New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1375575 | 48 (0.910) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.8% | coding (1195/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
? | NC_002947 | = 1375601 | 51 (1.010) | coding (1221/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
GCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCGGTTTCGAGTCGTCAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCTGATGAGCACCTGGAAGCGCG > NC_002947/1375457‑1375749 | gCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCGGTTTCGAGTCGTCAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGccgc < 2:133678‑M2/149‑5 (MQ=255) ggtgTTGCTGGTCATCGGTTTCGAGTCGTCAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGa > 4:339436/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGTCATCGGTTTCGAGTCGTCAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTc < 6:42916/148‑1 (MQ=255) gTTTCGAGTCGTCAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCctg < 1:133678/149‑1 (MQ=255) aGTCGTCAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTc > 3:293918/1‑149 (MQ=255) tcgtcAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGccgct > 7:114447‑M2/1‑105 (MQ=255) tcgtcAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGccgct < 8:114447‑M2/110‑6 (MQ=255) gtcAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACg < 3:339436/149‑1 (MQ=255) gtcAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACg > 1:335078/1‑149 (MQ=255) gTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTc > 8:144985/1‑140 (MQ=255) gTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTc < 7:144985/140‑1 (MQ=255) cccTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGttc > 1:305096/1‑149 (MQ=255) cTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGttctt < 4:158378/149‑1 (MQ=255) cTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACg > 5:13808/1‑149 (MQ=255) tACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGt > 2:97586/1‑149 (MQ=255) tACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGt > 1:201595/1‑149 (MQ=255) aCGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTg > 7:93574/1‑149 (MQ=255) aCGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTg > 4:212291/1‑149 (MQ=255) cGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGt < 6:13808/147‑1 (MQ=255) gggTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCg < 2:305096/149‑1 (MQ=255) cGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCct > 3:346895/1‑106 (MQ=255) cGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCct < 4:346895/106‑1 (MQ=255) ggTGACAGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATCCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTCCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCAGGTCGACGGCCTGATCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCg > 4:302795/1‑149 (MQ=255) aCCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGcc > 7:230739/1‑147 (MQ=255) cGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAgg < 8:230739/149‑1 (MQ=255) ggTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAggg > 8:32054/1‑149 (MQ=255) tGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGcc > 7:230268/1‑134 (MQ=255) tGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGcc < 8:230268/134‑1 (MQ=255) tGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTAGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGAAGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCACAGGGCGGAGCCtta > 5:207948/1‑148 (MQ=255) accaccGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGgt < 3:212291/149‑1 (MQ=255) ccaccGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGgtg > 8:208122/1‑149 (MQ=255) caccGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTc < 5:192619/142‑1 (MQ=255) caccGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTc > 6:192619/1‑142 (MQ=255) caccGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGgtgt > 4:131538/1‑149 (MQ=255) cTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCg < 1:97586/148‑1 (MQ=255) tGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCATCGTGCCGAATATCGCCCAGGGCGGTGCCTTGCCGGTGTTGGCCggt < 3:302795/149‑1 (MQ=255) gtgtCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGccgctgacaccaggacggtggtgatcagcatggtaccggtcaccgcaaccccgtaggcagccgcaagggcacctgacgactcgaaaccgatgaccagcaacaccacgcccac < 5:137335‑M2/148‑113 (MQ=255) tCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGccgctgacaccaggacggtggtgatcagcatggtaccggtcaccgcaaccccgtaggcagccgcaagggcacctgacgactcgaaaccgatgaccagcaacaccacgcccaccatc > 6:137335‑M2/1‑33 (MQ=255) tCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGccgctgacaccaggacggtggtgatcagcatggtaccggtcaccgcaaccccgtaggcagccgcaagggcacctgacgactcgaaaccgatgaccagcaacaccacgccaccat < 1:28757‑M2/147‑115 (MQ=255) aGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGtgtg < 3:131538/148‑1 (MQ=255) gCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCggtg < 2:303514/142‑1 (MQ=255) gCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCggtg > 1:303514/1‑142 (MQ=255) gCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCt < 2:335078/149‑1 (MQ=255) gCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCt > 5:330427/1‑149 (MQ=255) gCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCt < 4:293918/149‑1 (MQ=255) gCGGGGATGCTGCTGCTGTGGACGTGGCCGCGGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTGGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCt < 8:93574/149‑1 (MQ=255) gATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTAcc > 6:16356/1‑149 (MQ=255) ctgctgTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCtgat < 5:16356/149‑1 (MQ=255) ctgctgTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCtga < 7:208122/148‑1 (MQ=255) tgctgTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCTGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCtgat > 1:194097/1‑148 (MQ=255) ctgTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCATTGCGGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCtgatga < 6:207948/148‑1 (MQ=255) ctgTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCTGATGAg < 7:32054/149‑1 (MQ=255) tgtgGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCTGATGAg > 7:223420/1‑148 (MQ=255) tgGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCTGATGAGCAc > 6:73815/1‑149 (MQ=255) aGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCTGATGAGCACCTgg < 3:86326/149‑1 (MQ=255) gTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGc > 4:213198/1‑56 (MQ=255) gTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGc < 3:213198/56‑1 (MQ=255) gccgcTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCTGATGAGCACCTGGAAGcgcg < 5:73815/149‑1 (MQ=255) | GCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCGGTTTCGAGTCGTCAGGTGCCCTTGCGGCTGCCTACGGGGTTGCGGTGACCGGTACCATGCTGATCACCACCGTCCTGGTGTCAGCGGTGATGCTGCTGCTGTGGAAGTGGCCGCCGCTGCTCGCAGTGCCGATTCTGGTCGGCTTCCTGCTGGTCGACGGGCTGTTCTTCGCCGCCAACGTGCCGAAAATCGCCCAGGGCGGTGCCTTCCCGGTGTTGGCCGGTGGTGTGCTGTACCTGCTGATGAGCACCTGGAAGCGCG > NC_002947/1375457‑1375749 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |