| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,957,531 | A→T | 8.3% | D312V (GAC→GTC) | cyaA → | adenylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,957,531 | 0 | A | T | 8.3% | 169.3 / 5.9 | 60 | D312V (GAC→GTC) | cyaA | adenylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/25); new base T (2/3); total (32/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.63e-01 | |||||||||||
CTGTGGCAATTGTTCAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGCCATGGCTGG > NC_002947/5957383‑5957679 | cTGTGGCAATTGTTCAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGctcgacctcg‑a > 7:141385/1‑149 (MQ=255) tgGCAATTGTTCAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTcg‑acga < 1:144432/149‑1 (MQ=255) cAATTGTTCAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCt < 8:141385/149‑1 (MQ=255) ttGTTCAAAGGCATCGACTCTCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGa < 8:200449/149‑1 (MQ=255) ttGTTCAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGTCGAGG‑TCGAGCTggt < 6:350618/149‑2 (MQ=255) tCAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGAcccc > 4:35206/1‑149 (MQ=255) cAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGAc < 4:250032/145‑1 (MQ=255) cAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGAc > 3:250032/1‑145 (MQ=255) ggCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGt < 1:208239/149‑1 (MQ=255) aTCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGAt > 5:92547/1‑149 (MQ=255) cTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGgc > 3:257265/1‑149 (MQ=255) tACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGgcg > 1:150552/1‑149 (MQ=255) aaTCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGAt < 5:155823/133‑1 (MQ=255) aaTCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGAt > 6:155823/1‑133 (MQ=255) gctgctCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATg > 6:160140/1‑130 (MQ=255) gctgctCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATg < 5:160140/130‑1 (MQ=255) ctgctCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACg < 4:148614/149‑1 (MQ=255) ctCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGt < 5:28189/147‑1 (MQ=255) tCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGTCGAGG‑TCGAGCTggt < 8:64378/112‑2 (MQ=255) tCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGTCGAGG‑TCGAGCTggt > 7:64378/1‑111 (MQ=255) aaaCTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTcg‑acga > 3:104291/1‑104 (MQ=255) aaaCTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTcg‑acga < 4:104291/104‑1 (MQ=255) aaaCTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTAc < 3:35206/147‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACctgc > 6:20120/1‑149 (MQ=255) ctgctAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTg > 6:10303/1‑102 (MQ=255) ctgctAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTg < 5:10303/102‑1 (MQ=255) ctgctAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCtgctgc < 4:257265/148‑1 (MQ=255) ctgctAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCtgctgc < 2:150552/148‑1 (MQ=255) ctAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTAcc < 7:103274/139‑1 (MQ=255) ctAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTAcc > 8:103274/1‑139 (MQ=255) ctAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAAc < 3:121632/148‑1 (MQ=255) tAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAAcgc > 8:87700/1‑149 (MQ=255) aCCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTAc > 4:347588/1‑105 (MQ=255) cGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACgcggc > 8:60697/1‑148 (MQ=255) cGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACgcggc > 8:117432/1‑148 (MQ=255) cGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACgcggc > 7:309469/1‑148 (MQ=255) cGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACgcggc < 7:117432/148‑1 (MQ=255) aGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGaaa < 7:87700/149‑1 (MQ=255) ccTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAAcc > 3:5949/1‑149 (MQ=255) cTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACcg > 3:72791/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACcgc < 6:92547/147‑1 (MQ=255) gCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGTCGAGG‑TCGAGCTggt > 5:171894/1‑85 (MQ=38) gCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGTCGAGG‑TCGAGCTggt < 6:171894/86‑2 (MQ=38) gAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTg > 2:113686/1‑147 (MQ=255) gAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTg > 6:102107/1‑147 (MQ=255) acCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTg > 3:47982/1‑149 (MQ=255) cccTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTgg < 7:60697/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTgg > 2:293553/1‑148 (MQ=255) gCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGt > 4:230915/1‑146 (MQ=255) tGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACg > 7:230171/1‑148 (MQ=255) gcTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCGAACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAg > 1:96856/1‑149 (MQ=255) gcTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGc < 5:20120/149‑1 (MQ=255) cAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAAc > 2:271006/1‑148 (MQ=255) cAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAAc < 4:5949/148‑1 (MQ=255) aGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAAc > 7:93748/1‑146 (MQ=255) gcaggcagTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGaa > 2:84156/1‑138 (MQ=255) gcaggcagTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGaa < 1:84156/138‑1 (MQ=255) aggcagTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACaagaag < 1:271006/149‑1 (MQ=255) aggcagTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACaagaag < 8:309469/149‑1 (MQ=255) aggcagTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGAAGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCTGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTCGTAAGACGCACCCTCTACCTGAAGGTGAACaag > 3:183031/1‑146 (MQ=255) agTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCa < 4:72791/149‑1 (MQ=255) gCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGAc > 6:111299/1‑147 (MQ=255) ccAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCa < 3:230915/148‑1 (MQ=255) gCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCa > 6:264578/1‑149 (MQ=255) ctcgacctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAg < 8:230171/149‑1 (MQ=255) tcgacctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGa < 1:251531/136‑1 (MQ=255) tcgacctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGa > 2:251531/1‑136 (MQ=255) cgacctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGc > 6:12007/1‑148 (MQ=255) cctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACctgc > 5:259302/1‑56 (MQ=255) cctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACctgc < 6:259302/56‑1 (MQ=255) cctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGCCAtg > 4:124695/1‑149 (MQ=255) cctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGCCAtg > 8:7040/1‑149 (MQ=255) ctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGTTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCa > 2:158917/1‑127 (MQ=255) ctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGTTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCa < 1:158917/127‑1 (MQ=255) ctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGcc > 3:63167/1‑145 (MQ=255) ctcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGcc < 4:63167/145‑1 (MQ=255) tcg‑acGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGCCAtggc > 1:269162/1‑149 (MQ=255) acgaGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGCCAtggctgg < 5:264578/149‑1 (MQ=255) | CTGTGGCAATTGTTCAAAGGCATCGACTCGCCCTACAAATCGCTGCTCAAACTGCTGCTAACCGAAGCCTACGCCAGCGAACACCCTGCGGTGCGCTGCCTGAGCCTGGACTACAAGCAGGCAGTGTTTGCCAACCAGCTCGACCTCG‑ACGAGCTGGACCCCTACGTGATGGTCTACCGGCGCATCGAACGTTACCTGCTGCAACGCGGCGAAACCGCGCGCCTGGAGCTGGTAAGACGCAGCCTGTACCTGAAGGTGAACAAGAAGCTCAGCGACCAGGGCCGCAGCCATGGCTGG > NC_002947/5957383‑5957679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |