Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,790,620 | A→T | 7.1% | intergenic (‑24/+33) | PP_5073 ← / ← hemE | hypothetical protein/uroporphyrinogen decarboxylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,790,620 | 0 | A | T | 7.1% | 239.6 / 5.5 | 81 | intergenic (‑24/+33) | PP_5073/hemE | hypothetical protein/uroporphyrinogen decarboxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/35); new base T (4/2); total (44/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
CAAATGCGCCAGTGCTGAACAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGC > NC_002947/5790479‑5790765 | cAAATGCGCCAGTGCTGAACAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGc > 5:88475/1‑149 (MQ=255) aaTGCGCCAGTGCTGAACAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCg < 6:88475/149‑1 (MQ=255) cgcCAGTGCTGAACAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGtt < 3:113407/149‑1 (MQ=255) gcCAGTGCTGAACAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGtt > 5:253731/1‑148 (MQ=255) ccAGTGCTGAACAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTa < 8:60110/149‑1 (MQ=255) cAGTGCTGAACAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTAc > 2:336812/1‑149 (MQ=255) cAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACTGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTgtgcagtgc < 7:331013/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAg > 3:8224/1‑149 (MQ=255) gCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGt > 5:39744/1‑149 (MQ=255) aTGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCa > 6:167338/1‑110 (MQ=255) tGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACtggt < 1:336812/149‑1 (MQ=255) tGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGACGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACtggt > 8:208845/1‑149 (MQ=255) aGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGTTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCTGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACtggtgg < 4:25817/149‑1 (MQ=255) cGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACt > 2:100976/1‑149 (MQ=255) agaTAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTgtgcagtgc > 3:44104/1‑127 (MQ=255) agaTAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTgtgcagtgc < 4:44104/127‑1 (MQ=255) agaTAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTgc < 7:208845/149‑1 (MQ=255) aTAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTgcgc > 3:324127/1‑149 (MQ=255) cGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGATGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAg < 5:232423/127‑1 (MQ=255) cGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTAGATGGGACCAGATTAGCGAGGATCGCTGAATTAAAACTTAACGTACAAAAAACACGGCAACGAAGCCGGGTTTACTCTGAAGTGCATCAAg > 6:232423/1‑127 (MQ=255) ggATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGa > 8:316567/1‑147 (MQ=255) ttCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTc < 6:39744/148‑1 (MQ=255) tCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACtgtg > 4:248244/1‑108 (MQ=255) tCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACtgtg < 3:248244/108‑1 (MQ=255) tCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATc > 4:183149/1‑117 (MQ=255) tCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATc < 3:183149/117‑1 (MQ=255) aTGATATTCGCGTCCTGTTTCGGTTTGGTTGGGGCCACATTAGCGGCGATCGCTGAAGTCAACGGTAACTTACAAAAAAACCGGCATCGAAGCCGGGTTTAGTGTGCAGTGCCTGAAGGCACTGGTGGTCCTGCGC‑‑CGACAGTTCGTg > 6:140333/1‑148 (MQ=255) aTGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAATAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGc < 1:106010/149‑1 (MQ=255) tGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCa < 6:253731/149‑1 (MQ=255) gATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACtggtgg > 7:57812/1‑126 (MQ=255) gATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACtggtgg < 8:57812/126‑1 (MQ=255) aTCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGc < 2:63096/148‑1 (MQ=255) tCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGt < 4:324127/149‑1 (MQ=255) gggTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGtt < 4:8224/148‑1 (MQ=255) tGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAAt > 5:121534/1‑149 (MQ=255) ggtttcgATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCAccc > 5:88192/1‑149 (MQ=255) tttGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGaa < 8:178617/134‑1 (MQ=255) gATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTc > 6:144395/1‑118 (MQ=255) gATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTc < 5:144395/118‑1 (MQ=255) gATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGaa > 7:178617/1‑136 (MQ=255) tGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACtg > 3:283243/1‑95 (MQ=255) tGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACtg < 4:283243/95‑1 (MQ=255) tGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTc < 6:88192/149‑1 (MQ=255) aCCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTAc > 2:208854/1‑98 (MQ=255) aCCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCggg < 6:121534/149‑1 (MQ=255) cAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGa < 8:272892/104‑1 (MQ=255) cAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGa > 7:272892/1‑104 (MQ=255) gCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACTTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTcc > 1:10565/1‑149 (MQ=255) aaTTCAAACTTAACGTACATAATATCCGGCTTCGAAGGCGGGTTTAGTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGGTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGt < 5:140333/149‑1 (MQ=255) aaTTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGcc < 1:100976/147‑1 (MQ=255) ttCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCAccc < 8:295998/113‑1 (MQ=255) ttCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCAccc > 7:295998/1‑113 (MQ=255) ttCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTgg > 1:227334/1‑149 (MQ=255) cAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGc > 7:28678/1‑148 (MQ=255) aaaCTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGt > 4:56102/1‑136 (MQ=255) aaaCTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGt < 3:56102/136‑1 (MQ=255) aaaCTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGcc > 2:349611/1‑148 (MQ=255) aaaCTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGcc > 1:187362/1‑148 (MQ=255) aCTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAg > 5:316717/1‑149 (MQ=255) aaCGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCaa < 5:22953/144‑1 (MQ=255) aaCGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCaa > 6:22953/1‑144 (MQ=255) aCGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGt > 6:61779/1‑129 (MQ=255) aCGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGt < 5:61779/129‑1 (MQ=255) tACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAaca > 4:291103/1‑149 (MQ=255) cAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGCCCAAGGTTGAAcaca > 8:24862/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACAt < 6:316717/149‑1 (MQ=255) aaaaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACAt < 2:10565/149‑1 (MQ=255) aaaaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACAt > 7:59916/1‑149 (MQ=255) taaaCCCGGCTTCGATGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGCTGGGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACAt > 1:274542/2‑149 (MQ=255) aaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGaa < 1:234723/142‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGaa > 2:234723/1‑142 (MQ=255) aaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAac > 1:268248/1‑143 (MQ=255) aaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAac < 2:268248/143‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATgg > 8:257870/1‑149 (MQ=255) aaaaCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTCGAACACATgg > 3:151989/1‑149 (MQ=255) aaaCCCGGCTTCGATGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTtgat < 3:261400/84‑1 (MQ=255) aaaCCCGGCTTCGATGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTtgat > 4:261400/1‑84 (MQ=255) aCCCGGCTTCGATGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGc > 8:194449/1‑147 (MQ=255) aCCCGGCTTCGATGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGc > 3:312211/1‑147 (MQ=255) aCCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGc > 4:303277/1‑147 (MQ=255) ccGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGt < 8:28678/149‑1 (MQ=255) ggCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGc < 8:59916/149‑1 (MQ=255) | CAAATGCGCCAGTGCTGAACAAGGGGGCGAGGATGAGGGCGAGATAACGGATTTTCATGATAATCGGGTCCTGTTTCGGTTTCGATGGGACCAGATTAGCGACGATCGCTGAATTCAAACTTAACGTACAAAAAACCCGGCATCGAAGCCGGGTTTACTGTGCAGTGCATCAAGTCACTGGTGGTACTGCGC‑‑CGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGC > NC_002947/5790479‑5790765 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |