Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,287,332 | C→G | 5.3% | G135A (GGC→GCC) | PP_3758 ← | two component system response regulator/sensor histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,287,332 | 0 | C | G | 5.3% | 242.5 / 3.7 | 75 | G135A (GGC→GCC) | PP_3758 | two component system response regulator/sensor histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/36); new base G (2/2); total (37/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 |
GCGTACGCACCTCGTGGGAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCCCGCCGCGCTGAC > NC_002947/4287189‑4287480 | gcgTACGCACCTCGTGGGAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGc < 6:178371/149‑1 (MQ=255) gCACCTCGTGGGAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTg > 3:230032/1‑149 (MQ=255) cACCTCGTGGGAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTgc < 6:108260/149‑1 (MQ=255) gTGGGAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTgg < 5:419/148‑1 (MQ=255) tGGGAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCg < 4:230032/149‑1 (MQ=255) gggAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCgg < 8:307074/149‑1 (MQ=255) ggAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCgg > 6:240658/1‑148 (MQ=255) ggAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCgg > 4:318074/1‑148 (MQ=255) gagaCGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGaa < 5:245474/149‑1 (MQ=255) agaCGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAAc < 1:236143/149‑1 (MQ=255) aaGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAacac > 4:144689/1‑149 (MQ=255) aaGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAacac > 5:87557/1‑149 (MQ=255) gtcgtcACGCATGCGCCCGGCGTGCTCCAGCTCACCCCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACAcc > 3:229192/1‑148 (MQ=255) gtcgtcACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCg < 3:144689/149‑1 (MQ=255) tcgtcACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGGCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACAcc > 6:278242/1‑147 (MQ=255) tcgtcACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGGCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACAcc > 6:273451/1‑147 (MQ=255) tcgtcACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGGCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCga < 5:278242/149‑1 (MQ=255) tcgtcACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGGCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCga < 5:273451/149‑1 (MQ=255) gtcACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCgag < 3:318074/148‑1 (MQ=255) tcACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGAc < 5:197784/149‑1 (MQ=255) tGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCtt < 7:87935/149‑1 (MQ=255) tGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCATCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑g < 6:34201/149‑1 (MQ=255) tGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑g < 5:240658/149‑1 (MQ=255) cTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGt > 5:151227/1‑113 (MQ=255) cTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGt < 6:151227/113‑1 (MQ=255) tCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGgt > 4:168309/1‑149 (MQ=255) tCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGgt > 3:99405/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGgtg > 2:270321/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTCTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGCTCGACGAACACCGAGACCTTGAATTTTACCGCCA‑GGgtg > 2:174022/1‑149 (MQ=255) cAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGc < 6:256020/131‑1 (MQ=255) acCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGc < 6:87557/149‑1 (MQ=255) acCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGc > 8:168215/1‑149 (MQ=255) cGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAATCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGATCACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCtt < 4:229192/149‑1 (MQ=255) ccACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTtgtg > 7:107412/1‑148 (MQ=255) cgcatGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGCCGAGCGGCTTGTGc < 7:299580/144‑1 (MQ=255) cACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCa > 8:258701/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGgaa < 8:107412/147‑1 (MQ=255) cAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGaaa < 7:258701/147‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTc > 4:124064/1‑149 (MQ=255) ggctgAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACg > 1:187596/1‑149 (MQ=255) gctgAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCAc < 3:168309/147‑1 (MQ=255) gcTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCg > 5:59496/1‑149 (MQ=255) tCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGc < 1:124512/123‑1 (MQ=255) tCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGc > 2:124512/1‑123 (MQ=255) tCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCg > 8:181230/1‑147 (MQ=255) tCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCg > 7:17941/1‑147 (MQ=255) ccTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTtgtg < 8:150987/121‑1 (MQ=255) ccTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTtgtg > 7:150987/1‑121 (MQ=255) ccTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAg > 2:31223/1‑149 (MQ=255) ttCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCt < 3:124064/149‑1 (MQ=255) gcggcTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGGTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAg < 1:174022/148‑1 (MQ=255) gcggcTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCACCGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAg < 1:270321/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCa < 2:337123/112‑1 (MQ=255) tCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCa > 1:337123/1‑112 (MQ=255) tCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACg > 1:191010/1‑114 (MQ=255) tCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACg < 2:191010/114‑1 (MQ=255) tCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACATTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCa > 5:45452/1‑148 (MQ=255) ccAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCAtc > 4:290661/1‑149 (MQ=255) aGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGaaa < 7:179867/104‑1 (MQ=255) aGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGaaa > 8:179867/1‑104 (MQ=255) ggCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTcgc > 5:244272/1‑149 (MQ=255) gCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTcgcg > 4:201016/1‑149 (MQ=255) gCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTcgcg < 2:187596/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCAtctacggc > 3:33946/1‑144 (MQ=255) gCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCccgcc > 4:293084/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGcc > 2:133354/1‑115 (MQ=255) gCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGcc < 1:133354/115‑1 (MQ=255) ccGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCCCGCCgcgc > 2:27123/1‑149 (MQ=255) cGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCCCGCcgcgtt < 3:290661/149‑3 (MQ=255) ggCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCGGGCcgcgaga < 4:99405/149‑4 (MQ=255) ggCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCGGGCcgcgaga < 3:201016/149‑4 (MQ=255) ggCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCCCGCCGCGCTg < 1:31223/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCACCTTGCGCTGGGGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTcgcg > 3:135593/1‑135 (MQ=255) gCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTcgcg < 4:135593/135‑1 (MQ=255) gCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCCCGCCGCGCTGa > 1:269442/1‑149 (MQ=255) ccAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCCCGCCGCGCTGAc > 7:252290/1‑149 (MQ=255) | GCGTACGCACCTCGTGGGAGACGATCGACATGAAGTCGTCACGCATGCGCACGGCGTGCTCCAGCTCACACCGTGCCACCTGCAGCTGGCTGAGCAGCAGCTCCTGTTCCTGGCGGCTCTGCTCCAGGGCTTCCAGCTGCCGGCCAAGCACCTTGCGCTGGCGGAACAGGTCGACGAACACCGAGACCTTGCTTTTTACCGCCA‑GGGTGTCGAGCGGCTTGTGCAGAAAGTCCACGGCCCCGCTCTCGTAGCCCTTGAAGGCATAATTCATCTCGCGGCCCGCCGCGCTGAC > NC_002947/4287189‑4287480 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |