| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,732,472 | G→C | 5.7% | T28T (ACC→ACG) | hutI ← | imidazolonepropionase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,732,472 | 0 | G | C | 5.7% | 219.4 / 3.7 | 70 | T28T (ACC→ACG) | hutI | imidazolonepropionase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/28); new base C (2/2); total (40/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.41e-01 | |||||||||||
CTGCGGTTGCCGCCGAACACCGCATGGGTGTGGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCGGCTGGCCCTGCCCTGCG > NC_002947/5732329‑5732619 | cTGCGGTTGCCGCCGAACACCGCATGGGTGTGGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGAc < 2:344411/149‑1 (MQ=255) ttGCCGCCGAACACCGCATGGGTGTGGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATcgc > 6:12823/1‑149 (MQ=255) acCGCATGGGTGTGGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGAGCGGGCCTATCCACACGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGAt > 2:303570/1‑149 (MQ=255) gggTGTGGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAg > 4:118478/1‑149 (MQ=255) ggTGTGGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAg < 3:118478/148‑1 (MQ=255) gtgGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGc < 4:141649/149‑1 (MQ=255) gtgGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCAATCGATAAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGc > 1:280252/1‑149 (MQ=255) tgGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGcc < 6:118105/141‑1 (MQ=255) tgGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGcc > 5:118105/1‑141 (MQ=255) gTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGt > 6:158782/1‑111 (MQ=255) gTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGt < 5:158782/111‑1 (MQ=255) gCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATg > 6:6456/1‑149 (MQ=255) gggAATGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTg > 1:291604/1‑149 (MQ=255) tGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑Ca < 5:6456/149‑1 (MQ=255) tGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑Ca < 5:44854/149‑1 (MQ=255) aCCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATg < 1:113128/149‑1 (MQ=255) ccAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATgg > 7:176642/1‑148 (MQ=255) cAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGc > 6:189417/1‑148 (MQ=255) accaccCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAAtgct < 8:176642/149‑1 (MQ=255) cccAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAAtgctgc > 2:94594/1‑147 (MQ=255) ccAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAAtgctgc > 1:285013/1‑146 (MQ=255) ccAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAAtgctgc > 8:226771/1‑146 (MQ=255) cAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCaga < 1:94594/149‑1 (MQ=255) cAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCaga < 5:12823/149‑1 (MQ=255) aaCCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTtc > 4:29775/1‑149 (MQ=255) aaCCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCAT‑GTTGCAACCATGGccgatg < 3:282121/136‑6 (MQ=255) ccGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTtctc < 1:303570/149‑1 (MQ=255) ccGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTtctc < 2:285013/149‑1 (MQ=255) gTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCAt < 2:291604/149‑1 (MQ=255) tGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTg > 1:57911/1‑65 (MQ=255) tGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTg < 2:57911/65‑1 (MQ=255) ggTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAAtgctgc < 6:188351/131‑1 (MQ=255) ggTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAAtgctgc > 5:188351/1‑131 (MQ=255) aGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAAt < 5:189417/148‑1 (MQ=255) ttCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTcc > 7:321928/1‑149 (MQ=255) cGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCTGCCATCGGCCATGGTTGCaa < 8:194525/108‑1 (MQ=255) cGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCtt > 8:108801/1‑149 (MQ=255) cGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCAGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCaa > 7:194525/1‑108 (MQ=255) gACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCtt < 7:108801/148‑1 (MQ=255) cGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGc > 3:100898/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGc > 1:330911/1‑149 (MQ=255) gggCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGc > 2:91602/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAg > 3:50091/1‑149 (MQ=255) tcAGCTGGGCGCGGGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCGGGTGTCGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCgg < 8:321928/148‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGc < 3:29775/149‑1 (MQ=255) cGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCttt > 6:217550/1‑135 (MQ=255) cGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCttt < 5:217550/135‑1 (MQ=255) ggCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCt > 2:291885/1‑149 (MQ=255) gcgcgcGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGCTGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGAGGTGCAGCTc > 5:246890/1‑149 (MQ=255) cTATCCACTCGATCAGCCCGGCTCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCTTGCACAATCTCCTTTTCTAGCGGAGCAGCAGGGACGGCTcc > 8:310416/1‑149 (MQ=255) cTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTcc < 6:102713/120‑1 (MQ=255) cTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTcc > 5:102713/1‑120 (MQ=255) tATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCg > 3:46867/1‑149 (MQ=255) tCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTcggcc < 5:82542/140‑1 (MQ=255) tCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTcggcc > 6:82542/1‑140 (MQ=255) tCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCg < 1:91602/147‑1 (MQ=255) tCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGc > 2:165498/1‑148 (MQ=255) aCTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTAcc > 6:362142/1‑149 (MQ=255) aCTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCAGGCTCCGCTa > 8:194018/1‑147 (MQ=255) cTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCAGCATCCTCGATGGCCCAGTAGCCGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGGCATAGGGTTCTAATGCACAATCTACTTTGCTAGCGGAGCAGCTCGGCACGCTCAGCTACCg > 1:204076/1‑149 (MQ=255) tCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGt < 8:93422/124‑1 (MQ=255) tCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGt > 7:93422/1‑124 (MQ=255) aTCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTCCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCGGCTg < 7:226771/149‑1 (MQ=255) ggatgcGGCGATCGTCACCAGCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCgg < 7:176405/139‑1 (MQ=255) ggatgcGGCGATCGTCACCAGCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCgg > 8:176405/6‑144 (MQ=255) caacccGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCGGCTGgc > 2:107911/4‑149 (MQ=255) cccGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGtt > 2:193560/1‑61 (MQ=255) cccGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGAAGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGtt < 1:193560/61‑1 (MQ=255) gcGGCGATCGTCACCAGCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCGGCTgg < 4:180762/143‑1 (MQ=255) gcGGCGATCGTCACCAGCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCGGCTgg > 3:180762/2‑144 (MQ=255) cGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCGGCTGgccctgc > 5:274460/1‑149 (MQ=255) tGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCGGCTGGCCCTGCCCTgcg > 3:121378/1‑149 (MQ=255) | CTGCGGTTGCCGCCGAACACCGCATGGGTGTGGCAGTCGATCAGCCCGGGAGTGACCCAGGCACCACCCAGGTCAACCGTGCGGTCAGCTTCGACGGGCGCCAGCTCGGCGCGCGGGCCTATCCACTCGATCAGCCCGGCGCTGGTGACGATCGCCGCATCCTCGATGGCCGAGTAGCGGCCATCGGCCATGGTTGCAA‑CATGGCAATGCTGCCAGAGGGTTCTCATGCACAATCTCCTTTGCTAGCGGTGCAGCTCGGCCGGCTCCGCTACCGGCTGGCCCTGCCCTGCG > NC_002947/5732329‑5732619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |