| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,519,450 | A→G | 9.4% | F24L (TTC→CTC) | clpA ← | ATP‑dependent serine protease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,519,450 | 0 | A | G | 9.4% | 166.4 / 7.7 | 64 | F24L (TTC→CTC) | clpA | ATP‑dependent serine protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/31); new base G (3/3); total (30/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.70e-01 | |||||||||||
TCGTTGACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTG > NC_002947/4519302‑4519588 | tcgtTGACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGaa < 7:115009/149‑1 (MQ=255)tcgtTGACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGaa > 6:234532/1‑149 (MQ=255) gtTGACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGaa > 4:15481/1‑147 (MQ=255) gtTGACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGaa < 3:15481/147‑1 (MQ=255) gACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCa < 6:344826/148‑1 (MQ=255) aCAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCAt > 3:1727/1‑148 (MQ=255) aCAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATg < 4:1727/149‑1 (MQ=255) aGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAGTTCATGAc > 4:55014/1‑149 (MQ=255) gATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCt > 4:292405/1‑149 (MQ=255) cAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAGTTCATGAccgt < 5:344733/146‑4 (MQ=255) cAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAGTTCATGAccgt > 6:344733/1‑143 (MQ=255) aaCGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGaa > 2:177778/1‑134 (MQ=255) aaCGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAGTTCATGAccgtcga < 3:55014/148‑7 (MQ=255) aCGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGaa > 2:327516/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACgg < 3:50782/149‑1 (MQ=255) gtggtgGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGc < 1:327516/149‑1 (MQ=255) gtggAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGcctc < 3:292405/149‑1 (MQ=255) aGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTg < 3:70942/149‑1 (MQ=255) tCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTg > 4:189082/1‑147 (MQ=255) gATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAgg > 2:37965/1‑149 (MQ=255) gATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAgg > 4:261329/1‑149 (MQ=255) aTGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAgg > 5:45039/1‑148 (MQ=255) ttGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGcctcc < 4:342125/133‑1 (MQ=255) ttGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGcctcc > 3:342125/1‑133 (MQ=255) gCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAgg > 6:361721/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAg < 5:234532/148‑1 (MQ=255) aGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGa > 6:168039/1‑111 (MQ=255) aGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGa < 5:168039/111‑1 (MQ=255) aGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGt > 1:128395/1‑149 (MQ=255) aGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGt > 1:214331/1‑149 (MQ=255) aGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGAGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATTCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCGTCGAACGGGCCTCCTTGAATGCAAGATTGAGGGt < 3:46993/149‑1 (MQ=255) tGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTc < 6:45039/149‑1 (MQ=255) tGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTc < 7:205078/149‑1 (MQ=255) gCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTc > 1:132476/1‑148 (MQ=255) cTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGa < 3:256849/149‑1 (MQ=255) gagaTTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGttt < 3:189082/148‑1 (MQ=255) gaTTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTaa < 2:132476/148‑1 (MQ=255) ggCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATa < 2:131928/148‑1 (MQ=255) gcCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACa > 2:46932/1‑143 (MQ=255) gcCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACa < 1:46932/143‑1 (MQ=255) gcCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCtt > 5:99821/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGc > 4:120473/1‑146 (MQ=255) ccACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGc < 3:120473/146‑1 (MQ=255) gcgcgcACAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAACGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCAAGACGCTTCGAACGGCCCTCCTTGAAGGCAAGATTGACGGTGACATCGAGCTAGCGGTTTAACATAGCTACACCTc > 8:24910/1‑148 (MQ=255) cgcgcAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCAt < 7:24910/149‑1 (MQ=255) gcgcAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCt < 1:344108/139‑1 (MQ=255) gcgcAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCt > 2:344108/1‑139 (MQ=255) gAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATAccc > 4:160770/1‑147 (MQ=255) gAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCaa < 2:128395/149‑1 (MQ=255) gAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCaa < 2:214331/149‑1 (MQ=255) aaCGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAg < 5:361721/149‑1 (MQ=255) aCGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGt < 3:261329/149‑1 (MQ=255) cTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCTGTTTAACATAGCTTCACCTCAt < 8:302295/127‑1 (MQ=255) cTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCAt > 7:302295/1‑127 (MQ=255) cTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAAc > 1:153141/1‑149 (MQ=255) cTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGAAGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCCCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAAc > 1:20674/1‑149 (MQ=255) gTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACTTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTcc < 1:37965/148‑1 (MQ=255) gTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCt > 4:316982/1‑149 (MQ=255) tCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCaaa > 1:201891/1‑126 (MQ=255) tCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCaaa < 2:201891/127‑2 (MQ=255) tCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCAGACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCtt > 5:316892/1‑149 (MQ=255) aGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCCCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGAt < 2:20674/149‑1 (MQ=255) tCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTcaca < 6:234851/137‑1 (MQ=255) tCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTcaca > 5:234851/1‑137 (MQ=255) agcgTCATGAGTTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACag > 3:208594/4‑135 (MQ=255) agcgTCATGAGTTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACag < 4:208594/132‑1 (MQ=255) aCGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg < 6:99821/149‑1 (MQ=255) aTGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTaa > 6:240947/1‑71 (MQ=255) aTGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTaa < 5:240947/71‑1 (MQ=255) | TCGTTGACAGGGATCAACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTG > NC_002947/4519302‑4519588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |