Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,935,336 | G→C | 7.2% | R119R (CGG→CGC) | fau → | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,935,336 | 0 | G | C | 7.2% | 219.6 / 5.0 | 69 | R119R (CGG→CGC) | fau | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/32); new base C (2/3); total (34/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 |
CCCAGCGTCGCGGCAAGTGCATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTGGAAAAAACCCTTGCTGCTGG > NC_002947/5935188‑5935481 | cccAGCGTCGCGGCAAGTGCATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCgg > 7:140153/1‑149 (MQ=255) cAGCGTCGCGGCAAGTGCATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCggag > 7:174051/1‑147 (MQ=255) cAGCGTCGCGGCAAGTGCATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGcc > 4:156554/1‑149 (MQ=255) cgGCAAGTGCATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTggg > 6:238354/1‑149 (MQ=255) gTGCATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTg > 1:202193/1‑148 (MQ=255) cATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGAt < 3:156554/148‑1 (MQ=255) cATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGAt < 5:87794/148‑1 (MQ=255) aTCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGCCCAGATC‑GGCCGCTggc > 5:256686/1‑145 (MQ=255) aTCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGCCCAGATC‑GGCCGCTggc < 6:256686/146‑2 (MQ=255) aCCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGCCCAGATC‑GGCCGCTggcgt < 1:128662/144‑4 (MQ=255) aCCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGCCCAGATC‑GGCCGCTggcgt > 2:128662/1‑141 (MQ=255) ccTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGa < 5:238354/146‑1 (MQ=255) ccTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGa < 2:83994/146‑1 (MQ=255) ccTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTc > 3:100872/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGCCCAGATC‑GGCCGCTggcgtttg < 2:286426/146‑7 (MQ=255) ctgcATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGa > 3:323801/1‑136 (MQ=255) ctgcATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGa < 4:323801/136‑1 (MQ=255) ctgcATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGc < 3:15615/148‑1 (MQ=255) gcATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGa < 3:140099/134‑1 (MQ=255) gcATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGa > 4:140099/1‑134 (MQ=255) aTGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTc < 8:140153/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGAt > 4:39803/1‑126 (MQ=255) gCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGAt < 3:39803/126‑1 (MQ=255) cTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGt > 2:106356/1‑149 (MQ=255) tGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGtt > 6:70602/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGttt > 6:20542/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGttt < 4:7562/148‑1 (MQ=255) ccGCGCACGCGCATGGTGTTACAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGa < 4:100872/149‑1 (MQ=255) cgcgcacgcgctTGGTGTTCCAGCGTTTTTAGATGGGTGAGACGCTCAAGCCCACCCCTTTACGTTTTCCCCGTTTCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGa < 1:282842/149‑1 (MQ=255) gcacgcgcaTGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGaa < 7:1711/149‑1 (MQ=255) ccAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCt < 4:167635/96‑1 (MQ=255) cAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTgg < 7:242033/118‑1 (MQ=255) cAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTgg > 8:242033/1‑118 (MQ=255) cAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTggg > 1:226432/1‑149 (MQ=255) cAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTggg > 4:65803/1‑149 (MQ=255) aGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGgccgc > 7:43364/1‑143 (MQ=255) aGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGgccgc < 8:43364/143‑1 (MQ=255) gTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATg < 5:20542/149‑1 (MQ=255) ttttGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATgg < 5:70602/149‑1 (MQ=255) aGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGc < 2:226432/149‑1 (MQ=255) agaAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTa < 1:144796/148‑1 (MQ=255) agaAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTa > 2:144796/1‑148 (MQ=255) agaAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGGTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTAt > 7:150575/1‑149 (MQ=255) gaAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTAt > 7:267890/1‑148 (MQ=255) tCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCg > 5:6008/1‑148 (MQ=255) tCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCg > 3:319435/1‑148 (MQ=255) tCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCg > 6:322270/1‑148 (MQ=255) cAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGTTCGCATACGCGAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCtt < 4:115205/132‑1 (MQ=255) cAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCtt > 3:115205/1‑132 (MQ=255) aaCCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAATGTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCt < 1:47702/134‑1 (MQ=255) aaCCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCt > 2:47702/1‑133 (MQ=255) ccGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGTCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATgg > 2:146967/1‑119 (MQ=255) ccGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGTCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATgg < 1:146967/119‑1 (MQ=255) gCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTAc > 3:167450/1‑149 (MQ=255) ccGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTgg > 7:297631/1‑107 (MQ=255) ccGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTgg < 8:297631/107‑1 (MQ=255) tt‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGt < 6:6008/149‑1 (MQ=255) cAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCgg > 3:127179/1‑149 (MQ=255) gatcgCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTGGaaaa > 5:27072/1‑148 (MQ=255) atcgCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGc < 6:47868/118‑1 (MQ=255) atcgCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGc > 5:47868/1‑118 (MQ=255) tcgCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCt > 4:277286/1‑140 (MQ=255) tcgCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCt < 3:277286/140‑1 (MQ=255) aaaCGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTGGAAAAAACCCtt < 4:319435/149‑1 (MQ=255) aaCGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGGTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTTGAAAAAACCCTtg < 8:150575/149‑1 (MQ=255) aCGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCaaa < 3:145550/131‑1 (MQ=255) aCGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCaaa > 4:145550/1‑131 (MQ=255) aCGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTGGAAAAAACCCTtgc > 8:128612/1‑149 (MQ=255) gCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTGGAAAAAACCCTTGCTGCTgg < 3:65803/149‑1 (MQ=255) gCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTGGAAAAAACCCTTGCTGCTgg > 8:145250/1‑149 (MQ=255) gCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTGGAAAAAACCCTTGCTGCTgg < 4:127179/149‑1 (MQ=255) | CCCAGCGTCGCGGCAAGTGCATCTACCTGCCGGTGCTGCATGCCTGGCCGCGCACGCGCATGGTGTTCCAGCGTTTTGAGCAGGGTGAGAAGCTCAAGCCCAACCGCTTCCGTATT‑CCAGAGCCGATTATCGATCGCAAACGCCAGCGGCC‑GATCTGGGCGCTGGATCTGATTCTGCTACCGCTGGTCGGGTTTGACGAA‑GTGGGCGGCCGCCTGGGTATGGGCGGTGGCTTCTATGATCGCAGCCTGGCCTACCAGGCGCGTCGGCAAACCTGGAAAAAACCCTTGCTGCTGG > NC_002947/5935188‑5935481 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |