Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 74,166 | G→C | 7.4% | V214V (GTG→GTC) ‡ | PP_0063 → | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 74,166 | 0 | G | C | 7.4% | 214.7 / 5.4 | 67 | V214V (GTG→GTC) ‡ | PP_0063 | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/31); new base C (3/2); total (34/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.01e-01 |
TCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGAG > NC_002947/74023‑74312 | tCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGaa < 5:103961/149‑1 (MQ=255) aCCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACAt > 8:330706/1‑149 (MQ=255) cAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGc < 8:165642/149‑1 (MQ=255) ggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTgg < 6:14897/149‑1 (MQ=255) ggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTgg > 6:119102/1‑149 (MQ=255) ggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGCGGCCAGGTGGGTATTCATGCCAACCCGGAGCCGGCGGATTCGGCGGGCGTGTTCTTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAATTTCGTGCGGAAAATGATgg > 7:51673/1‑149 (MQ=255) aaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGcc < 5:316306/149‑1 (MQ=255) tCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTgg > 6:25352/1‑148 (MQ=255) aGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAgg < 3:194746/148‑1 (MQ=255) aTCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAg < 7:330706/148‑1 (MQ=255) aTCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAg < 7:157321/148‑1 (MQ=255) aTCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAg > 8:157321/1‑148 (MQ=255) tCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAgg > 4:46902/1‑141 (MQ=255) tCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAgg < 3:46902/141‑1 (MQ=255) tCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgt < 5:25352/149‑1 (MQ=255) ggAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgtgtgt > 8:263330/1‑149 (MQ=255) gTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCt < 3:172336/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCt > 4:172336/1‑149 (MQ=255) tggCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgt < 5:42605/130‑1 (MQ=255) tggCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgt > 6:42605/1‑130 (MQ=255) ccAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTg < 4:263052/106‑1 (MQ=255) ccAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTg > 3:263052/1‑106 (MQ=255) aGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTg > 6:139438/1‑149 (MQ=255) gTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGcc < 6:137114/149‑1 (MQ=255) ttCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATgg < 5:119102/148‑1 (MQ=255) cTGCCGACCCGGATCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGAt < 7:12233/143‑1 (MQ=255) cTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCg < 2:47769/149‑1 (MQ=255) cTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCCTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGAt > 8:12233/1‑143 (MQ=255) tGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGc < 8:95085/93‑1 (MQ=255) tGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGc > 7:95085/1‑93 (MQ=255) ccGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGc < 5:139438/149‑1 (MQ=255) aCCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgt > 7:12560/1‑107 (MQ=255) aCCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgt < 8:12560/107‑1 (MQ=255) ccGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTc > 8:186417/1‑147 (MQ=255) ccGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACAGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTc > 8:182904/1‑147 (MQ=255) cGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGCCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAg < 7:186417/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCaa > 1:250567/1‑136 (MQ=255) aaTCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCaa < 2:250567/136‑1 (MQ=255) ggcgggcgTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCTGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTg > 8:171967/1‑149 (MQ=255) ttCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgt < 6:270819/78‑1 (MQ=255) ttCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgt > 5:270819/1‑78 (MQ=255) cGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAagag < 7:182904/148‑1 (MQ=255) gTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGAt > 7:245968/1‑149 (MQ=255) tACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATg > 1:67564/1‑149 (MQ=255) gTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTgc < 8:98620/132‑1 (MQ=255) gTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTgc > 7:98620/1‑132 (MQ=255) tCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGGATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTc > 1:111683/1‑119 (MQ=255) tCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTc < 2:111683/119‑1 (MQ=255) ccTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCAACCGCAGCGCATGCAGGaa < 6:342331/97‑2 (MQ=255) ccTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCAACCGCAGCGCATGCAGGaa > 5:342331/1‑96 (MQ=255) cTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCAc > 1:63881/1‑149 (MQ=255) tCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCAcc > 2:77505/1‑149 (MQ=255) tCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGACCGTGGCAAGCCGGTAGGTGAGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTAAAGCAcc > 2:250719/1‑149 (MQ=255) gCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGAt < 2:63881/149‑1 (MQ=255) gCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGAt < 8:245968/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGaa < 1:77505/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAAt < 7:263330/149‑1 (MQ=255) caccggccAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAAtgtg > 2:74918/7‑149 (MQ=255) aCCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGGGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGAt > 4:216856/1‑135 (MQ=255) cAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAAt > 7:240026/1‑139 (MQ=255) cAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTcggcgg > 5:126357/1‑149 (MQ=255) cAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGGGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAAt < 8:240026/139‑1 (MQ=255) aGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGAt > 6:19782/1‑132 (MQ=255) aGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGAt < 5:19782/132‑1 (MQ=255) cAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTcggcggcgg > 4:286956/1‑149 (MQ=255) gTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGa < 3:286956/148‑1 (MQ=255) tGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGAg > 5:357332/1‑148 (MQ=255) | TCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGAG > NC_002947/74023‑74312 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |