Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,683,855 | T→A | 5.8% | D1013V (GAC→GTC) | PP_4988 ← | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,683,855 | 0 | T | A | 5.8% | 257.0 / 2.7 | 82 | D1013V (GAC→GTC) | PP_4988 | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/39); new base A (2/3); total (40/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
CGGATGATCGAGTGCTCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGGCGCACTTGGCGG > NC_002947/5683708‑5684003 | cGGATGATCGAGTGCTCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCActgtc > 7:175552/1‑149 (MQ=255) tCGAGTGCTCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGt < 8:241982/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCgg > 4:61304/1‑149 (MQ=255) cTCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCCGCACTGACAGACAGttccgcg < 7:86164/148‑7 (MQ=255) tCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCCCGGACAGACAGTGCCGcgag > 3:52675/1‑146 (MQ=255) tCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCAct > 8:9355/1‑149 (MQ=255) tCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCAct > 8:244577/1‑149 (MQ=255) tCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGACAGACAGTGCCGc < 4:52675/146‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCActgctg > 7:163321/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGaa < 8:332505/148‑1 (MQ=255) ccAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGa < 8:175552/147‑1 (MQ=255) ccAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAg > 3:241835/1‑149 (MQ=255) aGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGtt > 4:284414/1‑149 (MQ=255) gTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGTActgt < 6:201369/122‑1 (MQ=255) gTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGTActgt > 5:201369/1‑122 (MQ=255) gTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCActgtct < 4:88111/124‑1 (MQ=255) gTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCActgtct > 3:88111/1‑124 (MQ=255) gTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGc < 8:163321/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATg > 7:14003/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATg > 5:236373/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATg < 4:241835/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATg > 5:231461/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGt < 3:61304/149‑1 (MQ=255) aGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCActgtct < 5:276595/117‑1 (MQ=255) aGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCActgtct > 6:276595/1‑117 (MQ=255) aGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTa < 7:164811/149‑1 (MQ=255) gcagcTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCAct > 3:316286/1‑121 (MQ=255) gcagcTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCAct < 4:316286/121‑1 (MQ=255) gcagcTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAgc < 7:244577/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCt < 6:231461/149‑1 (MQ=255) cGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTg > 3:251141/1‑147 (MQ=255) cGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTg > 2:60038/1‑147 (MQ=255) gCGTCGACCTTGACCATGTAACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCACCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGGAGTGCTGATGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGc > 7:230528/1‑149 (MQ=255) gACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAgcg < 2:310852/137‑1 (MQ=255) gACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAgcg > 1:310852/1‑137 (MQ=255) gACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCAt > 6:139134/1‑149 (MQ=255) gACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCAt > 7:137659/1‑149 (MQ=255) gACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCAt < 8:137659/149‑1 (MQ=255) aCCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAAt < 6:147940/122‑1 (MQ=255) aCCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGACATg < 4:251141/149‑1 (MQ=255) ccTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATg > 3:128331/1‑148 (MQ=255) ccTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATg > 1:254798/1‑148 (MQ=255) cTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATg > 5:227163/1‑147 (MQ=255) cTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCCGCACTGACAGACAGTGCCGcgg < 2:242165/104‑3 (MQ=255) cTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCCGCACTGACAGACAGTGCCGcgg > 1:242165/1‑102 (MQ=255) ttGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAg > 4:242420/1‑149 (MQ=255) gACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCg > 3:32365/1‑149 (MQ=255) ccATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGc > 7:153639/1‑149 (MQ=255) aCCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATg < 2:144664/135‑1 (MQ=255) aCCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATg > 1:144664/1‑135 (MQ=255) aCCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGccc > 3:183194/1‑147 (MQ=255) aCCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGccc > 6:93270/1‑147 (MQ=255) ccGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGccc > 8:184821/1‑145 (MQ=255) ccGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGccc < 7:184821/145‑1 (MQ=255) cccGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGcact < 2:254798/149‑2 (MQ=255) cccGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGcaca < 3:242420/149‑1 (MQ=255) cccGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGcaca < 4:128331/149‑1 (MQ=255) ccGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTAGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAg > 8:50356/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCaa < 6:236373/147‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCaa < 3:284414/147‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAg > 5:193752/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGc < 6:193752/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGc < 1:60038/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGc < 4:183194/149‑1 (MQ=255) gctgctGCCGGTATTTCTGCTGTGGCAGCTTCTGGCGGTCCCTGGCCAGCGGAACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCat < 8:67320/149‑1 (MQ=255) gctgctGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCat < 5:139134/149‑1 (MQ=255) ctgcCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑Tg < 8:14003/148‑1 (MQ=255) ccGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGcc < 8:153639/149‑1 (MQ=255) gTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGc > 2:325918/1‑149 (MQ=255) tttCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCgg < 7:9355/149‑1 (MQ=255) tttCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCgg < 5:89011/149‑1 (MQ=255) ggCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTgg < 6:5309/145‑1 (MQ=255) ggCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTgg > 5:5309/1‑145 (MQ=255) tGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTgcag > 4:33907/1‑147 (MQ=255) gcggcCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTgcagca < 6:227163/147‑1 (MQ=255) ccccTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCg > 2:91697/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTTGTGGCAGTTCTGCAGCAGt > 2:128411/1‑143 (MQ=255) ccTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTTGTGGCAGTTCTGCAGCAGt < 1:128411/143‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGaa > 7:3117/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGaa < 7:66448/148‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGaa > 8:66448/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAAc < 5:93270/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTg < 3:33907/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGAGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGgc < 8:230528/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGc > 3:69421/1‑67 (MQ=255) ccGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGc < 4:69421/67‑1 (MQ=255) ccGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGgc > 7:315776/1‑149 (MQ=255) cACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGGCGCACtt < 8:315776/149‑1 (MQ=255) aCTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGGCGCACTTg > 1:201905/1‑149 (MQ=255) tgtctgtcAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGGCGCACTTggc > 4:127629/1‑149 (MQ=255) tctgtcAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGGCGCACTTggcgg > 6:115300/1‑149 (MQ=255) tctgtcAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGGCGCTCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATACTGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGGCGCACTTgg < 1:91697/147‑1 (MQ=255) | CGGATGATCGAGTGCTCGCCTGCCAGGTTACCCAGGTCGTCGAGCAGCTCGGCGTCGACCTTGACCATGTCACCCGGTGCCCGCTCTGGCGCTGCTGCCGGTATTTCGGCGGTGGCAGCTTCTGGCGGCCCCTGGCCCGCGGCACTGTCTGTCAGTGCGGCACTGCTGAAGTTGCGAATGTAGTCGATCAGCGCTGTAGCGGCATGCAGCGGCTGCCCCAGACGCACAGCGTCAAGCATA‑TGCGCCAGCCGGTCGTGGCAGTTCTGCAGCAGTGCGAACAGTGGCGCACTTGGCGG > NC_002947/5683708‑5684003 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |