Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,062,318 | G→T | 10.6% | P674H (CCC→CAC) | PP_3581 ← | membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,062,318 | 0 | G | T | 10.6% | 191.3 / 12.5 | 66 | P674H (CCC→CAC) | PP_3581 | membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/27); new base T (4/3); total (36/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.67e-01 |
CGCCGATGTAGAGCGCATCATCGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGCATCGTC > NC_002947/4062170‑4062466 | cgccgATGTAGAGCGCATCATCGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACgg < 5:354613/149‑1 (MQ=255) gATGTAGAGCGCATCATCGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTg < 7:111474/149‑1 (MQ=255) catcatCGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAgg > 6:61091/1‑148 (MQ=255) atcatcGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCcagca > 8:93183/1‑145 (MQ=255) atcatcGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCcagca < 7:93183/145‑1 (MQ=255) tcatcGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAg > 8:261890/1‑149 (MQ=255) tcatcGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAg > 8:257023/1‑149 (MQ=255) tcatcGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAg > 8:125356/1‑149 (MQ=255) atcGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCAGCCCGTGCCGGccga < 7:318300/139‑3 (MQ=255) atcGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCAGCCCGTGCCGGccga > 8:318300/1‑137 (MQ=255) cGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAAc > 7:124589/1‑148 (MQ=255) tCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAg < 8:124589/149‑1 (MQ=255) gAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGTCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTc < 5:61091/149‑1 (MQ=255) ggAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTGGGCCAGCCCGTGCCGGCCgagcagt < 2:220579/127‑2 (MQ=39) ggAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTGGGCCAGCCCGTGCCGGCCgagcagt > 1:220579/1‑126 (MQ=39) aTGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACgg < 7:261890/149‑1 (MQ=255) aTGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACgg < 7:257023/149‑1 (MQ=255) cTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTgg < 8:298463/106‑1 (MQ=255) cTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGt > 2:115073/1‑147 (MQ=255) ttCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTGGGCCAGCCCGTGCCGGCCgagcagttc > 8:218958/1‑113 (MQ=38) ttCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTGGGCCAGCCCGTGCCGGCCgagcagttc < 7:218958/116‑4 (MQ=38) ttCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTc > 2:314923/1‑147 (MQ=255) ttCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTc < 1:314923/147‑1 (MQ=255) atttccGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGaa < 1:237545/145‑1 (MQ=255) aTACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGaa < 7:125356/149‑1 (MQ=255) ccGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACgg < 7:191255/137‑1 (MQ=255) ccGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACgg > 8:191255/1‑137 (MQ=255) ccGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAATCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTcc > 6:158292/1‑149 (MQ=255) cGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCct > 5:331769/1‑149 (MQ=255) gCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCctg > 5:60276/1‑149 (MQ=255) ccTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGaa > 8:105053/1‑142 (MQ=255) ccTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGaa < 7:105053/142‑1 (MQ=255) tttACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCctgctg > 2:279305/1‑149 (MQ=255) gcgATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGtt < 6:331769/149‑1 (MQ=255) tGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCaa < 1:115073/149‑1 (MQ=255) aGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCaa < 3:101558/146‑1 (MQ=255) aGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCaa > 4:101558/1‑146 (MQ=255) aGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAAccc > 6:228717/1‑149 (MQ=255) gCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCgg < 5:228717/149‑1 (MQ=255) tGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGATGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACg > 2:239330/1‑148 (MQ=255) gTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAgg > 2:229918/1‑149 (MQ=255) ccGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCgg < 6:227803/132‑1 (MQ=255) ccGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCgg > 5:227803/1‑132 (MQ=255) cccATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGc > 5:72635/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCCCATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTg > 2:30236/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGACCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTg > 3:329296/1‑149 (MQ=255) cTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTg > 1:102522/1‑144 (MQ=255) cTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTg < 2:102522/144‑1 (MQ=255) gCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGcgacga > 8:230396/1‑149 (MQ=255) tCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTcc > 7:113329/1‑80 (MQ=255) tCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTcc < 8:113329/80‑1 (MQ=255) tCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGAtt > 8:11230/1‑149 (MQ=255) tCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGAtt > 1:208821/1‑149 (MQ=255) tCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGG‑CCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTg > 7:82331/1‑149 (MQ=255) cATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGt < 6:213831/139‑1 (MQ=255) cATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGt < 6:219003/139‑1 (MQ=255) cATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGt > 5:213831/1‑139 (MQ=255) cATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGt > 5:219003/1‑139 (MQ=255) cTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGaaa < 2:208821/149‑1 (MQ=255) tGCTGGGCCAGCCCGTGCCGGCCGAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGaaa > 3:142862/1‑148 (MQ=255) gCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAAc > 2:90683/1‑148 (MQ=255) cggccggcACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGcgacga < 2:152043/135‑1 (MQ=255) cggccggcACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGcgacga > 1:152043/1‑135 (MQ=255) gccggcACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGc < 7:11230/149‑1 (MQ=255) gccggcACGGGCTGG‑CCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCt < 8:82331/149‑1 (MQ=255) ggcACGGGCTGGTCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTACCGAAACAATCGCTGc < 4:329296/149‑1 (MQ=255) ggcACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGc < 1:90683/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGCATCGTc < 6:72635/149‑1 (MQ=255) | CGCCGATGTAGAGCGCATCATCGAGGCCGTCGAGGCGGAAATGGATGCCTTCATACCCGCCTTTACCTTGCGCGATGCAGTCTAGCCCGCAGCAGTGAGTTCCGGGCCCATGGCCTGCAACTTGCTCATGAACTGCTCGGCCGGCACGGGCTGGCCCAGCAGGTAGCCCTGCAACGAGTCACATCCCAGACGGGTCAGGAAGTCCTGCTGCTTGTCGGTTTCAACCCCCTCGGCAACGATACGCAGGCCCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGCATCGTC > NC_002947/4062170‑4062466 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |