| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,574,791 | A→G | 8.0% | F168S (TTC→TCC) ‡ | motB ← | flagellar motor rotation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,574,791 | 0 | A | G | 8.0% | 208.1 / 7.6 | 75 | F168S (TTC→TCC) ‡ | motB | flagellar motor rotation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/32); new base G (2/4); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.93e-01 | |||||||||||
CCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTCCAGACGCTCGC > NC_002947/5574650‑5574938 | ccGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACAtcg < 3:132156/148‑1 (MQ=255) cGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACAtcggt > 5:147821/1‑149 (MQ=255) gTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTTCGACAtcggta < 5:301077/149‑2 (MQ=255) gTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTTCGACAtcggta < 7:242584/149‑2 (MQ=255) cGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTTCGACAtcggtagcgc < 7:321857/148‑6 (MQ=255) gCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTAGGTtct > 7:245493/1‑149 (MQ=255) ccGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCAt < 2:128652/148‑1 (MQ=255) cGGCATTCGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTTATGCTGACCTTGTTCGTCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATcc < 8:245493/149‑1 (MQ=255) cGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATc > 4:66887/1‑148 (MQ=255) ggCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTg > 8:103940/1‑149 (MQ=255) gCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACg > 2:3112/1‑149 (MQ=255) aTCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCAt > 7:195991/1‑135 (MQ=255) aTCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCAt < 8:195991/135‑1 (MQ=255) ggTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGc < 6:147821/149‑1 (MQ=255) cGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa < 1:313973/149‑1 (MQ=255) cGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa < 1:3112/149‑1 (MQ=255) tGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGAtc < 7:103940/149‑1 (MQ=255) tGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGAtctc > 4:319498/1‑148 (MQ=255) gACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCg > 7:208592/1‑148 (MQ=255) gACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCg > 6:193644/1‑148 (MQ=255) ttGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAg > 7:167791/1‑149 (MQ=255) gCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTgg < 3:66887/149‑1 (MQ=255) gCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTgg > 7:1235/1‑149 (MQ=255) cGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGaa > 6:332871/1‑135 (MQ=255) ccTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCtt > 5:207734/1‑148 (MQ=255) gATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACt > 1:325589/1‑149 (MQ=255) aTGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGAtc < 5:175202/123‑1 (MQ=255) aTGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGAtc > 6:175202/1‑123 (MQ=255) tGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCt < 5:60475/135‑1 (MQ=255) tGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCt > 6:60475/1‑135 (MQ=255) gtCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa > 8:81454/1‑112 (MQ=255) gtCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa < 7:81454/112‑1 (MQ=255) tCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGTCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCtt < 2:81771/137‑1 (MQ=255) tCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGTCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCtt < 2:76862/137‑1 (MQ=255) tCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGTCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCtt > 1:81771/1‑137 (MQ=255) tCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGTCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCtt > 1:76862/1‑137 (MQ=255) tCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCa < 8:208592/148‑1 (MQ=255) ccATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGc > 5:259053/1‑149 (MQ=255) ccATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGc < 2:325589/149‑1 (MQ=255) ccATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGc > 2:168546/1‑149 (MQ=255) aTGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACa < 4:246034/118‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACa > 3:246034/1‑118 (MQ=255) tGGCCAGTAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa < 7:296338/104‑1 (MQ=255) tGGCCAGTAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGa > 8:296338/1‑104 (MQ=255) gATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATGCGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCa > 5:48370/1‑149 (MQ=255) gATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCa < 8:1235/149‑1 (MQ=255) ttCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCgg < 1:189963/56‑1 (MQ=255) ttCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCgg > 2:189963/1‑56 (MQ=255) ttCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGtt < 3:82960/135‑1 (MQ=255) ttCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGtt > 4:82960/1‑135 (MQ=255) ttCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTAACGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGt > 2:248974/1‑149 (MQ=255) tCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGtt > 8:9670/1‑149 (MQ=255) cGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGtt < 6:259053/148‑1 (MQ=255) gAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTc < 1:168546/148‑1 (MQ=255) gAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTc < 7:9670/148‑1 (MQ=255) aaGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTg < 8:167791/149‑1 (MQ=255) gTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCa < 5:193644/149‑1 (MQ=255) aGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGt > 6:70374/1‑149 (MQ=255) gggCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGt > 4:251779/1‑148 (MQ=255) ggCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCTGTTc < 1:248974/149‑1 (MQ=255) gCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCggg > 1:65632/1‑122 (MQ=255) gCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCggg < 2:65632/122‑1 (MQ=255) cAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTgca < 5:70374/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTgc < 3:251779/148‑1 (MQ=255) ggCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTgcag > 5:86074/1‑148 (MQ=255) gcgcgcTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAAc < 6:207734/149‑1 (MQ=255) gcgcTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGc < 3:26875/102‑1 (MQ=255) gcgcTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGc > 4:26875/1‑102 (MQ=255) gcTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCt > 2:317210/1‑149 (MQ=255) gcTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCt > 6:192702/1‑149 (MQ=255) cgaCCGATGTTCGACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTc > 3:330779/3‑149 (MQ=255) tACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTc > 6:45260/1‑148 (MQ=255) gaCCGATGTTCGACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTgca > 5:72800/2‑138 (MQ=255) gaCCGATGTTCGACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTgca < 6:72800/137‑1 (MQ=255) gAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTACTGCAGCAACAGCTCCAGAcgctcgc > 7:252578/1‑149 (MQ=255) | CCGTATTCGCCAGTGCCGGCATACGGCTTGGCATCGGTATGGCCGCTGATGCTGACCTTGTTCGGCACCGCCTTGATGGTGTCAGCCATGGCCAGCAGGATATCTTCGAAGTAGGGCTGCAGGCGCGCGCTACCGATGTCGAACATCGGTCGGTTCTCGGCATCCATGATCTGGATACGCAGGCCGTCCTGAGTGATCTCGAACAGGATCTGGTCCTTGAACTTCTGCAGCTGCGGGTTCTCTTCCACCTTGTTCTGCAGTTCCTGCAGCAACAGCTCCAGACGCTCGC > NC_002947/5574650‑5574938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |