Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,867,228 | G→A | 6.5% | Q160* (CAG→TAG) | thyA ← | thymidylate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,867,228 | 0 | G | A | 6.5% | 181.5 / 2.3 | 61 | Q160* (CAG→TAG) | thyA | thymidylate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/29); new base A (2/2); total (30/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.18e-01 |
AGGGAAATTTCCCTGGTCTCGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTGTAGCCCGGCCACTGGCG > NC_002947/5867080‑5867375 | aGGGAAATTTCCCTGGTCTCGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTg > 8:79641/1‑149 (MQ=255) aGGGAAATTTCCCTGGTCTCGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTg > 4:291999/1‑149 (MQ=255) gggAAATTTCCCTGGTCTCGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGAGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGTATGCGGCTGCTACCAGCGTCGTTGGAGATGGTGTCAATGCACTgg > 8:107146/1‑149 (MQ=255) aTTTCCCTGGTCTCGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTAc < 7:82036/149‑1 (MQ=255) tttCCCTGGTCTCGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTAcc < 7:79641/149‑1 (MQ=255) tctcGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGt < 1:317656/144‑1 (MQ=255) tctcGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGt > 2:317656/1‑144 (MQ=255) tctcGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATc < 7:31316/149‑1 (MQ=255) tcGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGc > 3:289573/1‑149 (MQ=255) gACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGcc < 7:92800/148‑1 (MQ=255) gACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGc < 3:291999/147‑1 (MQ=255) gACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTCCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTg < 7:137099/129‑1 (MQ=255) gACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTCCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTg > 8:137099/1‑129 (MQ=255) gTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGa < 7:107146/149‑1 (MQ=255) gTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGa > 4:115610/1‑149 (MQ=255) ggAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGAt > 6:161799/1‑148 (MQ=255) aCTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACa < 3:41498/141‑1 (MQ=255) aCTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACa > 4:41498/1‑141 (MQ=255) aCAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGt > 1:261440/1‑120 (MQ=255) aCAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGt < 2:261440/120‑1 (MQ=255) aCAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAAcgc > 7:282505/1‑148 (MQ=255) gCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACg > 6:62866/1‑149 (MQ=255) cAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACa > 6:243784/1‑131 (MQ=255) cAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACa < 5:243784/131‑1 (MQ=255) cAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGc > 3:301482/1‑149 (MQ=255) gTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGt < 5:161799/149‑1 (MQ=255) cacGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCctc < 4:289573/149‑1 (MQ=255) ggTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTAcc < 5:270444/102‑1 (MQ=255) ggTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTAcc > 6:270444/1‑102 (MQ=255) ggTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTc < 8:282505/149‑1 (MQ=255) tcAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTAACCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTcc > 5:250998/2‑149 (MQ=255) gTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTcc < 6:340890/137‑1 (MQ=255) gTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTcc > 5:340890/1‑137 (MQ=255) gTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTgg < 3:115610/149‑1 (MQ=255) gCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTggg > 8:252544/1‑148 (MQ=255) ttGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAAc > 5:193670/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATTGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTc > 3:162020/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCTTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTc < 7:250047/147‑1 (MQ=255) ccAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCATTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTc > 8:250047/1‑147 (MQ=255) aGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCg < 7:247860/104‑1 (MQ=255) aGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCg > 8:247860/1‑104 (MQ=255) gCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCa > 3:41968/1‑149 (MQ=255) ggAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTc > 7:66883/1‑148 (MQ=255) gAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGa < 7:252544/149‑1 (MQ=255) aaCAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGAt > 6:322529/1‑149 (MQ=255) aaCAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGAt < 4:162020/149‑1 (MQ=255) aCAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGt < 2:112298/72‑1 (MQ=255) gATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGgccg > 3:324413/1‑149 (MQ=255) ggcggcTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCgg > 4:189149/1‑129 (MQ=255) ggcggcTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCgg < 3:189149/129‑1 (MQ=255) cccGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTAGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAg > 8:221221/1‑149 (MQ=255) cccGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTAGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAg > 8:219340/1‑149 (MQ=255) gTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTAGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGa < 7:219340/149‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTAGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGa < 7:221221/149‑1 (MQ=255) ttGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATTCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATgcg < 6:250998/149‑1 (MQ=255) ggCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATgcgc < 5:62866/148‑1 (MQ=255) gCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCtt > 2:34664/1‑149 (MQ=255) gCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCtt < 4:41968/149‑1 (MQ=255) cGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTg < 5:322529/149‑1 (MQ=255) cGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTg < 4:324413/149‑1 (MQ=255) cGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTg > 3:47980/1‑149 (MQ=255) aGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTGTAGCCCGGCCa > 1:179782/1‑149 (MQ=255) cACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTGTAGCCCGGCCACTg < 8:66883/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTGTAGCCCGGCCACTgg > 8:35347/1‑149 (MQ=255) cTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTGTAGCCCGGCCACTGgc < 4:301482/149‑1 (MQ=255) tGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTGTAGCCCGGCCACTGgcg > 1:299765/1‑149 (MQ=255) | AGGGAAATTTCCCTGGTCTCGACATTCGGGTGGAACTGGTACAGCAAGTGACACGGTGGCAGTGCCATTTCGTCCAGTTGCGCGCAGTTCCAGCCGTGGAACAGGATGCGGCGGCTACCCGGGTCGTTGGCGATGGTGTCCAGGCACTGGCGTACCTGGTCGATCGCCTTGTACAGGATGACGAACGCGACGCCGTCCTCTTCGTCCTGGGCAATGCGGCGGAAACCGGCTTGCTCGGCCATTTCGATGGCCGCCGGGTTGCTCAGCGGGATGCGCTTGTAGCCCGGCCACTGGCG > NC_002947/5867080‑5867375 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |