ=255) aCGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTgggcgctaccattaccgtccaaggcccgaacggccaggtgggtaccggtgtggtacaagccaacggcaccttcagc < 4:278054‑M2/147‑77 (MQ=255) tAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACg < 5:19643/149‑1 (MQ=255) tAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCACGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCAc > 6:19643/1‑148 (MQ=255) ggTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCtt > 1:70212/1‑103 (MQ=255) ggTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCtt < 2:70212/103‑1 (MQ=255) gTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAg < 7:128739/149‑1 (MQ=255) gcgcCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTAc > 8:41340/1‑149 (MQ=255) gcccgccTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTgggcgctaccattaacgtcctaggcccgaacggccaggtgggtaccggggtggtacaagcccacggcaccttcagcattaccttgacctcgc < 7:221375‑M2/149‑93 (MQ=255) gccTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGcc < 1:76494/149‑1 (MQ=255) tCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGcc > 1:6984/1‑98 (MQ=255) tCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGcc < 2:6984/98‑1 (MQ=255) tCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGtt > 6:12481/1‑149 (MQ=255) aCCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGtt < 5:12481/147‑1 (MQ=255) tgcttaccGGTAGCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCgcggc < 4:136500/142‑1 (MQ=255) gTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCt > 8:31670/1‑99 (MQ=255) gTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCt < 7:31670/99‑1 (MQ=255) gTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCgcggc > 4:216833/1‑149 (MQ=255) cttaccGGTAGCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGTCACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCgcggcg < 3:317068/143‑1 (MQ=255) tACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTTCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTg > 6:39604/1‑103 (MQ=255) tACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTTCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTg < 5:39604/103‑1 (MQ=255) ccGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCGCGGCGTTCAGGTTGa < 7:41340/148‑1 (MQ=255) ccGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCGCGGCGTTCAGGTTGa < 4:206099/148‑1 (MQ=255) ccGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCCGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCGCGGCGTTCAGGTTGACGGTGaa > 7:267153/1‑149 (MQ=255) ccGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCCGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCGCGGCGTTCAGGTTGACGGTGaa < 8:267153/149‑1 (MQ=255) ttGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCGCGGCGTTCAGGTTGACGGTGAacac < 1:340689/149‑1 (MQ=255) ttGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCGCGGCGTTCAGGTTGACGGTGAacac > 1:323880/1‑149 (MQ=255) gTTGGTGGGCGCTGCATGTGTCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGTACACATTCCCTGCAGTGTCAGGCGGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTTATCTGCGCGGCGTTCAGGTTGACGGTGAACACGCCACCGcct < 7:289814/148‑2 (MQ=255) | TGGCGAGGTCAAGGTAATGCTGAAGGTGCCGTTGGCTTGTACCACACCGGTACCCACCTGGCCGTTCGGGCCTTGGACGGTAATGGTAGCGCCCGCCTCACCGCTACCGGTAAGCACGGTACCGGTGCCGTTGATGGCGACGTTGGTGGGCGCTGCAGGTGGCTGCAGGTCTGCGGCGGTGTAGCTTGTGCTGCCGGACACATTGCCTGCAGTGTCAGCCTGGCTCACGCCCAGTACCTGGCCGTTGAGCTGCGCGGCGTTCAGGTTGACGGTGAACACGCCACCGCCA > NC_002947/929356‑929644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |