| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,774,801 | T→G | 5.3% | D1489A (GAC→GCC) | pvdD ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,774,801 | 0 | T | G | 5.3% | 230.9 / 2.9 | 75 | D1489A (GAC→GCC) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/34); new base G (2/2); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 | |||||||||||
CCAGCATCGGCAGTTGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTGGAACAGCGGGTTTTG > NC_002947/4774661‑4774949 | ccAGCATCGGCAGTTGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGc > 6:300170/1‑149 (MQ=255) cATCGGCAGTTGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTcgg < 1:63225/149‑1 (MQ=255) aTCGGCAGTTGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTcggc > 3:241586/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGTTGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTcggcg < 6:148069/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTAt > 3:256689/1‑149 (MQ=255) aGTTGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATc < 6:101173/149‑1 (MQ=255) ttGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATc > 4:248275/1‑147 (MQ=255) ttGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATc > 2:252502/1‑147 (MQ=255) ttGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCa < 2:277041/149‑1 (MQ=255) gACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCAAgcgc > 4:51655/1‑147 (MQ=255) ccTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATc < 7:34994/136‑1 (MQ=255) ccTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATc > 8:34994/1‑136 (MQ=255) cTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCg > 3:163174/1‑148 (MQ=255) tGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAgc < 8:73668/138‑1 (MQ=255) tGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAgc > 7:73668/1‑138 (MQ=255) cGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTg > 4:145641/1‑149 (MQ=255) gTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTcggcg > 5:103720/1‑121 (MQ=255) gTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTcggcg < 6:103720/121‑1 (MQ=255) tCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCt < 4:255961/149‑1 (MQ=255) gcgACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATCGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCATCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCtgt > 7:142596/1‑149 (MQ=255) tcctgctgGCCTTGAGCAGATTGCGCCAGTGCGGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGTCGGTCGTACTGTTCGGTGGCGAAGGTAAAATCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGTCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGATCTGGGTGCtgttc < 8:142596/147‑3 (MQ=255) aTGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAg > 7:296643/1‑125 (MQ=255) aTGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAg < 8:296643/125‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCAcc < 4:135585/147‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCt < 4:241586/148‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTg > 8:72028/1‑149 (MQ=255) tGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGc < 4:256689/149‑1 (MQ=255) tGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCGCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGc < 3:56890/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCtgt < 3:143815/140‑1 (MQ=255) ggCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCtgt > 4:143815/1‑140 (MQ=255) aGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGAc < 3:145641/149‑1 (MQ=255) cAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACgg < 1:194239/149‑1 (MQ=255) aTTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCt < 7:200168/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTgg > 3:313114/1‑115 (MQ=255) ccAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTgg < 4:313114/115‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGAc > 5:210538/1‑137 (MQ=255) cAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGAc < 6:210538/137‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTg > 3:173965/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTg > 2:54041/1‑147 (MQ=255) gTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCa < 3:248275/149‑1 (MQ=255) tGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAGCGTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCa < 1:252502/149‑1 (MQ=255) ggaccATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGcccc < 4:173965/146‑1 (MQ=255) gCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGTGTGCTGTGCACCTGCCTGTCGACGGCCTCGATGTGCAGCCCCGGCACTTc < 5:300170/148‑1 (MQ=255) gCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTcc > 5:104321/1‑149 (MQ=255) gCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTcc > 5:336372/1‑149 (MQ=255) tCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCg > 2:118712/1‑149 (MQ=255) tCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGc < 4:246960/104‑1 (MQ=255) tCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGc > 3:246960/1‑104 (MQ=255) tGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAAGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGcc > 1:180106/1‑149 (MQ=255) gCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCtt > 8:293406/1‑149 (MQ=255) gTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTgg > 8:63856/1‑149 (MQ=255) gTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCt > 4:8405/1‑107 (MQ=255) gTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCt < 3:8405/107‑1 (MQ=255) gTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCt > 7:322433/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGt > 4:132829/1‑127 (MQ=255) ttCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGt < 3:132829/127‑1 (MQ=255) ttCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCtt > 1:127826/1‑137 (MQ=255) ttCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCtt < 2:127826/137‑1 (MQ=255) ggTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCtgg < 7:63856/148‑1 (MQ=255) cGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTg < 1:54041/149‑1 (MQ=255) cGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTg < 6:336372/149‑1 (MQ=255) gAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTg > 4:309056/1‑148 (MQ=255) gAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTg > 2:304762/1‑148 (MQ=255) aGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAAc < 1:118712/149‑1 (MQ=255) gTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGGGGGTTTGGGGTGGGGGTGGTGGTTgttctt > 2:139353/1‑144 (MQ=255) aaaaGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAAc > 4:28981/1‑145 (MQ=255) aaaaGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAAc < 3:28981/145‑1 (MQ=255) aaaaGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCa > 7:78088/1‑149 (MQ=255) aaaaGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCCCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCa > 8:213333/1‑149 (MQ=255) aaaGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCa > 8:140501/1‑148 (MQ=255) gCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTg < 7:293406/149‑1 (MQ=255) gCTGACGGCATGACGGCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCtggtg < 6:182610/134‑1 (MQ=255) gCTGACGGCATGACGGCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCtggtg > 1:103430/1‑134 (MQ=255) gCTGACGGCATGACGGCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCtggtg < 2:103430/134‑1 (MQ=255) gCTGACGGCATGACGGCAGCGTGCTAGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCtggtg > 5:182610/1‑134 (MQ=255) ccgtcatgccgtcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTGGAAc < 7:140501/149‑1 (MQ=255) ccgtcatgccgtcaGCGTGCTCGGCGGAATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTTGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTGGaa > 1:343383/1‑148 (MQ=255) gtcatgccgtcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCAcc < 5:174410/141‑1 (MQ=255) gtcatgccgtcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCAcc > 6:174410/1‑141 (MQ=255) atgccgtcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCtggt < 2:160149/124‑1 (MQ=255) atgccgtcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCtggt > 1:160149/1‑124 (MQ=255) atgccgtcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTGGAACAGCgg < 4:166436/149‑1 (MQ=255) cgtcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTGGAACAGCGGGttt < 8:78088/149‑1 (MQ=255) gtcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTGGAACAGCGGGtttt < 2:180106/149‑1 (MQ=255) tcaGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTGGAACAGCGGGTTTTg < 1:304762/149‑1 (MQ=255) | CCAGCATCGGCAGTTGCGCGACCACCTGGTTGGCGTCGCGACTGATGGCCTGGAGCAGATTGCGCCAGTGCCGGGCCATTTGCTCGATGGTCTGGCGGTCGTACAGTTCGGTGGCGAAGGTAAAAGCTGCCGTCATGCCGTCAGCGTGCTCGGCGGTATCCAGCGCCAG‑GTCGAACTGGGTGCTGTGCACCTGCCAGTCGACGGCCTCGATCTGCAGCCCCGGCACTTCCCGTGGCGCGCCTTTGGCCTCGGCCTGGTGGTTGAACATCACCTGGAACAGCGGGTTTTG > NC_002947/4774661‑4774949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |