Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,268,302 | T→G | 7.4% | K371Q (AAG→CAG) | PP_2867 ← | pyridine nucleotide‑disulphide oxidoreductase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,268,302 | 0 | T | G | 7.4% | 206.5 / 7.2 | 68 | K371Q (AAG→CAG) | PP_2867 | pyridine nucleotide‑disulphide oxidoreductase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/32); new base G (2/3); total (33/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.92e-01 |
GTTGCAAGCGTGGCCCTGTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGTGCTACGCCAAG > NC_002947/3268157‑3268440 | gTTGCAAGCGTGGCCCTGTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGCAGCTTCac > 6:230480/1‑148 (MQ=255) gCAAGCGTGGCCCTGTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAgcgc > 7:13990/1‑149 (MQ=255) gCGTGGCCCTGTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGTGCGTATCATCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCAGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTGAAGCGccaga < 3:317643/149‑4 (MQ=255) gCGTGGCCCTGTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTg < 5:147111/149‑1 (MQ=255) ccTGTCGAAACACAAGGCCACTCGATCCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATTAGCGGATGAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCGACACTGAATTGATCTGGCGCTGAAGCGccag < 3:324694/141‑3 (MQ=255) ccTGTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCgg > 4:310942/1‑149 (MQ=255) ccTGTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACAGAATTGATCTGGCTCTGAAGCGccag > 4:324694/1‑139 (MQ=255) gTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCg < 5:343913/145‑1 (MQ=255) gTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCg < 8:132997/145‑1 (MQ=255) gTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCg > 7:132997/1‑145 (MQ=255) gTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCg > 6:343913/1‑145 (MQ=255) tCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCtt < 6:95337/149‑1 (MQ=255) gAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGt > 8:163060/1‑149 (MQ=255) caAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCg < 2:306228/149‑1 (MQ=255) aaGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTAGGCCTTGTCCTCCgg > 5:33893/1‑149 (MQ=255) aaGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGAGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTGAAGCGccag > 7:250133/1‑126 (MQ=255) aaGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGAGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTGAAGCGccag < 8:250133/128‑3 (MQ=255) ccACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCGGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGc < 1:322711/149‑1 (MQ=255) cACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGtcct < 7:230124/140‑1 (MQ=255) cACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGtcct > 8:230124/1‑140 (MQ=255) cACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGc > 5:116573/1‑148 (MQ=255) aCTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCg > 4:316182/1‑148 (MQ=255) tCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGcc > 4:211531/1‑130 (MQ=255) tCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGcc < 3:211531/130‑1 (MQ=255) ccAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAAc < 3:316182/149‑1 (MQ=255) cAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAAcc > 3:149041/1‑149 (MQ=255) cAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAAc > 5:96408/1‑148 (MQ=255) ccTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCa < 7:163060/149‑1 (MQ=255) gTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACgg > 6:358259/1‑149 (MQ=255) tgCGTTCAGGCCAGCGGGATGATCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATTAATCCACACTTAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTccc < 5:230480/147‑1 (MQ=255) gCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGAGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCAt > 1:160028/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATcc > 1:311649/1‑149 (MQ=255) ttCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCt > 4:234848/1‑149 (MQ=255) cAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCtt < 2:311649/148‑1 (MQ=255) aGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCtt < 2:125486/100‑1 (MQ=255) aGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCtt > 1:125486/1‑100 (MQ=255) gCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATc < 2:255920/142‑1 (MQ=255) gCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATc > 1:255920/1‑142 (MQ=255) gCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGgt < 3:234848/149‑1 (MQ=255) cACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCa < 4:184246/130‑1 (MQ=255) cACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCa > 3:184246/1‑130 (MQ=255) ggATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACAcc < 8:13990/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CACCCCAggg < 4:149041/149‑2 (MQ=255) gCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGcccc < 6:116573/149‑1 (MQ=255) gccAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAg < 1:30357/146‑1 (MQ=255) gccAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAg > 2:30357/1‑146 (MQ=255) aGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCa < 6:363826/148‑1 (MQ=255) aGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCACCAGGTc > 5:363826/1‑146 (MQ=255) gggCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAgg < 2:160028/149‑1 (MQ=255) gATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGcacgt > 2:96435/1‑149 (MQ=255) gATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGcacgt < 6:33893/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACtt < 3:310942/149‑1 (MQ=255) aGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTgg < 5:358259/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGcc < 4:215726/59‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGcc > 3:215726/1‑59 (MQ=255) gCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGggctg > 2:281753/1‑149 (MQ=255) tGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGggctggc > 4:95819/1‑149 (MQ=255) ggCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGggctggct > 5:228972/1‑149 (MQ=255) ggATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGt > 7:291620/1‑148 (MQ=255) ccACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGAACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTg > 8:200873/1‑149 (MQ=255) cacaCTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCGTCGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGtt < 1:96435/148‑1 (MQ=255) acacTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGt < 1:281753/149‑1 (MQ=255) cacTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGTg < 8:291620/149‑1 (MQ=255) ttGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGTGCTACGc > 4:167132/1‑148 (MQ=255) aTCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCGTTCGGTGTAGAGCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGTGCTACGCCaa < 6:96408/148‑1 (MQ=255) aTCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGTGCTACGCCaa < 3:95819/148‑1 (MQ=255) ggCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGTGCTACGCCAAg < 7:200666/145‑1 (MQ=255) ggCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGTGCTACGCCAAg > 8:200666/1‑145 (MQ=255) | GTTGCAAGCGTGGCCCTGTCGAAACACAAGGCCACTCCAACCTGTAGAAGCGTTCAGGCCACCGGGATGAGCGGATCAGCTGCCGCCAGGGCCGATGCCCGGTCAGCCGCTGGCGGATAAATCCACACTGAATTGATCTGGCGCTTCAGCGCCTTGGCTTCGGCCTTGTCCTCCGGTGGCGAAACCTCACGGTCCCATCCTTCGGTGTACACCG‑CGCCCCAGGCCCCCAGGTCCAGGCACGTCACGTACTTGGGCTGGCTGTAAGCCGTTGGTGCTACGCCAAG > NC_002947/3268157‑3268440 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |