Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,006,733 | C→A | 6.0% | A381A (GCG→GCT) | PP_3535 ← | gamma‑glutamyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,006,733 | 0 | C | A | 6.0% | 214.7 / 3.3 | 67 | A381A (GCG→GCT) | PP_3535 | gamma‑glutamyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/32); new base A (2/2); total (33/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 |
TCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGCCAACGGCGGGGCTTCCAGG > NC_002947/4006585‑4006880 | caacggCCAGGCCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGcgcc > 3:139373/5‑149 (MQ=255) cATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGcgccg > 8:155276/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCcgcgc < 2:189100/148‑1 (MQ=255) gggCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTg > 2:9112/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCGGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGc < 4:331070/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGc < 5:86008/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGcc < 7:155276/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCa < 7:289042/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGCCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCCATCAGCCCCGCGCGGATGGc > 3:230520/1‑147 (MQ=255) cGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTaa < 4:139373/149‑1 (MQ=255) gTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCa < 6:309702/148‑1 (MQ=255) gTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCa < 5:154849/148‑1 (MQ=255) cATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGaa > 7:327165/1‑149 (MQ=255) aTCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAAt > 4:191947/1‑149 (MQ=255) gTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGa > 2:236199/1‑149 (MQ=255) tGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGAc < 3:191947/149‑1 (MQ=255) agagGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGAcc < 1:23681/148‑1 (MQ=255) tGGAGATGCGCAGTGGGGTGCGGTCGGGCGCAAGCGCCATGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACg < 4:230520/149‑1 (MQ=255) ggAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAg < 7:254706/119‑1 (MQ=255) ggAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAg > 8:254706/1‑119 (MQ=255) gagaTGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGTGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACggg > 2:19864/1‑149 (MQ=255) agaTGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGc > 4:62415/1‑149 (MQ=255) gcgcAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGTCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCgg > 8:126472/1‑100 (MQ=255) gcgcAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCgg < 7:126472/100‑1 (MQ=255) cgcAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACg > 8:21490/1‑147 (MQ=255) cgcAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTa < 1:9112/149‑1 (MQ=255) gcAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAg > 7:135487/1‑149 (MQ=255) gcAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAg > 5:204465/1‑149 (MQ=255) tGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAAt > 8:244454/1‑113 (MQ=255) tGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAAt < 7:244454/113‑1 (MQ=255) cGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGt < 8:135487/149‑1 (MQ=255) aGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCg < 6:204465/149‑1 (MQ=255) gCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTc < 1:188827/147‑1 (MQ=255) gCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTc > 2:188827/1‑147 (MQ=255) cGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACgg > 8:62309/1‑130 (MQ=255) cGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACgg < 7:62309/130‑1 (MQ=255) acctggCGCTTGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGTCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGc > 4:264288/5‑147 (MQ=255) tCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCNGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAg < 1:321764/135‑1 (MQ=255) tCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGNGCNTTGACCGGGACGGGCACNTAg > 2:321764/1‑135 (MQ=255) tCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAg > 2:316675/1‑135 (MQ=255) tCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAg < 1:316675/135‑1 (MQ=255) tCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAg > 3:292862/1‑149 (MQ=255) gggCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCg < 7:327600/136‑1 (MQ=255) gggCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCg > 8:327600/1‑136 (MQ=255) gcgcAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGtt < 7:69170/136‑1 (MQ=255) gcgcAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGtt > 8:69170/1‑136 (MQ=255) gcAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGaa > 1:327014/1‑96 (MQ=255) gcAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGaa < 2:327014/96‑1 (MQ=255) aaGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGAc > 8:243297/1‑111 (MQ=255) aaGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGAc < 7:243297/111‑1 (MQ=255) cgcCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAgcgc < 1:236199/149‑1 (MQ=255) gcCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGc > 7:10535/1‑117 (MQ=255) gcCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGc < 8:10535/117‑1 (MQ=255) cTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAggg > 8:28515/1‑87 (MQ=255) cTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAggg < 7:28515/87‑1 (MQ=255) gCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAg > 4:153350/1‑136 (MQ=255) gCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAg < 3:153350/136‑1 (MQ=255) ccGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGcc < 6:205512/77‑1 (MQ=255) ccGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGcc > 5:205512/1‑77 (MQ=255) cgcgcTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCAGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGAt > 6:297518/1‑148 (MQ=255) cgcgcTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCAGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGAt > 6:292627/1‑148 (MQ=255) gcgcTTCCTGCTGGGCGCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAAGCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTGGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCa < 4:218310/149‑1 (MQ=255) cTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGt < 8:327165/149‑1 (MQ=255) cTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGc > 3:150386/1‑149 (MQ=255) tgtgCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGc > 1:330230/1‑148 (MQ=255) gCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGctcggcctcgg < 8:88085/125‑1 (MQ=255) ccGATCAGCGCAGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGCCAAcggcgg < 5:297518/149‑1 (MQ=255) ccGATCAGCGCAGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGCCAAcggcgg < 5:292627/149‑1 (MQ=255) gATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGCCAACGGCgggg > 6:357598/1‑149 (MQ=255) aGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGCCAACGGCGGGGCTTc > 5:271078/1‑149 (MQ=255) ccgcGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGCCAACGGCGGGGCTTCCAgg < 2:330230/149‑1 (MQ=255) | TCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGGCCAGGTAAGCAGAATCGGTCAGGGCCTTGACCGGGACGGGCACGTAGTCGTTGTCGGCCAGGTACTGAGCGCGATCGGCGTAGGCCAGGCGCTCGGCCTCGGCGATCAGGTGCACGGCCAACGGCGGGGCTTCCAGG > NC_002947/4006585‑4006880 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |