| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,600,141 | G→A | 6.0% | A1114V (GCC→GTC) | PP_4924 ← | subtilase family serine protease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,600,141 | 0 | G | A | 6.0% | 197.9 / 2.1 | 66 | A1114V (GCC→GTC) | PP_4924 | subtilase family serine protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/34); new base A (2/2); total (30/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
TCCGCTTCAAGGCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGAATGCCAGCGCCAGAGCAGTAT > NC_002947/5599997‑5600288 | tCCGCTTCAAGGCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAAtggcgtg > 3:328827/1‑149 (MQ=255)tCCGCTTCAAGGCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAAtggcgtg > 5:213954/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCAAGGCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAAtggcgtgg < 4:261255/149‑1 (MQ=255) gCTTCAAGGCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAAtggcgtggcg < 8:86210/149‑1 (MQ=255) cAAGGCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGgtt < 7:216170/148‑1 (MQ=255) aaGGCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAATGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGgttg < 1:135726/148‑1 (MQ=255) ggCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGgttgttg < 4:328827/149‑1 (MQ=255) aCGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAAtggcgtggc < 7:318992/136‑1 (MQ=255) aCGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAAtggcgtggc > 8:318992/1‑136 (MQ=255) cGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTc < 4:118677/149‑1 (MQ=255) gCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCa < 2:140777/149‑1 (MQ=255) aCTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCTACCAGCAACGGTGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCg < 1:290017/149‑1 (MQ=255) cTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGa < 6:310297/149‑1 (MQ=255) tGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAg > 3:141078/1‑149 (MQ=255) gATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGcc > 5:352251/1‑149 (MQ=255) gATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGcc > 5:111728/1‑149 (MQ=255) aaaCATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCtgt < 6:134494/149‑1 (MQ=255) aaCATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCtgtg > 2:795/1‑149 (MQ=255) aaCATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCtgtg < 3:20482/149‑1 (MQ=255) aaCATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCtgtg > 1:10101/1‑149 (MQ=255) aCATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGc < 1:249862/149‑1 (MQ=255) cATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCa < 6:352251/149‑1 (MQ=255) aTGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCAt > 7:280421/1‑149 (MQ=255) ggCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTACAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTa > 2:310344/1‑149 (MQ=255) cGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGt > 4:90271/1‑123 (MQ=255) cGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGt < 3:90271/123‑1 (MQ=255) cAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATgg < 2:10101/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTg < 4:141078/149‑1 (MQ=255) aGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTGGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGtt < 8:325480/149‑1 (MQ=255) gCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGc < 6:125268/113‑1 (MQ=255) gCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGc > 5:125268/1‑113 (MQ=255) cAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGc < 6:111728/149‑1 (MQ=255) gCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGccac > 7:259991/1‑149 (MQ=255) tGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGcga > 1:446/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCcca > 6:35546/1‑149 (MQ=255) aGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGtt > 4:165503/1‑149 (MQ=255) gTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATg > 3:42185/1‑94 (MQ=255) gTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATg < 4:42185/94‑1 (MQ=255) gTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTtg < 2:446/149‑1 (MQ=255) aCCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTtgg < 8:280421/148‑1 (MQ=255) gagaGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGTTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTggc > 6:200490/1‑149 (MQ=255) gTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGtt > 1:7359/1‑93 (MQ=255) gTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGtt < 2:7359/93‑1 (MQ=255) gTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCaa < 3:165503/149‑1 (MQ=255) tCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAg > 4:338892/1‑122 (MQ=255) ccTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTa < 6:213954/149‑1 (MQ=255) ccTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTT‑TTGTTGGTAAGGGGGCCCGGTGCATTTCCGGCTTTATGGCGCTGGTTGCCAACAGAGGCGTCGACGAAGGTTCCAAGCCCCCC‑CCGGCCGGTGGTTGCGGGAAGCGttt > 8:114667/1‑147 (MQ=255) cTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGAt > 1:11526/1‑108 (MQ=255) cTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGAt < 2:11526/108‑1 (MQ=255) tttGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGcc < 3:282428/71‑1 (MQ=255) tttGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGcc > 4:282428/1‑71 (MQ=255) tGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGt < 6:43168/147‑1 (MQ=255) gTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGTTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGa < 7:98218/149‑1 (MQ=255) gTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCaa > 3:212811/1‑137 (MQ=255) gTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCaa < 4:212811/137‑1 (MQ=255) gTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTg > 1:302548/1‑148 (MQ=255) gTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTg > 8:235660/1‑148 (MQ=255) gTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGa < 7:103135/149‑1 (MQ=255) ttGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACCAACGGCCG‑tggtgggcta < 4:96604/134‑5 (MQ=255) ttGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACCAACGGCCG‑tggtgggcta > 3:96604/1‑130 (MQ=255) ttGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGaa < 5:143997/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGATGGTGGCGCCaa > 6:169940/1‑132 (MQ=255) accgccACGCCATTGAAGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTtggtg < 7:68225/122‑1 (MQ=255) accgccACGCCATTGAAGTGGAGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGACCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTtggtg > 8:68225/2‑123 (MQ=255) ccgccACTCCATTGAAGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGaa < 5:200402/142‑1 (MQ=255) ccgccACGACATTGAAGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGAGCTGGTTGCCACCAGAGTCGACGACGATGGTGCCTAGACCACC‑ACGGCCGTTTGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTTAAtagatcg > 6:200402/1‑143 (MQ=255) ttCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTa > 7:105109/1‑95 (MQ=255) ttCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTa < 8:105109/95‑1 (MQ=255) ttCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGaa < 6:276849/135‑1 (MQ=255) ttCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGaa > 5:276849/1‑135 (MQ=255) ttCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGAATGCCAGCGCCagag > 2:317843/1‑149 (MQ=255) aaTGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGAATGCCAGCGCCAGAGCa < 7:235660/148‑1 (MQ=255) gcgtggcgGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGAATGCCAGCGCCAGAGCAGTAt < 1:310344/148‑1 (MQ=255) | TCCGCTTCAAGGCTGACGCCACTGGATAAAACATGGCTCCCCGGTGCAGCGACCAGCAAGCTGGAGCCTGGATTGGAAAAGGGTGCCGTGGCAGCTTGCAGTACCGAGAGGTCTGCCTTTGCGTTGATGGCCGCCACTTCAATGGCGTGGCGGTTGTTGTTGGTCAGCGAGCCCTGTGCATTACCGCCTTTATGGCGCTGGTTGCCACCAGAGGCGACGACGATGGTGCCTAGCCCACC‑ACGGCCGTTGGTGGCGGCAAGCGTAGTGCTGAATGCCAGCGCCAGAGCAGTAT > NC_002947/5599997‑5600288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |