| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4792651 = | 69 (1.310) | 4 (0.080) | 3/242 | NT | 5.5% | coding (1189/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
| ? | NC_002947 | 4792689 = | 73 (1.450) | coding (1151/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
GTCGAAGCGTGCAGTGCTCTTGCGCAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAAC > NC_002947/4792544‑4792833 | gatccgactcagggtggtgcgcacctgctgagccaggtcaatgcctgtgcggcgcaggcgcaatcgcaccaggacgtgccgttcgacgagctggtggaagcgctgggCCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCa > 2:281918‑M1/108‑149 (MQ=255) tCGAAGCGTGCAGTGCTCTTGCGCAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAg < 5:201917/149‑1 (MQ=255) cGAAGCGTGCAGTGCTCTTGCGCAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAgc > 8:158016/1‑149 (MQ=255) gttctTGCGCAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCt > 4:252457/3‑149 (MQ=255) tctTGCGCAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTgg > 7:302904/1‑149 (MQ=255) ttGCGCAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTgg < 7:158016/147‑1 (MQ=255) gcacAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGt > 5:247749/4‑146 (MQ=255) gcacAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGt < 6:247749/143‑1 (MQ=255) gcacAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCACGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGt < 6:247746/143‑1 (MQ=255) gcaaatcTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGAAGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGt > 5:247746/7‑146 (MQ=255) gcAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTccacca < 1:133172/138‑1 (MQ=255) gcAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTccacca > 2:133172/1‑138 (MQ=255) gcAGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAAc > 5:189762/1‑149 (MQ=255) aGCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACgg > 8:181173/1‑149 (MQ=255) gCTCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGc < 8:302904/149‑1 (MQ=255) tCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCAc > 6:338698/1‑149 (MQ=255) tCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCAc > 5:74752/1‑149 (MQ=255) tCGAGTTTTTCCAGCTCAAGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCAc > 3:126271/1‑149 (MQ=255) 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< 3:31182/132‑1 (MQ=255) aGGCCCGAGGCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATtgcgc < 8:112550/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCCGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGcgccg < 5:195789/149‑1 (MQ=255) tctgTGCGCACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGAGTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGcgccg < 6:109436/145‑1 (MQ=255) cgcACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGc > 1:154598/1‑149 (MQ=255) gcACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATtgcgcctgcgcc > 1:191945/1‑140 (MQ=255) gcACAGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATtgcgcctgcgcc < 2:191945/140‑1 (MQ=255) cacaGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCtt > 6:70270/1‑149 (MQ=255) acaGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTccac < 3:189861/95‑1 (MQ=255) acaGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTccac > 4:189861/1‑95 (MQ=255) acaGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCttt > 2:154352/1‑149 (MQ=255) acaGTGGCGACGTCGGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCG‑GTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCttt < 6:189762/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |