Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,911,965 | T→G | 7.0% | L104R (CTG→CGG) ‡ | PP_3452 → | GGDEF domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,911,965 | 0 | T | G | 7.0% | 212.7 / 2.8 | 69 | L104R (CTG→CGG) ‡ | PP_3452 | GGDEF domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/37); new base G (2/3); total (29/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCGGCGACCAAGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAAT > NC_002947/3911818‑3912107 | tCGGCGACCAAGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTg > 7:276142/1‑149 (MQ=255) gCGACCAAGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGt > 3:77229/1‑148 (MQ=255) aCCAAGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATc > 6:140204/1‑149 (MQ=255) cAAGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGa < 4:302070/149‑1 (MQ=255) aaGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGaa < 4:31859/149‑1 (MQ=255) aGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAg < 1:310350/149‑1 (MQ=255) aGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAg < 1:243552/149‑1 (MQ=255) aGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAg < 5:301151/149‑1 (MQ=255) ttCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCAt > 3:246851/1‑149 (MQ=255) cACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATc < 7:232841/148‑1 (MQ=255) cACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATc < 7:228483/148‑1 (MQ=255) cACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATc < 3:197740/148‑1 (MQ=255) ccTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGaa < 6:34322/140‑1 (MQ=255) ccTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGaa > 5:34322/1‑140 (MQ=255) gTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACACTGGGCATCCCCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGcac > 8:266997/1‑147 (MQ=255) tccttcctGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATc < 2:170320/129‑1 (MQ=255) tccttcctGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATc > 1:170320/1‑129 (MQ=255) ttcctGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAgg < 7:50639/131‑1 (MQ=255) ttcctGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAgg > 8:50639/1‑131 (MQ=255) gTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCgg > 6:166770/1‑149 (MQ=255) ttCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGaa > 4:301589/1‑123 (MQ=255) ttCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGaa < 3:301589/123‑1 (MQ=255) aTCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCTTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGtgtg > 5:361277/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGtgtg > 8:89776/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCTCGGGAGGCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACGCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGTTAGCCCTGCGCCCGGTGtggtt < 7:266997/149‑1 (MQ=255) cccTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGtggttg < 4:77229/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGtggttgg > 7:209284/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGtggttgg > 4:68033/1‑149 (MQ=255) ggCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGttgttg < 3:168216/138‑3 (MQ=255) ggCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGATGtgg > 4:168216/1‑138 (MQ=255) gCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCGTCACCCTGGGCATGCGCCGGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGGTGGTGCTCggg < 5:155748/149‑1 (MQ=255) gCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCggg < 7:89776/149‑1 (MQ=255) aGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGgt < 1:215854/149‑1 (MQ=255) aGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGgt < 2:9027/149‑1 (MQ=255) aGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGgt < 3:259832/149‑1 (MQ=255) gTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGt < 4:246851/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCt < 6:308166/149‑1 (MQ=255) ctgcATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGt < 8:276142/148‑1 (MQ=255) ctgcATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTAATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCAACCGTGCTGTa > 1:275015/1‑149 (MQ=255) gcATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATg > 1:75789/1‑149 (MQ=255) aTTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGcc < 5:131344/149‑1 (MQ=255) cgccgcAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGt < 2:75789/149‑1 (MQ=255) ccgcAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGc < 5:140204/149‑1 (MQ=255) cATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCggg < 5:45439/111‑1 (MQ=255) cATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCggg > 6:45439/1‑111 (MQ=255) aTCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTg > 2:259270/1‑149 (MQ=255) ttCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTAc < 1:316917/139‑1 (MQ=255) ttCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTAc > 2:316917/1‑139 (MQ=255) gACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTACTACCGGTGCGGCGCTg < 6:361277/149‑1 (MQ=255) cTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCAt < 8:209284/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATtcttct < 1:259270/149‑1 (MQ=255) tgctgTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTgc > 2:278200/1‑149 (MQ=255) ttCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTgc < 3:223097/144‑1 (MQ=255) ttCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTgc > 4:223097/1‑144 (MQ=255) ttCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCa < 5:166770/148‑1 (MQ=255) aTTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTAc < 8:306861/115‑1 (MQ=255) aTTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTAc > 7:306861/1‑115 (MQ=255) ttcgatcaCCAGGCGCATGCCCAGGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGtcatca > 3:786/5‑149 (MQ=255) ttcgatcaCCAGGCGCATGCCCAGGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGtcatca > 7:322870/5‑149 (MQ=255) tcaCCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGtcatc > 1:41600/1‑143 (MQ=255) tcaCCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGtcatc < 2:41600/143‑1 (MQ=255) tcaCCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTgg < 2:275015/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCAcccaggt > 6:324543/1‑144 (MQ=255) cccTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGt > 7:30779/1‑148 (MQ=255) ccTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATg > 2:268807/1‑133 (MQ=255) ccTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATg < 1:268807/133‑1 (MQ=255) caggcgCATGCCCAGGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGa < 4:786/144‑1 (MQ=255) gcgCATGCCCAGGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGc < 8:322870/147‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAAt < 8:30779/149‑1 (MQ=255) | TCGGCGACCAAGGCTTCACCTGGCTGTCCTTCCTGTTCATCGCCCTGCTCGGCAGCCTGATCGTAGTGCTGCATTTCACCCGCCGCAGCCATCACTTCGACGTGCTCAACCTGCTGTTCATTACCGTCATCACCCTGGGCATGCGCCTGGTGATCGAAGGCATCCCGATAGCCCTGCGCCCGGTGTGGTTGGTGCTCGGGGTGTCCACCGTGCTGTATGCCATGTCGGTGCTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAAT > NC_002947/3911818‑3912107 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |