Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,948,143 | A→C | 76.4% | F111V (TTC→GTC) | rho ← | transcription termination factor Rho |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,948,143 | 0 | A | C | 76.4% | 130.7 / 37.2 | 67 | F111V (TTC→GTC) | rho | transcription termination factor Rho |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (7/9); new base C (25/26); total (32/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.84e-01 |
CCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAAC > NC_002947/5947998‑5948277 | ccGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGCTGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGt > 6:209400/1‑148 (MQ=255) cTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCcctt > 6:324605/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCccttc > 1:342752/1‑149 (MQ=255) cGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTggg < 5:53319/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGt < 5:290727/120‑1 (MQ=255) cGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGt > 6:290727/1‑120 (MQ=255) gCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCtt > 6:307616/1‑149 (MQ=255) ccTCTATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGTACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACTCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTg < 8:318888/149‑1 (MQ=255) ccTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTg > 5:172537/1‑149 (MQ=255) cTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGc < 4:96065/149‑1 (MQ=255) tCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGcc > 7:81566/1‑149 (MQ=255) cATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGc < 7:182888/118‑1 (MQ=255) cATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGc > 8:182888/1‑118 (MQ=255) ttCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAGCAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGAt > 1:254650/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAGCAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATg < 2:254650/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATg < 5:324605/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATg < 6:301664/148‑1 (MQ=255) acgccgctGTTCCCGAACAAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATgg > 1:30490/8‑149 (MQ=255) cgcTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTc > 6:279999/1‑149 (MQ=255) gcTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCg > 6:82662/1‑149 (MQ=255) gcTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCg > 1:320295/1‑149 (MQ=255) cTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGc < 2:320295/149‑1 (MQ=255) gTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGcc > 3:168140/1‑132 (MQ=255) gTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGcc < 4:168140/132‑1 (MQ=255) ttCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCgg < 2:342752/148‑1 (MQ=255) ttCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCgg < 5:279999/148‑1 (MQ=255) ttCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTGCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCgg < 4:271338/148‑1 (MQ=255) cGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTAc > 1:235190/1‑149 (MQ=255) gggAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTAc > 1:283734/1‑148 (MQ=255) caaGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAgg < 2:30490/147‑1 (MQ=255) aGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGtt < 5:82662/149‑1 (MQ=255) cggcgTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTg > 1:67261/1‑148 (MQ=255) cgTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGt > 8:202030/1‑143 (MQ=255) cgTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGt < 7:202030/143‑1 (MQ=255) aGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAAcggcg < 8:81566/149‑1 (MQ=255) gTTTTAGAACAGGATATTGTTCTTCGCTTTTTCCGTGCGGTATAAGTTGATGGTATCGAACTTAAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTAGGTGGGAGGATCTTGCCGACTATGTTGTAGCCGGTACTCAGCGTGaaaagtagga > 8:330747/1‑142 (MQ=255) cAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGAAGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATctggctgg < 5:307616/149‑1 (MQ=255) ggATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGc < 2:67261/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCgag < 2:235190/145‑1 (MQ=255) gTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCga < 5:209400/144‑1 (MQ=255) gTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACa > 5:92665/1‑148 (MQ=255) ttcGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGa > 7:3111/1‑148 (MQ=255) ttcGCGTTGTCCGGGCGGTCGATTTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGGGGTTCTTGCcgacga < 6:266903/94‑1 (MQ=255) gcgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATa > 5:44788/1‑143 (MQ=255) gcgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATa < 6:44788/143‑1 (MQ=255) cgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACa > 1:121964/1‑140 (MQ=255) cgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACa < 2:121964/140‑1 (MQ=255) ttttCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTc < 8:3111/149‑1 (MQ=255) tgccGGGCGGGCGATGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCt < 6:92665/146‑1 (MQ=255) ccGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTTGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTgg < 2:283734/148‑1 (MQ=255) ccGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTgg < 7:330747/148‑1 (MQ=255) gAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCgag > 7:244522/1‑121 (MQ=255) gAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCgag < 8:244522/121‑1 (MQ=255) gAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATCGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGt < 1:318729/149‑1 (MQ=255) gATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAg < 2:318131/141‑1 (MQ=255) gATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAg > 1:318131/1‑141 (MQ=255) aTGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACg > 6:151693/1‑148 (MQ=255) tGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGTGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCa > 2:304087/1‑149 (MQ=255) ggTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATc < 5:56146/123‑1 (MQ=255) ggTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATc > 6:56146/1‑123 (MQ=255) aTCGACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAg > 7:298523/1‑149 (MQ=255) gACCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCg > 4:260953/1‑149 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCgaga > 8:188913/1‑106 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGa < 5:151693/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCAGGGCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGTGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAAc < 1:304087/149‑1 (MQ=255) ggCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGc < 6:294362/135‑1 (MQ=255) ggCGACGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGc > 5:294362/1‑135 (MQ=255) | CCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAAC‑AGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAAC > NC_002947/5947998‑5948277 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |