| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,319,173 | C→A | 7.9% | K67N (AAG→AAT) ‡ | ilvI ← | acetohydroxybutanoate synthase/acetolactate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,319,173 | 0 | C | A | 7.9% | 238.6 / 7.5 | 76 | K67N (AAG→AAT) ‡ | ilvI | acetohydroxybutanoate synthase/acetolactate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/33); new base A (3/3); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 | |||||||||||
TTTCCTGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAG‑AGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGC > NC_002947/5319028‑5319314 | tttCCTGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTg > 1:27270/1‑149 (MQ=255) tGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGGGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGt > 5:100536/1‑149 (MQ=255) tGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGt > 5:68561/1‑149 (MQ=255) tGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGt > 3:266529/1‑149 (MQ=255) gAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGt < 3:237859/147‑1 (MQ=255) gAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTg < 6:68561/148‑1 (MQ=255) aGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGgcg > 3:109134/1‑149 (MQ=255) tGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAg < 2:27270/149‑1 (MQ=255) ctcccACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAg < 7:18749/147‑1 (MQ=255) 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accaTGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTc > 1:64954/1‑149 (MQ=255) ccaTGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTcc > 8:156528/1‑149 (MQ=255) caTGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCAAGGCCGGTgtg > 3:312060/1‑130 (MQ=255) caTGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCAAGGCCGGTgtg < 4:312060/132‑3 (MQ=255) actgttcaaagaaccggaagtggaacacatcctggttcgtcacgagcaggcggccacccatatggcggacggctacgcTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGa < 4:214000‑M1/53‑1 (MQ=255) actgttcaaagaaccggaagtggaacacatcctggttcgtcacgagcaggcggccacccatatggcggacggctacgcTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGa > 3:214000‑M1/79‑131 (MQ=255) 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cggaagtggaacacatcctggttcgtcacgagcaggcggccacccatatggcggacggctacgcTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCg < 1:272673‑M1/56‑1 (MQ=255) cggaagtggaacacatcctggttcgtcacgagcaggcggccacccatatggcggacggctacgcTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCg > 2:272673‑M1/65‑120 (MQ=255) ggATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGa < 4:342753/149‑1 (MQ=255) gaagACCATCGGAATCGAGTCCATCTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACAGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGAc > 2:93673/4‑149 (MQ=255) gATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGt < 5:4723/132‑1 (MQ=255) gATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGt > 6:4723/1‑132 (MQ=255) gATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGa < 8:142831/148‑1 (MQ=255) gATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGAc > 5:287301/1‑149 (MQ=255) gATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGAc > 6:256383/1‑149 (MQ=255) cATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAAc > 7:289140/1‑147 (MQ=255) tCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAg > 4:124227/1‑148 (MQ=255) cGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGa > 3:162411/1‑149 (MQ=255) ggAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGAt < 3:124227/149‑1 (MQ=255) ggAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGAt < 3:254638/149‑1 (MQ=255) gAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGAtg > 3:162162/1‑149 (MQ=255) tCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATgtgt < 4:162411/149‑1 (MQ=255) tGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTcc > 7:168889/1‑149 (MQ=255) gTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGa < 5:300557/85‑1 (MQ=255) gTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGa > 6:300557/1‑85 (MQ=255) gTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCg > 5:311270/1‑149 (MQ=255) tAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCgg < 2:128783/149‑1 (MQ=255) gCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGaa < 1:77440/149‑1 (MQ=255) gCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGa < 6:287301/148‑1 (MQ=255) aaTACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGaa > 2:83090/1‑147 (MQ=255) ccGGTAATGGGATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGc < 8:168889/149‑1 (MQ=255) tAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTCGGTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGcgtc < 1:83090/149‑1 (MQ=255) tAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCttt > 3:293177/1‑136 (MQ=255) tAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCttt < 4:293177/136‑1 (MQ=255) tAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGcgtcg > 1:258676/1‑149 (MQ=255) ggTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGc < 6:311270/148‑1 (MQ=255) gTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCa < 1:93673/148‑1 (MQ=255) GCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCa < 5:279497‑M1/145‑1 (MQ=255) GCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCa > 6:279497‑M1/1‑145 (MQ=255) CGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGgag‑a > 8:289140‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGgag‑a > 5:256383‑M1/1‑149 (MQ=255) CCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAG‑AGc > 7:269705‑M1/1‑149 (MQ=255) gACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACa < 4:199202/120‑1 (MQ=255) gACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACa > 3:199202/1‑120 (MQ=255) ggTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCttt > 2:139509/1‑108 (MQ=255) ggTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCttt < 1:139509/108‑1 (MQ=255) gTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACACGCAGGAG‑AGCACCACCAGGGTa > 6:115343/1‑149 (MQ=255) cAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGtt > 7:265497/1‑98 (MQ=255) cAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGtt < 8:265497/98‑1 (MQ=255) cAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGcgtcg > 7:169220/1‑115 (MQ=255) cAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGcgtcg < 8:169220/115‑1 (MQ=255) accacACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAG‑AGCACCACCAGGGTACCCGTAGAt < 7:156528/149‑1 (MQ=255) cacCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAG‑AGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGc > 2:191727/1‑149 (MQ=255) cacCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACACGCAGGAG‑AGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGc < 5:115343/149‑1 (MQ=255) acCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAGAAGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGc < 1:191727/149‑1 (MQ=255) | TTTCCTGGAAGGCATCGGTGCCCACCATGGTGCTAGGCACCTGGCCGGACAGGATGACCATCGGAATCGAGTCCATGTAGGCGGTGGCAATACCGGTAATGGCATTGGTCGCGCCAGGACCGGAGGTTACCAGCACCACACCGGCCTTGCCGGTGGCGCGAGCGTAGCCGTCCGCCATATGGGTGGCCGCCTGCTC‑GTGACGAACCAGGATGTGTTCCACTTCCGGTTCTTTGAACAGTGCGTCGTAAACATGCAGGAG‑AGCACCACCAGGGTACCCGTAGATGTGC > NC_002947/5319028‑5319314 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |