| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,539,407 | G→A | 5.5% | A32T (GCC→ACC) | PP_3127 → | exopolysaccharide transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,539,407 | 0 | G | A | 5.5% | 222.8 / 2.5 | 73 | A32T (GCC→ACC) | PP_3127 | exopolysaccharide transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/32); new base A (2/2); total (39/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
TTTGACGTTGACGTACAGGTACCCCGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGCCGATGAGCGCATCGAGGTGATCCGTCAA > NC_002947/3539261‑3539553 | tttGCCCTTGACGTACAGGTACCCCGACATCTTAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTTACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCTAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTcgcc < 1:77398/149‑1 (MQ=255)tttGACGTTGACGTACAGGTACCCCGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTcgcc > 3:231548/1‑149 (MQ=255) tgacgttgacgtACAGGTACCCCGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTcgccgc > 7:181531/1‑149 (MQ=255) aCAGGTACCCCGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTcg < 4:188601/133‑1 (MQ=255) aCAGGTACCCCGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTcg > 3:188601/1‑133 (MQ=255) ggTACCCCGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACTAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTcgc < 2:156732/149‑1 (MQ=255) gTACCCCGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTcgcg > 7:42344/1‑149 (MQ=255) cGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATg > 8:37262/1‑149 (MQ=255) aCATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGt < 4:318431/149‑1 (MQ=255) cATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGt < 4:231548/148‑1 (MQ=255) tGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTgccgc > 6:168115/1‑149 (MQ=255) aaCTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGccgccg < 5:168115/149‑1 (MQ=255) aCTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGa < 7:37262/149‑1 (MQ=255) ttCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATc > 2:56631/1‑149 (MQ=255) 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cTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCgg > 1:74557/1‑148 (MQ=255) gTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTc > 6:225401/1‑149 (MQ=255) gTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCACCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTc > 6:214432/1‑149 (MQ=255) gTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCACAGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGTCACCATTc > 6:209225/1‑149 (MQ=255) aCTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGccgccg < 8:57320/119‑1 (MQ=255) aCTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCtggtg < 5:225401/149‑1 (MQ=255) aCTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCtggtg < 5:276097/149‑1 (MQ=255) cGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGt > 6:65024/1‑149 (MQ=255) cGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGt > 2:176701/1‑149 (MQ=255) gAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTc < 6:146112/149‑1 (MQ=255) tctcCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCgcag > 7:82132/1‑149 (MQ=255) tcCCTCATAGATTACATCGCCTTTATCAAGGACAGGGCCGTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCTCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCtggtg < 8:49515/138‑1 (MQ=255) tcCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTAtggtg > 7:49515/1‑138 (MQ=255) tcCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGACGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTATGGTGGACTCgcagca > 1:327644/1‑149 (MQ=255) ccTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCgcagca < 8:181531/147‑1 (MQ=255) ccTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGa < 3:75957/149‑1 (MQ=255) tCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGAtt > 3:27768/1‑149 (MQ=255) tCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGAtt > 1:143814/1‑149 (MQ=255) agagATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATg > 6:8984/1‑93 (MQ=255) gagaTTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCg > 5:157345/1‑149 (MQ=255) agaTTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGc < 1:176701/149‑1 (MQ=255) cATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAg < 1:56631/148‑1 (MQ=255) ccATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTgc > 4:79056/1‑84 (MQ=255) ccATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTgc < 3:79056/84‑1 (MQ=255) ccATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGgtg > 5:245910/1‑149 (MQ=255) cATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCtggt > 8:262444/1‑117 (MQ=255) cATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGc < 6:172618/143‑1 (MQ=255) cATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGc > 5:172618/1‑143 (MQ=255) cATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGgtgt < 4:27768/149‑1 (MQ=255) ttATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTc > 7:129936/1‑148 (MQ=255) aTCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCACCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGAc < 5:209225/149‑1 (MQ=255) tCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCACCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGAc < 5:214432/148‑1 (MQ=255) aGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaac < 6:245910/149‑1 (MQ=255) aGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaac < 8:129936/149‑1 (MQ=255) gACAGGGCGCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCAGCGAACGTGGGCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaacaa < 2:327644/149‑1 (MQ=255) gACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaacaa > 4:180253/1‑149 (MQ=255) gACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaacaa < 3:180253/149‑1 (MQ=255) aCAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaacaa > 5:5322/1‑148 (MQ=255) aCAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCaacaac < 6:5322/149‑1 (MQ=255) aCAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGAGTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaacaa > 7:73467/1‑148 (MQ=255) aatggCACTGGTGTTAGGGGTTAGTGCCGCAGGAATTCTCGCCGCGACCGTGTCCGGCGCGTTGATGGTGCCTCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCaacaac < 8:73467/145‑1 (MQ=255) ggCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAacaaca < 1:263331/146‑1 (MQ=255) ggCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAacaaca > 2:263331/1‑146 (MQ=255) gCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCg > 8:196212/1‑120 (MQ=255) gCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCg < 7:196212/120‑1 (MQ=255) ccTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCt > 8:223154/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCt > 5:242444/1‑149 (MQ=255) gtgtTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGc < 8:82132/149‑1 (MQ=255) gtgtTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGc < 6:157345/149‑1 (MQ=255) tGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGCCGATGAGCGCATc < 2:143814/148‑1 (MQ=255) ccGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCtg < 6:319334/77‑1 (MQ=255) ccGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCtg > 5:319334/1‑77 (MQ=255) cGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGCCGATGAGCGCATCGAgg > 6:295139/1‑149 (MQ=255) gCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGCCGATGAGCGCATCGAGGt < 5:65024/149‑1 (MQ=255) aTTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGCCGATGAGCGCATCGAGGTGATCCg > 6:116334/1‑149 (MQ=255) aTTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGCCGATGAGCGCATCGAGGTGATCCg > 5:213057/1‑149 (MQ=255) ttCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaac < 6:7171/110‑1 (MQ=255) ttCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACcaac > 5:7171/1‑110 (MQ=255) tcGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCAGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGCCGATGAGCGCATAGAGGTGATCCGTCaa > 2:223302/1‑149 (MQ=255) | TTTGACGTTGACGTACAGGTACCCCGACATCTGAACTTCAGGCAGGTGGCCCTATGAAGTCTGACTACGAGCTCTCCCTCAGAGATTACATCGCCATTATCAAGGACAGGGCCCTGGTGTTAGGGGTGAGTGCCGCAGTCATTCTCGCCGCGACCGTGGCCGTCGCGTTGATGGTGCCGCCGATCTACCAGTCGACCGGCACCATTCTGGTGGAGTCGCAGCAGATTTCGCCTGAGCTGGTGTCGACCAACAACACCAGCTTTGCCGATGAGCGCATCGAGGTGATCCGTCAA > NC_002947/3539261‑3539553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |